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【学位论文】 作者：张莉莉 导师：叶令 周林祥 复旦大学 物理学 凝聚态物理（硕士） 2004年
【摘要】 利用并行分子动力学的计算机模拟和蛋白质分子全电子结构计算,来研究蛋白质分子的结构、动力学性质和生物活性.这里,主要包括了以下两个方面的工作:1.对肌红蛋白和铜锌超氧化歧化酶进行分子动力学模拟.通过对方均位移以及一系列自由能非线性指标的分析,...
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【学位论文】 作者：聂晓娜 导师：刘青昆 辽宁师范大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（硕士） 2009年
【摘要】 近年来随着计算机技术的飞速发展，分子动力学模拟已经成为生物大分子理论研究的一种十分重要的工具，大量用于研究生物分子及其复合体的结构、动力学和热力学过程。对于大分子体系而言电荷分布在很大程度上影响着模拟的结果，发展一种计算量较小且有较高精度的...
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【学位论文】 作者：朱涛 导师：马丁 华中科技大学 临床医学 妇科肿瘤（博士） 2006年
【摘要】 目的：研究并行计算集群的构建策略和实现方法，生物信息学并行软件的配置和安装以及在生物信息学方面的应用。并且探讨并行计算集群的性能，在加快生物信息学研究方面的意义。 结论：我们已经实现并行生物计算集群的构建，其计算性能达到了超线性加...
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【学位论文】 作者：张建华 导师：叶令 周林祥 复旦大学 物理学 凝聚态物理（硕士） 2004年
【摘要】 我们采用并行计算的分子动力学研究了蛋白质的热稳定性,利用蛋白质敲除的技术研究了局部的结构对蛋白质整体结构的热稳定性的影响,另外还通过全电子结构计算来研究蛋白质分子的前线轨道和蛋白质活性和热稳定性的联系.我们的研究工作主要包括三个方面的内容:...
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【中文期刊】 李霞 张树芝 等 《核技术》 2012年35卷4期 297-300页
【摘要】 研究了使用图形处理器(GPU)对调强放射治疗计划系统(IMRT)中分子动力学优化方法的加速方法及效果.利用统一计算设备构架(CUDA)平台,分别对4个临床肿瘤调强病例的笔束剂量响应矩阵的乘积运算进行GPU并行优化加速.比较和分析GPU并行加...
【关键词】 图形处理器(GPU)；统一计算设备构架(CUDA)；调强放射治疗(IMRT)；
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