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          【中文期刊】 陆翼  葛成  等 《现代计算机》 2023年29卷4期 18-24,48页

          【摘要】 从头测序技术是应用于蛋白质组学的测序方法.与其他测序技术相比,从头测序技术的优势是在不依赖数据库搜索和无需PCR扩增的基础上对DNA或者蛋白质进行测序.目前,从头测序技术也广泛应用于蛋白质组学领域.研究人员为了将测序技术所得的短序列read...

          【关键词】 从头测序序列组装算法de Bruijn图

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          【学位论文】 作者:史文聿 导师:赵方庆   中国科学院大学   基础医学 遗传学(博士) 2017年

          【摘要】 基因组拼接(genome assembly)作为基因组学研究的核心技术,一直是测序数据分析中的重点和难点。它包含两部分:将测序短读段拼接成重叠群(contig)和基于连接信息把重叠群进一步组装成基因组骨架(scaffold)。针对高通量测序...

          【关键词】 基因组拼接组装算法

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          【学位论文】 作者:林敏 导师:宁正元   福建农林大学   生物学 生物学;生物信息科学与技术(硕士) 2011年

          【摘要】 新一代测序技术产生的序列片段普遍在35bp~75bp且数据量巨大,原来的序列比对和组装软件不适合这么短的序列,这就给序列比对和序列组装提出了新的挑战。本文主要探讨了新一代测序技术中的短序列比对和短序列组装算法。主要工作如下:
             ...

          【关键词】 序列比对组装算法

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          【中文期刊】 高胜寒  禹海英  等 《遗传》 2018年40卷11期 944-963页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

          【摘要】 复杂基因组指的是无法使用常规测序和组装手段直接解析的一类基因组,通常指包含高比例重复序列、高杂合度、极端GC含量、存在难消除异源DNA污染的基因组.为了解决复杂基因组的测序和组装问题,需要分别从基因组测序实验方法、测序技术平台、组装算法与策...

          【关键词】 复杂基因组基因组组装基因组测序技术

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          【中文期刊】 黄勇  范航  等 《生物技术通讯》 2013年6期 819-821页ISTICCA

          【摘要】 目的:研究和开发高通量测序全基因组组装过程中的填补gap的方法。方法:研究组装软件的算法,使用Perl语言编写自动填补gap的程序,并建立全基因组组装的流程。结果:提出了填补gap的末端延伸法,并使用Perl语言进行了编程;在对立克次体高通...

          【关键词】 测序组装gap填补

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