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【中文期刊】 薛清 杜虹锐  等 《生物技术通报》 2021年37卷7期 98-106页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 苜蓿滑刃线虫(Aphelenchoides medicagus)是一种兼性植物寄生线虫,可在多种真菌上完成生活史,同时对大豆和苜蓿具有弱寄生性.本研究采用Illumina平台对苜蓿滑刃线虫进行低覆盖全基因组测序,从获得的全基因组序列中提取线...

【关键词】 苜蓿滑刃线虫； 滑刃线虫科； 线粒体基因组；

【中文期刊】 李晓然 张若鸿  等 《中国食品卫生杂志》 2020年32卷3期 339-344页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 随着用于监测食源性致病菌和暴发调查的分子分型技术迅猛发展,全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)正逐渐显露出其重要性.在食品贸易全球化背景下,急需建立食源性致病菌与人类感染间联系的详尽认识,从而精确监测并减少...

【关键词】 食源性致病菌； 暴发； 全基因组测序；

【中文期刊】 覃福礼 赵亮  等 《中草药》 2020年51卷4期 1003-1015页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 利用二代测序技术筛选出具有显著性变化的基因,并探讨月腺大戟素A在转录组学层面上抗乳腺癌活性的作用机制.方法 从月腺大戟药材中提取乙酰间苯三酚类化合物月腺大戟素A,对MCF-7细胞(乳腺癌细胞的luminalA型)进行干扰,观察被干扰后...

【关键词】 月腺大戟素A； 乳腺癌； RNASeq；

【中文期刊】 叶丹丹 樊萌萌  等 《动物学研究》 2012年33卷6期 574-585页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【摘要】 由Handelsman et al (1998)提出的宏基因组(metagenome)泛指特定环境样品(例如:人类和动物的肠道、母乳、土壤、湖泊、冰川和海洋等环境)中微生物群落所有物种的基因组.宏基因组技术起源于环境微生物学研究,而新一代高...

【关键词】 宏基因组学； 扩增子测序； 全基因组测序；

【中文期刊】 康菊清 孙田舒  等 《植物学报》 2016年51卷5期 659-666页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 对模式植物的研究不仅能揭示众多具有普遍规律的生物现象,而且能为其它植物物种,特别是与人类生活紧密相关的经济植物提供具有借鉴与参考意义的研究方法.QTL遗传作图是寻找那些影响不同地域植物自然变异等位基因的传统且有效的工作方法.对不同分化时长和...

【关键词】 野生拟南芥种群； 二代重测序技术； QTL遗传作图平台；

【中文期刊】 司锘 王蓉蓉  等 《国际遗传学杂志》 2018年41卷1期 1-6页 ISTICCA

【摘要】 目的 应用 Illumina MiSeq 和Ion Torrent PGM 两种台式高通量测序平台,使用同样的序列捕获系统,结合两个平台各自配备的标准化试剂及软硬件设备,对癫痫患者进行突变检测,对比两个平台在使用成本、操作难易度、突变检测效...

【关键词】 台式高通量测序平台； MiSeq测序仪； PGM测序仪；

【中文期刊】 陈健 岳巧云  等 《中国媒介生物学及控制杂志》 2017年28卷2期 124-130页 ISTICCA

【摘要】 目的 研究高通量测序技术在医学媒介生物携带细菌检测中的应用,建立一种操作简便、经济高效和鉴定准确的检测方法.方法 优化样本处置和细菌提取等前处理方法、优化PCR反应体系和条件;以大头金蝇为研究材料,利用Illumina高通量测序平台,以二代...

【关键词】 Illumina测序平台； V3可变区； 细菌；

【中文期刊】 张自冠 施静艺  等 《现代生物医学进展》 2016年16卷9期 1606-1609,1618页 ISTICCA

【摘要】 目的:针对斑马鱼高通量测序数据,通过一系列质量控制和突变过滤,构建一套有效隐性遗传突变筛选系统.方法:A)经过与斑马鱼参考基因组比对,利用GATK获得初始的VCF格式突变信息.B)使用perl语言编写本地脚本,对突变信息进行过滤,注释等.C...

【关键词】 二代测序； Illumina测序平台； 突变点富集；

【中文期刊】 王理 上官少方  等 《现代生物医学进展》 2011年11卷4期 618-623页 ISTICCA

【摘要】 目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法.方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点.结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列...

【关键词】 MassArray分子量阵列技术平台； 甲基化； 重亚硫酸盐测序；

【中文期刊】 宋琳琳 顾朝辉  等 《现代生物医学进展》 2009年9卷15期 2899-2902,2912页 ISTICCA

【摘要】 目的:针时下一代测序数据量大、序列长度短的特点,研究数据分析和质量评估方法.方法:选择已发布的Illumina-Solexa平台测序数据为研究对象,通过MAQ软件将测序数据与人类全基因组序列进行比对,并以外显子区域为例,在位点水平时测序数据...

【关键词】 下一代测序； Illumina-Solexa测序平台； MAQ比对软件；