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            【中文期刊】 曹文君 侯国强  等 《中国卫生统计》 2013年30卷4期 484-486页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 从统计理论角度探讨基因集分析方法,初步建立微阵列数据基因集统计分析理论框架.方法 采用计算机模拟技术,比较不同原假设、理论分布生成方法在进行基因集分析时的统计学性质.结果 自限性原假设方法ROC曲线下面积AUC为0.858.而竞争性原...

            【关键词】 阵列数据基因集方法统计理论

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            【中文期刊】 陈金瓯 柳青  《中国卫生统计》 2012年29卷4期 525-528,534页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 探讨旋转森林算法在DNA微阵列数据分类中的应用.方法 通过对四个经典基因表达数据的分析考察旋转森林的分类效果,并与其他分类器进行比较,进一步调整算法参数并研究其对分类效果产生的影响.结果 旋转森林对基因表达数据有较高且稳定的分类准确性...

            【关键词】 旋转森林DNA阵列数据集成分类系统

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            【中文期刊】 荀鹏程 钱国华  等 《中国卫生统计》 2012年29卷5期 626-629页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 探讨高维生物学数据的多阶段组合降维策略.方法 以微阵列数据的判别分析为例,采用实际数据和模拟数据相结合的方法,提出“初步选维→进一步降维”的两阶段组合降维策略,并与后续的“判别→验证”相结合,形成了“选维→降维→判别→验证”的判别分析...

            【关键词】 两阶段组合降维偏最小二乘切片逆回归

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            【中文期刊】 王婷 曾平  等 《郑州大学学报(医学版)》 2012年47卷5期 636-639页 ISTICPKUCA

            【摘要】 目的:研究大规模数据中的密度、无效分布和错误发现率的经验贝叶斯估计和应用.方法:对2个微阵列数据的贝叶斯模型,采用Poisson回归方法估计密度函数,并在此基础上经验估计贝叶斯错误发现率和局部错误发现率.结果:基于Poisson回归方法的密...

            【关键词】 阵列数据错误发现率经验贝叶斯

            浏览:200 被引:3 下载:1
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            【中文期刊】 王婷 曾平  等 《重庆医科大学学报》 2011年36卷12期 1445-1448页 ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:介绍多重假设检验中的错误发现率控制和在此基础上发展起来的q值和局部错误发现率.方法:将Benjamini和Hochberg(BH)控制程序、q值和局部错误发现率应用于一个前列腺癌微阵列数据的基因差别表达分析,控制和估计错误发现率.结果...

            【关键词】 阵列数据多重假设检验错误发现率

            浏览:292 被引:7 下载:24
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            【中文期刊】 荀鹏程 钱国华  等 《中国卫生统计》 2009年26卷2期 147-149,153页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 探究判别分析驱动的微阵列数据之降维策略.方法 3步降维策略.即首先采用"单变量检验FDR控制"结合"相关矩阵差值综合评分法"的预选维;其次采用PCA、PLS等方法作进一步降维;最后用逐步判别的思想筛选.结果 以Alon等的结肠癌数据为...

            【关键词】 降维策略判别分析阵列数据

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            【中文期刊】 饶妮妮 匡斌  等 《中国生物医学工程学报》 2008年27卷2期 255-259,264页 ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 用主成分分析(PCA)方法处理基因表达微阵列数据能够实现基因选择、基因表达模式提取、基因分类等,有其独特的优点.然而,PCA方法却存在容易丢失重要信息的弱点.为了克服这一方法的弱点,提出分块PCA,并以此为基础形成一种提取细胞周期调控基因的...

            【关键词】 主成分分析(PCA)分块PCA阵列数据

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            【中文期刊】 钱国华 荀鹏程  等 《中国卫生统计》 2007年24卷2期 120-123页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 探讨微阵列数据的判别分析方法 .方法 首先采用偏最小二乘法对高维数据降维,然后再用Fisher's线性判别.文中同时介绍了偏最小二乘法的基本原理、基本算法,讨论了成分数选择等问题,并以实际微阵列数据展示了其效果.结果 偏最小二乘法降维...

            【关键词】 偏最小二乘法阵列数据降维

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            【中文期刊】 王璐 荀鹏程  等 《中国卫生统计》 2007年24卷4期 375-377页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 探究差异表达驱动的微阵列数据之降维策略.方法 本文提出permutation检验和99.99%的下单侧可信区间相结合的策略用于"维度粗筛",Hotelling T2检验结合逐步筛选的策略用于寻求组间差异表达的"局部变量组合".结果 以...

            【关键词】 降维策略差异表达阵列数据

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            【中文期刊】 荀鹏程 赵杨  等 《中国卫生统计》 2006年23卷1期 5-8页 ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的介绍阳性结果错误率(FDR)及相关控制方法在微阵列数据多重比较中的应用.方法用BH、BL、BY和ALSU四种FDR控制程序比较了3 226个基因在两组乳腺癌患者中的表达差异.结果四个程序在各自实用的范围内均将FDR控制在0.05以下,检...

            【关键词】 多重比较阳性结果错误率总Ⅰ型错误率

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