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【中文期刊】 陈伟 程咏梅 等 《计算机科学》 2014年41卷2期 261-263,284页
【摘要】 随着环境基因组学及深度测序技术的发展,基于16S rRNA基因序列研究微生物种群结构取得了长足进展.然而,由于环境样本的复杂性,尤其缺少真实背景信息,定量研究环境微生物种群结构仍是当前的研究难点.测序算法仿真平台研究,不仅有助于定量、定性分...
【关键词】 16S rRNA基因; 模拟测序算法; PCR误差模型;
【学位论文】 作者: 李海涛 导师:郑春厚 曲阜师范大学 信息与通信工程 信息与通信工程(硕士) 2016年
【摘要】 随着高通量测序技术的发展,研究人员已经能够在全基因组范围内解决生物学以及生物医学中各种各样的问题,在此过程中也得到了海量的生物学数据。这些技术包括微阵列技术(例如基因表达,拷贝数变异,全基因组关联研究以及甲基化测序技术),第二代测序技术(例...
【学位论文】 作者: 薛伟艳 导师:孙啸 东南大学 生物医学工程 生物医学工程(硕士) 2007年
【摘要】 正如2001年人类基因组计划的初步完成,宣告了人类进入后基因组时代一样,2003年4月人类基因组计划的圆满结束,则拉开了人类迈入个体化医疗时代的序幕,使得个体基因组计划(PGP)成为可能。个体化医疗时代对个体进行疾病相关分析,就要求研究者获...
【中文期刊】 杨品 任振华 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...
【中文期刊】 孙红卫 杨文越 等 《中国卫生统计》 2016年33卷4期 607-611页 ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 logistic回归是生物医学研究中常用的方法,可以进行影响因素筛选、概率预测、分类等.高通量测序技术得到的数据给高维变量选择问题带来挑战.惩罚logistic回归可以对高维数据进行变量选择和系数估计,且其有效的算法保证了计算的可行性...
【关键词】 高维变量选择; 惩罚logistic回归; LASSO;
【中文期刊】 周晨 张绍武 等 《北京生物医学工程》 2014年33卷6期 591-597页 ISTIC
【摘要】 目的 随着高通量测序技术的发展,产生了大量的微生物16S rRNA基因序列数据.对该数据进行精确的微生物操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)划分,有助于了解环境中微生物的种群组成及分布.方法 本文在真...
【关键词】 聚类; 操作分类单元; 16S rRNA基因;