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【中文期刊】 张晶晶 袁庆 等 《中草药》 2024年55卷9期 3085-3097页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 揭示忍冬属囊管组16种植物叶绿体基因组特征及系统发育关系.方法 以16种囊管组植物为研究材料,利用CodonW、EMBOSS、Excel等软件分析其叶绿体基因组密码子使用偏好性;利用IRscope、mVISTA、DNAsp进行叶绿体基...
【中文期刊】 余鑫莲 李新 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷5期 788-802页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 野生六棱大麦(Hordeum agriocrithon)广泛分布在青藏高原上,被认为是六棱栽培大麦的野生祖先.为揭示野生六棱大麦叶绿体基因组(chloroplast DNA,cpDNA)结构特征和系统发育关系,利用Illumina Hise...
【中文期刊】 房振西 季倩 等 《药学学报》 2024年59卷5期 1484-1493页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 白鼠尾草(Salvia apiana Jepson)是唇形科鼠尾草属多年生亚灌木植物,具有悠久的药用历史.本研究采用PacBio HiFi三代测序技术对白鼠尾草叶绿体基因组进行了测序,完成了物理图谱绘制,对其基因组序列结构特征、密码子偏好性...
【中文期刊】 徐荣 宋文政 等 《中草药》 2024年55卷20期 7093-7100页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 分析药用植物富民枳Poncirus polyandra叶绿体基因组蛋白编码基因密码子使用模式及影响因素.方法 以富民枳叶绿体基因组53个蛋白编码基因为材料,利用CodonW软件、CUSP在线程序和R语言等整理并分析基因密码子使用偏性参...
【中文期刊】 代国娜 尚明越 等 《中草药》 2024年55卷11期 3835-3844页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究百合属Lilium药用植物叶绿体基因组密码子使用偏性及影响因素,为百合属药用植物育种提供理论参考.方法 使用CodonW1.4.2、CUSP、SPSS等软件分析9种百合属药用植物的密码子偏好性.结果 9种百合属植物密码子不同位点的...
【中文期刊】 龚秋怡 董姝洁 等 《中草药》 2024年55卷12期 4150-4158页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 以牛茄子Solanum capsicoides新鲜叶片为材料,对叶绿体基因组序列进行组装、注释和分析,探究牛茄子的序列特征和同属其他物种的系统发育关系.方法 基于Illumina HiSeq高通量测序,获得牛茄子完整叶绿体基因组序列,...