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【中文期刊】 刘玲杰 林孟宣 等 《临床口腔医学杂志》 2025年41卷2期 95-100页 ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学分析及实验验证与牙周炎相关的昼夜节律枢纽基因,探究昼夜节律相关基因在牙周炎发生发展中的作用.方法:利用R软件筛选牙周炎的差异表达昼夜节律相关基因并进行富集分析,以寻找关键通路和基因,并通过临床收集牙周炎和健康患者唾液样本...
【关键词】 牙周炎; 昼夜节律; 加权基因共表达网络分析(WGCNA);
【中文期刊】 卢星杉 何纱虹 等 《免疫学杂志》 2024年40卷3期 250-258页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 急性肾损伤(AKI)是一种可逆但可能危及生命的状况,可由多种基因改变引起.本实验旨在探讨AKI免疫组分中调控炎症性细胞死亡(PANoptosis)的关键基因.方法 本研究使用来自NCBI基因表达组织公共数据库的单核RNA测序数据,分析...
【中文期刊】 左旭 李津 《天津医科大学学报》 2023年29卷3期 243-251页 ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学方法识别系统性红斑狼疮(SLE)疾病进展中与先天免疫细胞相关的的关键基因.方法:在GEO数据库中下载了GSE50772、GSE81622、GSE99967 数据集的表达谱,并对其进行整合.应用CIBERSORT工具对疾病...
【关键词】 系统性红斑狼疮; 加权基因共表达网络分析; 先天免疫细胞;
【中文期刊】 窦承贤 郭菲 等 《天津师范大学学报(自然科学版)》 2023年43卷5期 8-14,43页
【摘要】 为了筛选出潜在的肝癌检测标志物,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus database,GEO)中选择GSE14520、GSE36376、GSE25097数据集,筛选出公共差异表达基因,利用DAVID平台进行富集...
【中文期刊】 龚道星 《医学信息》 2023年36卷7期 9-16页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法探究A型急性主动脉夹层(AAAD)的病理机制、关键靶点以及诊断生物标志物.方法 GEO数据库下载GSE52093数据集,基于差异分析和WGCNA算法,构建基因共表达模块,对关键模块基因进行功能富集分析及PPI网络分析...
【关键词】 A型急性主动脉夹层; 枢纽基因; 加权基因共表达网络分析;
【中文期刊】 罗东阳 毕国善 等 《吉林医学》 2023年44卷4期 859-869页 CA
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析方法筛选参与腹主动脉瘤(AAA)免疫反应机制的关键基因.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载人AAA组织基因芯片数据集(GSE7084),其中包含10个正常主动脉样本和9...
【关键词】 腹主动脉瘤; 加权基因共表达网络分析; 免疫浸润;
【中文期刊】 薛继国 刘静 等 《南方医科大学学报》 2021年41卷12期 1752-1762页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释.方法 从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以...
【关键词】 阿尔茨海默病; 加权基因共表达网络分析; 枢纽基因;
【中文期刊】 王高洁 卢芳 等 《现代肿瘤医学》 2022年30卷13期 2342-2346页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨甲状腺乳头状癌的潜在发病机制、治疗靶点及预后生物标志物.方法:使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)基于来自Gene Expression...
【中文期刊】 刘馨璥 范苗苗 等 《牡丹江医学院学报》 2022年43卷3期 60-63,84页
【摘要】 目的 筛选并分析乳腺癌的标志性枢纽基因.方法 从GEO数据库下载3个乳腺癌基因表达数据集,筛选乳腺癌中的差异表达基因,venn图取交集;Cytoscape构建PPI网络,获取TOP10枢纽基因;GO功能分析和KEGG通路分析枢纽基因的功能和...
【中文期刊】 刘鑫 朱浩彦 等 《武汉大学学报(医学版)》 2025年46卷1期 27-35页 ISTICCABP
【摘要】 目的:研究实验性自身免疫性心肌炎(EAM)的分子机制,确定EAM的新生物标记物和靶点,为心肌炎的诊断和治疗提供新的见解.方法:通过差异表达分析GEO数据库中EAM相关数据集GSE155423,筛选出差异表达基因(DEGs).利用STRING...
【关键词】 实验性自身免疫性心肌炎; 枢纽基因; 生物标志物;