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【中文期刊】 龚海燕 张司臣  等 《生物医学工程学杂志》 2024年41卷3期 552-559页 MEDLINEISTICPKUCA

【摘要】 高通量染色质构象捕获(Hi-C)技术的快速发展为染色质结构分析提供了丰富的基因组位点间交互作用数据,但目前基于Hi-C数据的已有拓扑相关结构域(TAD)识别方法存在准确率低、参数敏感等问题.在此背景下,本文设计并实现了一种基于空间密度聚类的...

【关键词】 高通量染色质构象捕获； 拓扑相关结构域； 染色质结构；

【中文期刊】 刘春亚 贾炳豪  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2024年40卷10期 1441-1452页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 全反式维甲酸(ATRA)是早幼粒细胞分化的有效诱导剂,其对红系分化过程的作用尚不完全清楚.为研究ATRA在红系分化进程中的作用及其表观遗传调控机制,本文以诱导白血病细胞K562向红系分化为模型,对ATRA干扰红系分化过程的调控机制进行研究....

【关键词】 全反式维甲酸； 红系分化； 染色质构象捕获；

【中文期刊】 肖亦舒 许兰  等 《海南医学院学报》 2022年28卷24期 1841-1847页 ISTICPKU

【摘要】 目的:研究表明β-珠蛋白基因在发育过程中呈现选择表达的转换机制,其上游的基因座位点控制区(LCR)调控了β-珠蛋白基因家族的表达模式.为了深入探究β-珠蛋白基因表达调控的分子网络,本文对其他可能参与调控β-珠蛋白基因表达的远程调控元件进行筛...

【关键词】 β-珠蛋白基因； 环形染色体构象捕获； 染色质相互作用；

【中文期刊】 邱格格 林胜男  等 《生物学教学》 2021年46卷10期 4-6页 PKU

【摘要】 基因组携带着生命体完整的遗传信息.人类基因组计划和DNA元件百科全书计划分别在一维和二维水平上研究了基因组序列、基因组结构及其调控组件.但是,对于基因组信息调控基因在特定时空中表达仍然知之甚少.基因组测序技术的发展催生了一门新兴学科——三维...

【关键词】 基因组； 三维基因组学； 染色质构象捕获技术；

【中文期刊】 董芊里 王金宾  等 《遗传》 2020年42卷1期 73-86页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 染色质在细胞核内的缠绕、折叠及其在细胞核内的空间排布是真核生物染色质构型的主要特征.在经典DNA探针荧光原位杂交显微观察的基础上,基于新一代测序技术的Hi-C及ChIA-PET染色质构型捕获技术已经被广泛应用于动物及植物细胞核染色质构型的研...

【关键词】 染色质构型； 高通量染色质构象捕获测序； 末端配对标签测序；

【中文期刊】 金加 沈文龙  等 《生物技术通讯》 2020年31卷5期 542-546页 ISTICCA

【摘要】 目的:研究核内RNA与真核细胞基因组三维结构的关系,并探讨核内RNA对染色体高级结构如拓扑相关结构域(TAD)和A/B区室的影响.方法:利用全基因组染色质构象捕获(Hi-C)技术对正常GM12878细胞和经过RNase处理的GM12878细...

【关键词】 核内RNA； 全基因组染色质构象捕获(Hi-C)； 区室；

【中文期刊】 沈圣 屈彦纯  等 《遗传》 2014年36卷3期 256-275页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)的出现,极大地促进了表观遗传学的研究.将NGS技术引入表观遗传学,便形成了以NGS为基础的各种表观遗传学测序及研究方法,如:全基因组亚硫酸氢盐测序法(Whole ...

【关键词】 下一代测序技术； 表观遗传学； DNA甲基化；

【中文期刊】 谭云 刘静秋  等 《中国实验血液学杂志》 2013年21卷6期 1369-1372页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 最新研究显示基因组空间结构对转录调控起着关键的作用.以造血分化过程为例,三维调控网络能更真实、精确地呈现造血特异的关键转录因子调控的组织方式和动态过程.革新的染色体构象捕获技术的发展和延伸为解析不同染色体间的调控元件、同一染色体内的不同调控...

【关键词】 染色体构象捕获； 造血分化； 染色质空间结构；

【中文期刊】 杨华 樊红  《东南大学学报（医学版）》 2014年33卷1期 99-102页 ISTICCA

【摘要】 研究表明,lncRNA以转录本的形式调控蛋白编码基因的表达,并参与染色质修饰、染色体沉默、基因组印迹以及转录激活等多种生物学过程.lncRNA的自身结构及所结合的靶点不同,其所具有的生物学功能亦不同.本综述将解析IncRNA的结构,包括RN...

【关键词】 长链非编码RNA； 染色质构象捕获； 三维DNA的筛选和交联；

【中文期刊】 潘有福  《遵义医学院学报》 2014年37卷5期 470-478页 ISTIC

【摘要】 真核生物的染色体如何发生复杂构象变化并组织成复杂的高级结构,仍是一个研究热点.染色体的这些结构特征和构象变化可通过了解染色质位点间的相互作用,即利用染色体(质)构象捕获(3C)及其衍生技术,如4C、5C、Hi-C和ChIA-PET等技术来研...

【关键词】 染色质相互作用； 染色体构象捕获； ChIA-PET；