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【中文期刊】 刘钦玲 赵余静 等 《山东第二医科大学学报》 2024年46卷5期 369-372,后插3-后插4页
【摘要】 目的 分析人同源盒基因D8(HOXD8)在脑胶质瘤中的表达特征,探讨其与肿瘤进展、患者生存预后以及免疫微环境的关系.方法 整合TCGA数据库中的胶质瘤样本数据,进行生物信息学分析,研究HOXD8的表达模式,通过实时荧光定量PCR验证其在胶质...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李睿哲 薛军帅 等 《肝胆胰外科杂志》 2022年34卷7期 406-413页ISTICCA
【摘要】 目的 构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性.方法 从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免疫...
【关键词】 肝细胞肝癌；肿瘤预后；癌症基因组图谱数据库(TCGA)；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 马涛 陶润 等 《蚌埠医学院学报》 2022年47卷6期 811-817页ISTICCA
【摘要】 目的:探究膀胱癌(BC)中基因的差异化表达及其预后作用.方法:从TCGA数据库中下载BC的基因表达数据,利用R软件筛选出肿瘤与正常组织间差异表达基因,并进行富集分析,评估其潜在生物学功能及信号通路.利用在线数据库STRING11.0构建了编...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李鑫 李梦玮 等 《遗传》 2019年41卷3期 234-242页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 随着二代测序技术的快速发展,数据量不断累积,肿瘤学家的目光逐渐由多物种测序转移至高通量测序数据的分析和比对.基因数据分析方法层出不穷,高通量的组学分析手段不断优化和创新,基因数据的挖掘和分析工作正处于飞速发展的时期.以肿瘤病人样本为核心的数...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王维杰 赵森峰 等 《肝胆胰外科杂志》 2021年33卷9期 533-538页ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学分析LAMA3的表达对胰腺癌预后的诊断价值及其与肿瘤临床特征的相关性.方法 从TCGA和GEO数据库分别下载胰腺癌转录组及临床数据,R软件用于数据处理和分析.首先明确LAMA3的差异表达,继而Kaplan-Meier分析...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 杜强 姚义勇 等 《癌变·畸变·突变》 2020年32卷6期 457-463页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨异常纺锤体样小头畸形相关基因(ASPM)在肺腺癌中的表达水平,及其与患者临床病理指标和预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌组织和癌旁组织mRNA表达水平和临床病例资料,比较ASPM mRNA在癌组织和癌旁...
【关键词】 异常纺锤体样小头畸形相关基因；肺腺癌；肿瘤标志物；
- 概要：
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【中文期刊】 贾晓晨 贾勇圣 等 《天津医药》 2018年46卷8期 856-861页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 利用TCGA数据库建立预测乳腺癌预后的多基因预后模型,分析多基因预后模型与乳腺癌各临床病理特征之间的关系.方法 对TCGA数据库中乳腺癌患者的mRNA数据进行整理,通过R语言软件筛选出在乳腺癌样本及正常样本中差异表达的基因,采用Cox...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 曹晓东 项承 《精准医学杂志》 2025年40卷2期 153-157页
【摘要】 目的 探讨血小板结合蛋白基序的解聚蛋白样金属蛋白酶-9(ADAMTS9)对甲状腺癌(thyroid can-cer,THCA)患者预后的影响及其潜在作用机制.方法 从TCGA数据库获取THCA组织中ADAMTS9表达水平及患者临床资料,HP...
【关键词】 甲状腺肿瘤；ADAMTS9蛋白质；基因表达；
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【中文期刊】 陶润 李文永 等 《蚌埠医学院学报》 2024年49卷3期 335-339,343页ISTICCA
【摘要】 目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析.利用S...
【关键词】 前列腺肿瘤；癌症基因组图谱；Oncomine数据库；
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【中文期刊】 李伟 程丰 等 《现代泌尿外科杂志》 2024年29卷1期 46-50,68页ISTICCA
【摘要】 目的 基于美国癌症肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析铜调节的细胞死亡相关基因与前列腺癌患者预后和免疫细胞浸润的关系.方法 从TCGA数据库下载所有前列腺癌患者的基因数据,其中包括前列腺癌组织 ...
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