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【中文期刊】 杨纪青 袁磊 等 《基因组学与应用生物学》 2010年29卷6期 1064-1071页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本文利用自编计算机程序提取并展示马铃薯X病毒完整基因组(NC_011620.1)上微卫星分布特性.借助MATLAB软件和借用最优完全子图算法,分析NCBI数据库中该基因组(NC_011620.1)微卫星分布特性.结果表明,计算出所有各种N-...
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【中文期刊】 王欣 马莹 等 《中国水稻科学》 2019年33卷4期 331-337页
【摘要】 [目的]在亲本一般配合力的基础上优选特殊配合力高的杂交种,是水稻杂种育种的关键.基因组选择基于覆盖全基因组的分子标记和样本的表型数据建立预测模型,实现对品种更加可靠的选择.[方法]本研究利用一组基于不完全双列杂交(NCII设计)的水稻数据集...
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【中文期刊】 高复云 李雅颖 等 《应用生态学报》 2020年31卷8期 2831-2840页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 硝化作用是氮素循环的核心环节,一直是土壤生物化学研究的热点之一.2015年,完全氨氧化菌(Comammox)的发现颠覆了两步硝化的传统观点,丰富了土壤氮素循环的理论体系.完全氨氧化菌能够独立执行整个硝化过程,具有将氨直接氧化成硝酸盐的能力....
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【中文期刊】 谢俊 胡智强 《基因组学与应用生物学》 2015年34卷7期 1457-1460页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 很多分类软件在序列分类时,只能使用完全测序的微生物基因组序列作为参考库.然而,很多微生物没有完整的基因组数据,只有部分测序的数据.本研究旨在探究这些未完全测序的数据对微生物的分类有什么样的影响.本实验从NCBI上下载了细菌的完全测序的基因组...
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【中文期刊】 陈颖皓 范晓博 等 《临床检验杂志》 2012年30卷4期 263-265页ISTICCA
【摘要】 目的 对1例完全性腺发育不良患者进行分子遗传学研究并寻找致病原因.方法 对患者的SRY( sex-determining region Y)基因进行PCR和荧光原位杂交检测并进行DHH(desert hedgehog)基因测序,对患者进行全...
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【学位论文】 作者:陈小苏导师:喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学(硕士) 2011年
【摘要】 本文首先介绍无序列比对亲缘分析方法中常用的距离和非相似度,并讨论了它们是否是严格数学意义下的距离。本文发现有很多虽然被称之为距离,但是实际上并不是数学意义下的距离。接着对随机背景下的无序列比对亲缘分析方法中提出使用三种新的非相似度。在动力学...
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【学位论文】 作者:战晓文导师:喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学(硕士) 2010年
【摘要】
大多数基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的距离方法中存在一个不足之处,就是这些距离在数学意义下并不是严格的距离。
本文首先介绍基于完全基因组的四种建树的字符串距离方法,这些距离基于原始的基因组序列得到的字,并不需要进行序列比...
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【学位论文】 作者:李小春导师:喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学(硕士) 2007年
【摘要】
对生物信息学家和计算生物学家来说,精确的预测基因组中的基因一直是项很有挑战性的任务。因此,发现编码序列和非编码序列中有明显的尺度联系的存在性会给弄清DNA序列带来新的前景,这就促使我们去寻找新的方法来描叙和区分编码和非编码序列。
...
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【学位论文】 作者:毛志导师:喻祖国 湘潭大学 数学 应用数学(硕士) 2007年
【摘要】 本文系统地提出了一种用于完全基因组上基于序列互信息的距离在构建脊椎动物进化史中的应用。传统的序列距离要求进行序列比对,而在整个基因进化史中,诸如重排列的事件破坏了全长比对。并且,目前还没有用于完全基因组进化研究的统计模型。因此,现有的工具和...
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【中文期刊】 黄丽红 荀鹏程 等 《中国卫生统计》 2006年23卷4期 315-318页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探讨系统发育在SARS病毒分类中的应用.方法 系统发育分析是通过构建系统树来评价物种或分子之间进化关系的一种方法 .本文采用目前比较成熟、应用较为广泛的系统发育分析软件PHYLIP,根据GenBank中14个冠状病毒、17个SARS病...
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