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【中文期刊】 韩明盛 麻慧慈  等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷2期 170-176页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:运用生物信息学方法筛选与乳腺癌发生发展有关的差异表达基因,并对其进行相关生物学分析以获得乳腺癌相关分子标志物.方法:从GEO数据库中寻找出3个乳腺癌相关芯片数据集,使用GEO2R筛选差异表达基因并作Venn图获取交集差异共表达基因.通...

【关键词】 乳腺癌； 基因表达数据库； 分子标志物；

【中文期刊】 连旭 孙唯秀  等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷2期 161-169页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:运用生物信息学方法筛选年轻肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者特有的关键枢纽基因(Hub gene),并探索其生物学和临床意义.方法:从GEO芯片数据集GSE45267获取年轻(确诊HCC时年龄≤4...

【关键词】 年轻； 肝细胞癌； 生物信息学分析；

【中文期刊】 王慧慧 萨建  等 《中华疾病控制杂志》 2020年24卷3期 274-278,289页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探讨急性髓系白血病(acute myelocytic leukemia,AML)不同融合基因的时间序列基因表达数据的网络差异,识别靶基因.方法 采用网络差异分析的方法,针对AML的不同融合基因相关的基因表达数据构建网络,对联合网络的全...

【关键词】 急性髓系白血病； 融合基因； 枢纽基因；

【中文期刊】 郭艳丽 梁晓亮  等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2019年26卷2期 166-172页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:采用多种生物信息学分析工具,筛选与食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)发生发展相关的枢纽基因(Hub gene),并分析其生物学功能.方法:选取GEO食管鳞状细胞癌芯片数据G...

【关键词】 食管鳞状细胞癌； 生物信息学分析； 枢纽基因；

【中文期刊】 王亮歌 施劲松  《中华内分泌代谢杂志》 2018年34卷6期 490-497页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 利用胰岛转录组数据构建共表达网络,鉴定与2型糖尿病发病相关的重基因及其作用机制.方法 从NCBI的GEO数据库中下载芯片数据GSE38642,包括2型糖尿病样本9例、糖尿病前期样本9例(6%≤HbA1C<6.5%)、正常对照样本31例...

【关键词】 糖尿病,2型； 胰岛； 转录组；

【中文期刊】 梁栋 邢永强  等 《中国生物工程杂志》 2016年36卷2期 30-37页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 作为泌尿系统常见的肿瘤之一,肾肿瘤发病率在逐年上升.针对Affymetrix hgu133b的基因芯片数据进行差异表达基因筛选,应用加权基因共表达网络分析算法构建肾肿瘤差异表达基因的共表达网络.分析肾部正常组织和肿瘤组织差异表达基因之间的关...

【关键词】 肾肿瘤； WGCNA算法； 共表达网络；

【中文期刊】 廖宝 周凤坤  等 《中华医学杂志》 2019年99卷7期 525-531页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 利用生物信息学分析颅内动脉瘤(LA)的公共数据库中的表达谱芯片数据,为疾病机制研究提供重要信息.方法 基于数据集(GSE75436)进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建其基因共表达网络,并识别枢纽基因;同时,使用在线工具DAV...

【关键词】 颅内动脉瘤； 加权基因共表达网络分析； 基因；

【中文期刊】 孙梦雨 邱洁萍  等 《中国普通外科杂志》 2019年28卷4期 433-440页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:运用生物信息学方法探讨胃癌的预测指标和治疗靶点,并分析其与预后的关系.方法:从基因表达综合(GEO)数据库下载3个微阵列数据集(GSE 13911、GSE33651、GSE79973),运用GEO2R筛选出胃癌样本与正常组织样本间的差...

【关键词】 胃肿瘤； 基因表达； 预后；

【中文期刊】 陈英 罗丽  等 《第三军医大学学报》 2019年41卷12期 1149-1155页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 筛选口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)发生淋巴转移的关键基因,并对其进行生物信息学分析及鉴定.方法 从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载OS...

【关键词】 口腔鳞状细胞癌； 淋巴转移； 差异表达基因；

【中文期刊】 杨月玲 杨婷  等 《中华血液学杂志》 2005年26卷1期 48-49页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 <篇首> 新近发现survivin基因是凋亡抑制蛋白(IAP)家族的新成员,在细胞增殖与凋亡的调控中起着重要的枢纽作用.我们采用RT-PCR方法测定survivin mRNA在慢性粒细胞白血病(CML)细胞中的表达水平并分析CML不同临床阶段的...