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【中文期刊】 张宗源 岳丹丹 等 《生物学杂志》 2025年42卷2期 33-39页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了筛选一株产细菌素乳酸菌,并对其进行细菌素基因簇的挖掘,以大肠杆菌、金黄色葡萄球菌为指示菌,通过常规方法初筛和复筛后筛选出1株抑菌能力较强的产细菌素的戊糖乳杆菌Lpe59.全基因组测序结果显示,菌株Lpe59基因组大小为3 274 558...
- 概要：
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【中文期刊】 杨梅 牛鹏威 等 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷4期 370-380页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 由革兰阴性菌水稻黄单胞菌(Xanthomonas Campestris pv.oryzae,Xoc)引起的细菌性条斑病(bacterial leaf streak,BLS)是水稻生产区最具破坏性的病害之一,尤其是在潮湿的热带、亚热带地区.本...
【关键词】 水稻黄单胞菌(Xoc)；细菌性条斑病(BLS)；水稻；
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【中文期刊】 刘轶 匡慧慧 等 《中华医院感染学杂志》 2024年34卷20期 3041-3045页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 对一株多药耐药肺炎克雷伯菌进行全基因组测序并对全部耐药基因进行分析.方法 2023年10月从一名脑梗死患者的尿液中常规方法分离肺炎克雷伯菌,进行鉴定和药敏试验,并通过16sRNA测序进行菌株确认,采用三代测序技术进行全基因组测序,通过...
- 概要：
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【中文期刊】 许一丹 谢成彬 等 《检验医学与临床》 2024年21卷9期 1224-1228,1234页ISTICCA
【摘要】 目的 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)、16 S rRNA序列分析和全基因组测序(WGS)对从临床标本中分离的 1 株疑似盐单胞菌进行菌种鉴定,比较 3 种方法的鉴定结果.方法 采用MALDI-TOF MS对...
【关键词】 细菌鉴定；基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱；16S rRNA序列；
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【中文期刊】 邓安霞 王子豪 等 《中国急救医学》 2024年44卷12期 1070-1078页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 应用孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)技术探究免疫细胞特征与细菌性肺炎之间的相关性.方法 选取已知731种免疫细胞特征,从全基因组关联研究(genome-wide association study,...
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【中文期刊】 孟人杰 罗楠 等 《军事医学》 2024年48卷3期 213-218页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用深度学习方法,鉴别基因组相似度很高的大肠杆菌和志贺菌,为临床诊断和疫情防控提供参考依据.方法 提出一种迁移学习大规模预训练蛋白质语言模型的卷积神经网络(CNN),用于细菌类型鉴别,该方法可在属水平上实现对细菌类型的快速准确鉴别.为...
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【中文期刊】 马浩天 李杨 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页
【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...
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- 方法：
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【中文期刊】 陈志娜 尹琳琳 等 《食品科学》 2024年45卷22期 43-50页
【摘要】 为了深入挖掘对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)具有显著抑制作用的植物乳植杆菌CHEN1细菌素基因簇,使用PacBio RS和Illumina测序平台...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 任青霞 户行宇 等 《中国食品学报》 2024年24卷9期 184-193页
【摘要】 目前乳酸菌发酵产细菌素的含量较低,因此优化产细菌素的发酵条件是最直接的方式.对分离自内蒙古传统干酪的植物乳杆菌NMGL2的抗生素药敏性、溶血性以及全基因组序列进行分析,结果表明该菌株无明显毒力作用,不携带高毒力因子,抗性基因无转移风险.对植...
【关键词】 植物乳杆菌NMGL2；全基因组测序；安全性；
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【中文期刊】 纪帅奇 乌日娜 等 《食品科学》 2024年45卷2期 57-63页
【摘要】 为了详细解析枯草芽孢杆菌SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台,对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能...
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