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            【中文期刊】 王旭东  吴亮  等 《传染病信息》 2023年36卷3期 199-207页ISTIC

            【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)及人类蛋白质图谱数据库(Human Protein Atls,HPA)...

            【关键词】 肝细胞癌热休克蛋白HSPH1

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            【中文期刊】 方琼  钱卫斌  等 《亚太传统医药》 2022年18卷7期 147-154页

            【摘要】 目的:利用特定生物医学数据库,挖掘甲状腺结节、乳腺结节、子宫肌瘤3种疾病间的分子关联网络.结合网络药理学方法,构建"疾病-共有靶点-中医症状-成分-中药"网络,阐释中医"异病同治"的理论物质基础.方法:通过DisGeNET、Gencards...

            【关键词】 甲状腺结节乳腺结节子宫肌瘤

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            【中文期刊】 叶星  刘仁仪  《中国组织工程研究》 2025年29卷24期 5237-5244页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:海马体对认知功能至关重要,运动有望提升认知并缓解认知衰退,然而其分子机制尚不明了.生物信息学通过分析运动对海马体分子表达的影响,从而揭示关键机制,为理解运动如何促进认知及制定干预策略提供新的视角.目的:采用生物信息学方法深入分析自主运...

            【关键词】 自主运动小鼠海马体

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            【中文期刊】 裴珍珍  张珊  等 《中国糖尿病杂志》 2025年33卷1期 28-35页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 探讨程序性细胞死亡(PCD)对DKD发生发展的作用机制.方法 检索基因表达综合数据库,获取数据集GSE30529和GSE30122,分析DKD差异表达基因(DEGs).通过基因集富集分析网站、铁死亡数据库、自噬数据库并结合既往相关文献...

            【关键词】 糖尿病肾脏疾病程序性细胞死亡基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 石长玉  李勇  等 《吉林大学学报(医学版)》 2025年51卷3期 703-715页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:基于生物信息学方法分析补体替代途径对小鼠结直肠癌(CRC)肝转移模型的调控作用,并进行实验验证.方法:以"CRC肝转移"为关键词在基因表达综合(GEO)数据库中进行检索,获取GSE81558 GEO数据集,包括正常结肠组织样本、CRC...

            【关键词】 结直肠癌肝转移基因表达综合数据库

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            【中文期刊】 高丽娜  张炎  等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年34卷7期 954-962页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于TCGA数据库探讨坏死性凋亡相关基因(necroptosis-related genes,NRGs)对结肠癌预后的预测价值.方法 从TCGA数据库获取358例患者的RNA高通量测序(RNA-sequencing,RNA-seq)数...

            【关键词】 癌症基因组图谱数据库坏死性凋亡结肠癌

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            【中文期刊】 叶泽麒  袁崧展  等 《环球中医药》 2025年18卷4期 736-750页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于生物信息学及网络药理学分析肉苁蓉防治慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的分子作用机制.方法 采用 TCMSP、Swiss Target Prediction、ETCM、PharmMapper 及检索...

            【关键词】 肉苁蓉慢性心力衰竭网络药理学

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            【中文期刊】 王旭栋  李泽森  等 《山西医科大学学报》 2025年56卷8期 911-921页ISTICCA

            【摘要】 目的 采用生物信息学联合蛋白质组学探究IgA肾病(IgAN)相关差异基因的表达,并筛选相关的靶向中药.方法 选取基因表达综合数据库(GEO)的GSE93798和GSE37460数据集,通过R语言筛选IgAN差异表达基因(DEGs),并采用火...

            【关键词】 IgA肾病生物信息学蛋白质组学

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            【中文期刊】 吴波  王玥坤  等 《解放军药学学报》 2025年38卷4期 374-379页ISTICCA

            【摘要】 目的 整合Toll样受体4(TLR4)在乳腺癌中基因和蛋白表达,分析其与免疫浸润之间的相关性,为今后乳腺癌治疗提供理论支持.方法 从TCGA数据库获取乳腺浸润性癌(BRCA)数据表达谱和临床信息,借助UALCAN数据库和R软件分析BRCA中...

            【关键词】 Toll样受体4乳腺癌免疫浸润

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            【中文期刊】 夏辰亮  张泽成  等 《合成生物学》 2025年6卷3期 547-565页

            【摘要】 结构生物信息学聚焦于生物分子的三维结构及其功能,蛋白质的结构是其核心研究对象.深度学习引发的蛋白质结构预测革命,特别是AlphaFold2的突破,实现了仅凭氨基酸序列即可达到原子精度的蛋白质结构预测,从根本上重构了该领域的数据生态.统计物理...

            【关键词】 统计物理人工智能蛋白质结构

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