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【中文期刊】 郑斌 厉力华  《中国生物医学工程学报》 2013年32卷5期 580-587页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 蛋白质序列特征表示和机器学习算法是影响蛋白质结构类预测效果好坏的两个重要方面.本研究基于k-字统计频率和k-片段位置分布两种特征提取方法,将分别提取到的氨基酸序列信息和物理化学性质信息同蛋白质二级结构信息进行融合,建立17维和57维的特征信...

【关键词】 蛋白质结构类预测； 特征信息集； Ma-Ada多分类器融合；

【中文期刊】 张同亮 丁永生  《生物医学工程学杂志》 2008年25卷4期 921-924页 MEDLINEISTICPKUCA

【摘要】 提出了一种基于二叉树支持向量机(BT-SVM)的蛋白质结构类多类预测新方法.采用26维的向量来表示蛋白质序列的特征.BT-SVM多类分类方法能消除SVM在多分类问题中存在的不可分数据问题.采用两个经典数据集作为测试数据,通过自身一致性和n折...

【关键词】 蛋白质结构类预测； 二叉树支持向量机； 氨基酸对相互作用；

【中文期刊】 李楠 李春  《生物信息学》 2012年10卷4期 238-240页 ISTIC

【摘要】 基于氨基酸的16种分类模型,给出蛋白质序列的派生序列,进而结合加权拟熵和LZ复杂度构造出34维特征向量来表示蛋白质序列.借助于贝叶斯分类器对同源性不超过25％的640数据集进行蛋白质结构类预测,准确度达到71.28％.

【关键词】 蛋白质结构类预测； 氨基酸； 加权拟熵；

【中文期刊】 姜小莹 朱俊东  等 《生物物理学报》 2008年24卷1期 43-48页 MEDLINEISTICCA

【摘要】 蛋白质结构类预测是生物信息和蛋白质科学中重要的研究领域.基于Chou提出的伪氨基酸离散模型框架,从蛋白质序列出发,设计一种新的伪氨基酸组成方法表示蛋白质序列样本.抽取氨基酸组合(10-D)在序列中出现的频率和疏水氨基酸模式(6-D)表示蛋白...

【关键词】 蛋白质结构类预测； 伪氨基酸组成； 模糊支持向量机；

【中文期刊】 闫化军 章毅  《生物信息学》 2004年2卷4期 19-24,41页 ISTIC

【摘要】 运用加入竞争层的BP网络,研究了基于蛋白质二级结构内容的域结构类预测问题.在BP网络中嵌入一竞争,层显著提高了网络预测性能.仅使用了一个小的训练集和简单的网络结构,获得了很高的预测精度:自支持精度97.62%,jack-knife测试精度9...

【关键词】 蛋白质结构类； 结构类预测； BP神经网络；

【中文期刊】 陶海波 马圣  等 《黑龙江科技信息》 2015年17期 43页

【摘要】 蛋白质结构类型是蛋白质高级结构中基本原件的空间分布,是蛋白质高级结构与功能研究的基础,该研究对蛋白质组学具有重要意义.通过传统实验方法研究蛋白质结构类需要耗费大量的人力、财力、物力,也无法满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长的现实需要.目前,基...

【关键词】 蛋白质结构类； 特征信息提取； 预测算法；

【中文期刊】 聂向民 朱传福  等 《中国免疫学杂志》 2023年39卷1期 152-156,161页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:鉴定分析HLA新等位基因B*46:30序列,对其MHC蛋白分子三级结构及氨基酸残基改变对蛋白结构的可能影响进行模拟分析,并对其血清学表型进行鉴定.方法:应用Luminex SSOP流式、PCR-SBT及单等位基因特异性测序对HLA序列...

【关键词】 人类白细胞抗原； 测序分型； 新等位基因；

【中文期刊】 何云刚 谭德勇  等 《生物化学与生物物理进展》 2001年28卷6期 848-852页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 单链构象多态性(SSCP)分析是一种简便,快速检测DNA突变的方法,它在基因突变检测、遗传分析、进化研究等领域有着广泛的应用价值.但是这种方法的突变检出率随DNA序列不同而变化,一般只能达到70%～80%.这主要是有的碱基突变对单链DNA的...

【关键词】 突变检测； DNA单链二级结构预测； 单链构象多态性分析学科分类号Q319.3；

【中文期刊】 刘彦北 刘金新  等 《天津工业大学学报》 2022年41卷2期 53-59页

【摘要】 为研究社区结构对网络表示学习的影响,提出了一种新颖的融合社区结构信息的网络表示学习算法(CINE).通过借鉴模块度思想,将社区结构吸收到基于矩阵分解的模型中以保留网络内部的社区结构;设计一个整体的目标函数,在捕获社区结构信息的同时也融合了节...

【关键词】 网络表示学习； 属性信息； 社区结构；

【中文期刊】 万晓耕  《生物信息学》 2021年19卷1期 35-46页 ISTIC

【摘要】 蛋白质的序列、结构和功能多种多样.大量研究表明蛋白质的结构与其氨基酸序列的排序有关,并且局部的氨基酸序列环境对蛋白质的结构具有一定的影响.本文提出一种新的基于5-mer氨基酸扭转角统计偏好的蛋白质结构类型预测方法,在该方法通过PDB数据库中...

【关键词】 蛋白质结构预测； 分类； 氨基酸序列；