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【中文期刊】 饶榕 丁彦蕊 《食品与生物技术学报》 2019年38卷9期 78-84页
【摘要】 水在蛋白质折叠、相互作用、分子识别、动力学及耐热性方面发挥着重要作用.利用Voronoi算法识别出与耐热和常温木聚糖酶存在相互作用的水.以氨基酸残基和水为节点,残基-残基及残基-水相互作用为边,构建残基-水相互作用网络.计算网络中节点的度、...
【关键词】 残基-水相互作用网络；网络拓扑特征；网络聚类；
- 概要：
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【中文期刊】 邓雪晴 王世豪 等 《生物化学与生物物理进展》 2021年48卷12期 1493-1500页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 TARDNA结合蛋白43(transactive response DNA binding protein 43,TDP-43),一种可变剪切因子,可以特异性地结合富含TG序列的DNA,涉及多种神经退行性疾病.分子动力学模拟方法虽然是研究分...
【关键词】 TDP-43-DNA相互作用；高斯网络模型；关键残基；
- 概要：
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【中文期刊】 季静思 丁彦蕊 《中国生物化学与分子生物学报》 2019年35卷11期 1284-1293页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 残基相互作用网络是体现蛋白质中残基与残基之间协同和制约关系的重要形式.残基相互作用网络的拓扑性质以及社团结构与蛋白质的功能和性质有密切的关系.本文在构建一系列耐热木聚糖酶和常温木聚糖酶的残基相互作用网络后,通过计算网络的度、聚类系数、连接强...
- 概要：
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【中文期刊】 陶斯涵 丁彦蕊 《中国生物化学与分子生物学报》 2018年34卷7期 760-768页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 研究木聚糖酶的耐热机制能够提升工业生产效率和经济效益.本文使用SI-MAGNA残基相互作用网络比对算法,对来自嗜热子囊菌的耐热型木聚糖酶(Ta-XYNA)和来自变铅青链霉菌(Sl-XlnA)的常温型木聚糖酶进行网络比对,以探究影响两者结构稳...
【关键词】 热稳定性；残基相互作用网络比对；SI-MAGNA算法；
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【学位论文】 作者：刘文成导师：赵春燕 兰州大学 药学 药学（硕士） 2022年
【摘要】 ABCG2蛋白作为胎盘中的主要外排蛋白之一，负责将外源性物质从胎盘中排出而减少外源性物质的胎儿暴露，因此具有保护胎儿的功能。研究表明，妊娠期间经胎盘转移的环境化合物可能与胎儿的不良健康影响和出生结局密切相关。因此ABCG2蛋白与外源性环境化...
- 概要：
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【学位论文】 作者：曹成远导师：吕强 苏州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2016年
【摘要】 残基对的相互作用描述了蛋白质三维结构中一对残基的空间距离关系，相互作用的残基对对维护蛋白质结构的稳定起着重要作用。蛋白质中所有残基对的相互作用关系确定了蛋白质三维结构的二维拓扑，所以得到准确的残基对相互作用关系对蛋白质三维结构预测有重要意义...
- 概要：
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【学位论文】 作者：王美霞导师：姚小军 兰州大学 化学 分析化学（硕士） 2014年
【摘要】 蛋白质-RNA相互作用与生物体内的多种生命活动密切相关.因此,探讨蛋白质-RNA相互作用的分子机制,对于理解生物学过程、疾病病理研究以及药物设计具有重要的指导意义.目前,生物学家通过X-射线晶体衍射和核磁共振等实验方法得到蛋白质-RNA复合...
【关键词】 蛋白质-RNA相互作用 ； 残基相互作用网络 ；
- 概要：
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【中文期刊】 杨宣叶 高明阳 等 《微生物学通报》 2025年52卷1期 90-100页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 流感病毒持续危害全球公共卫生安全,引起人类和动物的传染性呼吸道疾病,每年导致全球数十万人死亡.流感病毒能够通过抗原转变和抗原漂移进化出新型毒株,从而对现有药物和疫苗产生耐药性.为了解决这个问题,亟须研究新的抗病毒靶点来开发新型抗病毒药物.流...
- 概要：
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【中文期刊】 朱美南 谷笑 等 《微生物学报》 2025年65卷1期 389-401页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]环氧化物水解酶(epoxide hydrolases,EHs)在手性药物的合成中起着重要作用.为了补充和发现更多的高性能环氧化物水解酶,通过基因调取技术探索新的环氧化物水解酶.[方法]通过基因调取技术鉴定了一种来自卡尔斯巴德曲霉的新...
- 概要：
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【中文期刊】 吴晓敏 袁晓辉 等 《物理化学学报》 2013年29卷9期 1842-1850页
【摘要】 蛋白质折叠是目前结构生物学领域的核心问题之一,理解蛋白质结构折叠机制及其与生物功能之间的相互关系一直是生命科学家非常重要的研究内容,并且该研究受到越来越多不同学科领域研究工作者的高度重视.蛋白质大多数在数十毫秒、微秒或几秒内完成自我折叠过程...
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