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【中文期刊】 陶润 李文永 等 《蚌埠医学院学报》 2024年49卷3期 335-339,343页 ISTICCA
【摘要】 目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据.方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析.利用S...
【关键词】 前列腺肿瘤； 癌症基因组图谱； Oncomine数据库；
【中文期刊】 刘洋 江梅 等 《湖北医药学院学报》 2023年42卷2期 143-147页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨线粒体自噬基因E2F1与子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)预后的相关性.方法:R软件筛选肿瘤基因组图谱数据库UCEC以及正常组织中差异表达的线粒体自噬基因.单因素和多因...
【中文期刊】 王杨淑怡 叶威 等 《检验医学》 2023年38卷9期 833-841页 ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学方法构建肺腺癌(LUAD)-细胞焦亡基因预后风险模型,探讨LUAD与细胞焦亡的关系.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载LUAD患者的转录组数据(TCGA队列)和临床资料,采用limma程序包鉴别差异表达的焦亡基...
【关键词】 细胞焦亡基因； 肺腺癌； 肿瘤基因组图谱数据库；
【中文期刊】 陈遒 蔡良良 等 《浙江大学学报（医学版）》 2022年51卷1期 79-86页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选膀胱癌预后相关基因,建立膀胱癌预后评分模型.方法:通过UCSC Xena平台下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因型和基因表达量关联数据库(GTEx)中406例膀胱癌患者的临床信息和膀胱癌组织RNA测序数据,以及28名健康对照...
【中文期刊】 张磊 姜经航 《医学研究生学报》 2022年35卷5期 512-518页 ISTICPKU
【摘要】 目的 细胞凋亡在膀胱癌(BC)发生、发展以及化疗等生物学进程中发挥着重要作用.文中通过分析差异表达的凋亡相关基因(ARGs)以及临床特征,构建预测BC患者预后的模型. 方法 分析肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中161个ARGs,筛选出差异...
【中文期刊】 李苇航 丁子毅 等 《吉林大学学报（医学版）》 2021年47卷6期 1570-1580页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选骨肉瘤(OS)发生发展的核心驱动基因,从分子水平探讨OS的致病机制,并构建基因模型用于患者生存期的预测.方法:采用基因表达汇编(GEO)数据库下载OS芯片对应矩阵数据GSE12865、GSE14359和GSE36001.采用生物信...
【关键词】 骨肉瘤； 癌症基因组图谱数据库； 分子机制；
【中文期刊】 李睿哲 薛军帅 等 《肝胆胰外科杂志》 2022年34卷7期 406-413页 ISTICCA
【摘要】 目的 构建"免疫相关lncRNA基因对"模型预测未发生远处转移的原位肝癌预后并分析不同组别肿瘤免疫微环境特征及药物敏感性.方法 从XENA数据库获取肝细胞肝癌样本正常肝脏样本的RNA-seq数据,筛选出未发生远处转移的原位肝癌样本,提取免疫...
【关键词】 肝细胞肝癌； 肿瘤预后； 癌症基因组图谱数据库(TCGA)；
【中文期刊】 赵格 黎昌学 等 《口腔疾病防治》 2022年30卷1期 27-32页 ISTIC
【摘要】 目的 探索miR?135b?5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR?135b?5p靶基因并进行相关生物信息学分析.方法 通过肿瘤与癌症基因图谱(t...
【关键词】 口腔鳞状细胞癌； 微小RNA； miR-135b-5p；
【中文期刊】 陈科 陈继军 等 《医学信息》 2022年35卷18期 19-24页
【摘要】 目的 探讨CPT1C在胃癌中的表达情况及其可能参与的信号通路.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中下载并预处理胃癌数据集的mRNA表达RNA-seq数据及临床预后相关数据,对胃癌组织和正常组织中CPT1C基因进行差异表达分析,并绘制图...
【关键词】 胃癌； 肿瘤基因组图谱； Kaplan-Meier Plotter；
【中文期刊】 孙阳 赵春临 《医学研究生学报》 2019年32卷6期 629-633页 ISTICPKU
【摘要】 目的 纤维连接蛋白1(FN1)参与癌症发生发展的机制尚不清楚.文章旨在研究FN1在胃癌组织中的表达和临床病理意义,并探讨FN1作用机制. 方法 采用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载GSE541...
【关键词】 胃癌； 人类肿瘤相关基因表达汇编数据库； 癌症基因组图谱数据库；
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