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【中文期刊】 李伟 朱明玉  等 《世界科学技术-中医药现代化》 2025年27卷1期 36-55页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 使用混合组装技术对采集的5种黄精属植物叶绿体基因组进行组装,利用比较基因组方法分析其种内及种间差异,探究其密码子使用模式及影响因素,并解析黄精属的系统发育关系.方法 本研究使用Unicycler软件混合组装5种黄精属植物的叶绿体基因组...

【关键词】 黄精属； 叶绿体基因组； 混合组装；

【中文期刊】 修志莹 赵艳玲  等 《广西植物》 2024年44卷9期 1755-1771页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 牡荆属(Vitex L.)广布于热带和亚热带地区,多为乔木或灌木,包含众多具有药用价值、观赏价值和生态价值的植物.为了解牡荆属的叶绿体基因组特征、系统位置及种间关系,该研究从头组装、注释获得穗花牡荆(V.agnus-castus)的叶绿体基...

【关键词】 牡荆属； 叶绿体基因组； 密码子偏好性；

【中文期刊】 柯清林 上官宏斌  等 《微生物学杂志》 2024年44卷6期 78-84页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)BP39是一株具有广谱杀菌性能的生防菌.为探讨菌株BP39基因组密码子的偏好性,本研究基于菌株BP39的6356条编码序列,利用CodonW软件,计算其GC含量、有效密码子数(E...

【关键词】 淡紫灰链霉菌； 基因组； 密码子偏好性；

【中文期刊】 黄琼林 谭靖怡  等 《福建农林大学学报（自然科学版）》 2024年53卷3期 323-331页

【摘要】 [目的]阐明药食两用植物五指毛桃的叶绿体基因组结构及其系统进化关系,为其资源利用和产品开发等研究提供基因组信息.[方法]采用高通量测序技术对五指毛桃叶绿体基因组测序,并借助生物信息工具和软件进行序列拼接、注释、比对和系统进化分析.[结果]五...

【关键词】 五指毛桃； 叶绿体基因组； 密码子偏好性；

【中文期刊】 戴开宇 杨治风  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 11-22页

【摘要】 [目的]探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素.[方法]综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使...

【关键词】 TLR5基因； 密码子使用偏好性； 碱基突变；

【中文期刊】 韩霜 余静雅  等 《西北植物学报》 2023年43卷10期 1629-1639页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 喉毛花属植物是藏茵陈入药基原植物之一,其属下物种关系一直存在争议.为建立稳定的喉毛花属下系统发育关系,本研究为重建喉毛花属下系统发育关系,通过对皱边喉毛花及其4个近缘种进行Illumina二代测序,共获得12个叶绿体基因组,并分析其结构特征...

【关键词】 喉毛花属； 叶绿体基因组； 密码子偏好性；

【中文期刊】 李子菲 苏应娟  等 《热带亚热带植物学报》 2023年31卷4期 541-548页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 ycf94基因是近年来在叶绿体基因组中新发现的一个基因,在蕨类植物中表现高度保守.该研究共选取94种蕨类植物,在系统发育背景下,对ycf94基因的结构特征、密码子偏好性、进化速率和适应性进化进行分析.结果表明,ycf94基因的密码子偏好性较...

【关键词】 蕨类植物； ycf94； 密码子偏好性；

【中文期刊】 毛积鹏 黄林旺  等 《生物学杂志》 2022年39卷2期 23-28页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为了解DXS基因的系统发育、密码子偏好性和分子进化等特性,选取44个代表性物种的DXS基因序列进行分析.结果表明:DXS基因家族具有较高的保守性,序列间的平均遗传距离为0.243;DXS基因的分化时间先于对应的物种分化,DXS基因树和对应物...

【关键词】 DXS基因； 系统发育分析； 密码子偏好性；

【中文期刊】 夏铭泽 张发起  等 《植物研究》 2022年42卷4期 626-636页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 叶绿体基因组序列变异和基因组成等特征可有效反映植物类群间的系统发育和进化关系.本研究利用Illumina高通量测序平台对梅花草属(Parnassia)及其近缘属5种植物的叶绿体基因组进行测序和组装,同时基于已发表的近缘种叶绿体基因组信息,对...

【关键词】 梅花草属； 叶绿体基因组； 密码子偏好性；

【中文期刊】 张扬 孙曙光  等 《河南农业科学》 2022年51卷10期 114-124页

【摘要】 为了分析栽培莴苣Lactuca sativa'Salinas'和野生莴苣Lactuca saligna的线粒体基因组密码子使用特征差异,对2种莴苣的线粒体基因组编码序列进行密码子使用偏好性研究,比较其密码子偏好性形成的影响因素和演化过程.结...

【关键词】 莴苣； 线粒体基因组； 密码子偏好性；