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【中文期刊】 刘玲杰 林孟宣 等 《临床口腔医学杂志》 2025年41卷2期 95-100页ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学分析及实验验证与牙周炎相关的昼夜节律枢纽基因,探究昼夜节律相关基因在牙周炎发生发展中的作用.方法:利用R软件筛选牙周炎的差异表达昼夜节律相关基因并进行富集分析,以寻找关键通路和基因,并通过临床收集牙周炎和健康患者唾液样本...
【关键词】 牙周炎;昼夜节律;加权基因共表达网络分析(WGCNA);
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【中文期刊】 李晓松 黄霄 等 《医学信息》 2025年38卷9期 1-7页
【摘要】 目的 利用生物信息分析方法筛选与阿尔兹海默病相关的线粒体枢纽基因,并分析其功能.方法 从美国国立生物技术信息中心GEO数据库中下载阿尔兹海默病基因芯片数据集,通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析筛选出阿尔兹海默病的枢纽基因,在MitoC...
- 概要:
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【中文期刊】 卢星杉 何纱虹 等 《免疫学杂志》 2024年40卷3期 250-258页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 急性肾损伤(AKI)是一种可逆但可能危及生命的状况,可由多种基因改变引起.本实验旨在探讨AKI免疫组分中调控炎症性细胞死亡(PANoptosis)的关键基因.方法 本研究使用来自NCBI基因表达组织公共数据库的单核RNA测序数据,分析...
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【中文期刊】 左旭 李津 《天津医科大学学报》 2023年29卷3期 243-251页ISTIC
【摘要】 目的:通过生物信息学方法识别系统性红斑狼疮(SLE)疾病进展中与先天免疫细胞相关的的关键基因.方法:在GEO数据库中下载了GSE50772、GSE81622、GSE99967 数据集的表达谱,并对其进行整合.应用CIBERSORT工具对疾病...
【关键词】 系统性红斑狼疮;加权基因共表达网络分析;先天免疫细胞;
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【中文期刊】 王玉明 邵可 等 《南京医科大学学报(自然科学版)》 2022年42卷12期 1673-1680页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:通过生物信息学的方法挖掘基因综合表达数据库(GEO)中影响胆管癌(cholangiocarcinoma,CCA)发生发展的核心基因,并分析其生物学功能,为CCA的诊断、治疗和评估预后提供理论依据.方法:分析来自GEO数据库中的3个微阵...
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【中文期刊】 窦承贤 郭菲 等 《天津师范大学学报(自然科学版)》 2023年43卷5期 8-14,43页
【摘要】 为了筛选出潜在的肝癌检测标志物,从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus database,GEO)中选择GSE14520、GSE36376、GSE25097数据集,筛选出公共差异表达基因,利用DAVID平台进行富集...
- 概要:
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【中文期刊】 龚道星 《医学信息》 2023年36卷7期 9-16页
【摘要】 目的 利用生物信息学方法探究A型急性主动脉夹层(AAAD)的病理机制、关键靶点以及诊断生物标志物.方法 GEO数据库下载GSE52093数据集,基于差异分析和WGCNA算法,构建基因共表达模块,对关键模块基因进行功能富集分析及PPI网络分析...
【关键词】 A型急性主动脉夹层;枢纽基因;加权基因共表达网络分析;
- 概要:
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【中文期刊】 罗东阳 毕国善 等 《吉林医学》 2023年44卷4期 859-869页CA
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析方法筛选参与腹主动脉瘤(AAA)免疫反应机制的关键基因.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载人AAA组织基因芯片数据集(GSE7084),其中包含10个正常主动脉样本和9...
【关键词】 腹主动脉瘤;加权基因共表达网络分析;免疫浸润;
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【中文期刊】 薛继国 刘静 等 《南方医科大学学报》 2021年41卷12期 1752-1762页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探索阿尔茨海默病(AD)相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释.方法 从GEO数据库下载转录组测序数据,根据基因的相关性,当关联系数阈值设定为0.85时,参数β=8,以...
【关键词】 阿尔茨海默病;加权基因共表达网络分析;枢纽基因;
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【中文期刊】 王高洁 卢芳 等 《现代肿瘤医学》 2022年30卷13期 2342-2346页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨甲状腺乳头状癌的潜在发病机制、治疗靶点及预后生物标志物.方法:使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)基于来自Gene Expression...
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