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【中文期刊】 刘华 岳万远 等 《华西口腔医学杂志》 2024年42卷3期 319-328页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究舌黏膜癌变过程中基因组甲基化特征,探讨舌癌中DNA甲基化的规律.方法 用50 mg/L的4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水诱导C57BL/6J小鼠舌黏膜癌变,分别取第0、12、28周的舌黏膜(分别代表正常、癌前病变和癌变)进...
【中文期刊】 令狐熙涛 桂佳琦 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷36期 5811-5816页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:m6A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚.目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m6A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制.方法:在GEO数据库中检索并下载与...
【中文期刊】 原天祎 刘洪江 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷14期 2159-2165页 ISTICPKUCA
【摘要】 背景:已知m6A参与了多种疾病的发生与发展,研究推测其也参与了激素性股骨头坏死的病理改变,但m6A甲基化修饰在激素性股骨头坏死中的研究比较匮乏.目的:通过生物信息学的方法寻找m6A相关基因在激素性股骨头坏死中的差异性表达,并预测与其相关的m...
【中文期刊】 罗焱瑞 赵倩 《天津医科大学学报》 2024年30卷3期 205-211,254页 ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学方法整合肝癌转录组和甲基化组数据,利用Lasso回归分析筛选肝癌特异性标志物,并构建肿瘤预测模型.方法:在GEO(gene expression omnibus)中下载GSE70091、GSE77314数据集,共53例肝...
【中文期刊】 王晶 董辉 等 《生物信息学》 2024年22卷3期 183-191页 ISTIC
【摘要】 采用生物信息学方法,通过公共数据库,分析系统性红斑狼疮(SLE)N6-甲基腺苷(m6A)修饰谱系.基于公共数据建立SLE m6A传修饰表达谱,分析m6A相关的DEGs在SLE中的潜在作用;利用ADEx数据库获取DEGs,利用m6A GEO数...
【中文期刊】 刘华 岳万远 等 《昆明医科大学学报》 2024年45卷7期 23-29页 ISTICCA
【摘要】 目的 了解舌粘膜癌变中基因体甲基化的差异表达基因.方法 用浓度 50 mg/L的 4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)诱导C57BL/6 小鼠舌癌.基因芯片和甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq)检测0 周、12 周、28 周(代表...
【中文期刊】 刘菲 袁锐 等 《中国免疫学杂志》 2022年38卷18期 2252-2258页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探索4种消化系统癌症(DSCs)分子特征的异同及分子特征同临床基本特征的关系.方法:基于生物信息学方法从TCGA数据库中获取食管癌(ESCA)、胃癌(STAD)、直肠癌(READ)、结肠癌(COAD)4种DSCs的分子特征,包括基因突...
【中文期刊】 靳兰杰 霍浩楠 等 《河北农业大学学报》 2023年46卷3期 91-96,129页
【摘要】 为鉴定牛DSCAM基因的印记状态以及DNA甲基化修饰在调控印记表达中的作用,本研究以牛胎盘和成年牛组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪和大脑)为试验材料,利用基于单核苷酸多态(SNP)的RT-PCR直接测序法分析DSCAM基因的印记状态,采...
【中文期刊】 钟舒红 盛兆安 等 《中国预防兽医学报》 2023年45卷3期 253-263页
【摘要】 为探究感染大片形吸虫后不同时间水牛脊髓全基因组DNA甲基化的类型、占比及其感染后差异甲基化区域(DMR)涉及的功能及信号通路,本研究将大片形吸虫囊蚴经口灌胃感染8~10月龄水牛,分别于感染后3d(J01)、10d(J02)、28 d(J03...
【中文期刊】 徐丽秀 李金秋 等 《山西医科大学学报》 2022年53卷1期 44-50页 ISTICCA
【摘要】 目的 初步筛选与宫颈鳞状细胞癌和食管鳞状细胞癌发生相关的差异甲基化标志物.方法 采用Illumina Infinium HumanMethylation450 Bead Chips(甲基化450k芯片)技术分别检测并分析8例宫颈鳞状细胞癌和...