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【中文期刊】 王文杰 李康  等 《中国卫生统计》 2024年41卷4期 501-506页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster,SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence,scRNA-...

【关键词】 深度堆叠降噪自编码嵌套聚类； 单细胞测序； 批次效应；

【中文期刊】 周创辉 周建伟  等 《分子影像学杂志》 2024年47卷9期 928-935页

【摘要】 目的 评估健康肝脏影像组学特征在多种CT扫描仪中的一致性,并探究基于图像和基于特征的协调方法对结果的影响.方法 回顾性收集2015年1月1日～2023年1月1日赣州市人民医院4台CT设备的243例健康成年人的腹部CT检查结果(Optima ...

【关键词】 CT； 批次效应； 影像组学；

【中文期刊】 李小刚 高正  等 《生物信息学》 2023年21卷3期 155-160页 ISTIC

【摘要】 单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing,ScRNA seq)是一种变革性的生物技术,以前所未有的高分辨率来解析组织复杂性,解决了普通转录组测序(Bulk RNA sequencing)无法回答的问题.但单细胞...

【关键词】 单细胞测序； 批次效应； 评测；

【中文期刊】 刘淏晟 张博文  《北京师范大学学报（自然科学版）》 2023年59卷4期 564-574页

【摘要】 随着测序数据的持续积累和单细胞转录组测序的广泛应用,超大规模转录组数据集的整合,为后基因组时代提供了新的机遇和挑战.其中,不同数据集具备的时空异质性和测序平台带来的系统误差导致的批次效应,对转录组分析的有效性产生了极大影响,干扰了真实的生物...

【关键词】 转录组分析； 批次效应； 批次效应矫正；

【中文期刊】 谭起龙 邓魁  等 《中国卫生统计》 2020年37卷5期 667-671页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 通过随机森林回归(random forest,RF)方法提取不同批次间质控(quality control,QC)样本数据的批次特征,从而移除代谢组研究样本数据的批次效应,提高统计分析方法的分类识别能力.方法 利用心血管疾病的代谢组质...

【关键词】 代谢组学； 质谱数据； 批次效应；

【中文期刊】 张震 朱双  等 《黑龙江八一农垦大学学报》 2016年28卷3期 36-42页

【摘要】 为探讨饲料中精饲料和粗饲料间的组合效应,利用多项指标综合指数(MFAEI),应用体外批次培养法测定产气量、pH值、氨态氮浓度、干物质和有机物质及中性洗涤纤维的消失率,研究单一粗饲料与相同精料间的组合效应.结果表明,不同粗饲料与相同精料之间均...

【关键词】 体外批次培养法； 组合效应； 粗饲料；

【中文期刊】 姚晨 李红东  等 《数理医药学杂志》 2011年24卷2期 142-144页 CA

【摘要】 DNA甲基化芯片已广泛应用于癌症研究.但是有研究表明批次效应对基于高通量数据的研究有很大影响.癌症基因组计划 (TCGA)数据库包含大量的不同批次的高通量甲基化数据.通过分析TCGA中7种癌症的数据,发现批次效应在各种类型的癌症数据中都广泛...

【关键词】 TCGA； 批次效应； 甲基化芯片；

【中文期刊】 林泳煌 刘兴华  等 《中国妇幼保健》 2022年37卷19期 3629-3634页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨不明原因的复发性流产(RSA)患者的基因表达谱的异质性,确定亚组子宫内膜生物学过程的区别.方法 从GEO数据库中获取GSE165004和GSE26787基因表达序列,应用ComBat方法去除批次效应后,应用Consensus Cl...

【关键词】 复发性流产； 亚组分析； 批次效应；

【中文期刊】 陈燕花 郑宝童  等 《生物医学工程学杂志》 2017年34卷1期 129-133页 MEDLINEISTICPKUCA

【关键词】 标志； 分类器； 肺癌；

【学位论文】 作者： 杨博 导师：靳水林  哈尔滨工业大学  统计学 应用统计（硕士） 2023年

【摘要】 单细胞RNA测序数据研究因为实验数据量的限制，通常需要整合多个数据集进行分析，然而，因为实验批次、实验环境等的系统差异，数据集之间可能存在批次效应，直接整合不同批次的数据集可能产生技术差异掩盖生物差异的问题，从而影响下游分析，得出错误的生物...

【关键词】 单细胞RNA测序； 数据整合；