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【中文期刊】 刘杭丰 刘盛露 等 《中国免疫学杂志》 2024年40卷5期 918-924页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探究VSIG4在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与免疫细胞浸润和预后的关系.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载ccRCC的RNA-seq数据和患者相应的临床数据;通过Wilcoxon秩和检验分析ccRCC及正常肾组织...
【中文期刊】 陈冉 王维伊 等 《现代检验医学杂志》 2024年39卷2期 75-80,180页 ISTICCA
【摘要】 目的 通过生物信息学的方法探讨视黄醇结合蛋白 7(retinol binding protein 7,RBP7)在乳腺癌中的作用.方法 使用R语言基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库和人类蛋白...
【中文期刊】 刘克毅 梁广芃 等 《锦州医科大学学报》 2024年45卷2期 56-61页 CA
【摘要】 目的 研究胸苷酸合酶(thymidylate synthase,TYMS)与甲状腺乳头状癌(thyroid papillary carcinoma,PTC)的相关性,并探讨相关机制.方法 通过TIMER 2.0 数据库分析TYMS在癌症中的...
【中文期刊】 晁凡 徐志兵 《国际检验医学杂志》 2023年44卷19期 2305-2308页 ISTICCA
【摘要】 目的 探讨细胞分裂周期相关基因 8(CDCA8)在多种人恶性肿瘤中的表达及其与患者预后、肿瘤浸润免疫细胞的相关性.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)、基因表达谱交互分析(GEPIA)、TIMER 2.0 等数据...
【中文期刊】 郭丽 马银玲 等 《南方医科大学学报》 2022年42卷9期 1267-1278页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 旨在寻找与浸润性乳腺癌(BRCA)发生相关的肿瘤微环境(TME)相关基因,以预测其预后并为临床提供治疗靶点.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索到RNA转录组数据和临床相关数据.利用ESTIMATE算法计算基质评分和免疫评分...
【中文期刊】 张向莲 王兴芬 等 《胃肠病学》 2022年27卷9期 554-557页 ISTICCA
【摘要】 背景:结直肠癌的发病率和死亡率在恶性肿瘤中居前列.研究发现纤维蛋白原样蛋白2(FGL2)可能通过调节肿瘤微环境中的免疫细胞功能促进肿瘤进展.目的:研究FGL2在结肠癌中的表达情况及其临床意义.方法:收集2018年1月—2022年1月天津医科...
【中文期刊】 杨珮珮 杨珺涵 等 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2022年29卷10期 921-929页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨解偶联蛋白2(UCP2)在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的预后价值,分析UCP2表达与SKCM肿瘤浸润免疫细胞(TIC)之间的相关性.方法:通过GEPIA在线数据库分析SKCM组织及正常皮肤组织中UCP的差异性表达,探讨UCP表达与S...
【中文期刊】 张旭东 李晓宁 等 《中国免疫学杂志》 2024年40卷4期 741-751页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:筛选出可预测胃癌(GC)肿瘤微环境(TME)免疫活性的预后基因.方法:收集55例GC患者术后石蜡组织标本及其对应的癌旁组织;从TCGA数据库和GEO数据库中共下载了976例GC患者的转录组数据及临床数据;采用估计算法(ESTIMATE...
【中文期刊】 王建平 霍子天 等 《生命科学研究》 2024年28卷2期 143-151页 ISTICCA
【摘要】 免疫细胞一直被认为是维持机体平衡的重要调节因子,对肿瘤浸润免疫细胞进行量化分析有望揭示免疫系统在肿瘤中的多方面作用.本文总结了量化肿瘤浸润免疫细胞的计算方法及相关的分析工具,包括基于标志基因富集分析方法和反卷积分析方法开发的算法模型与工具,...
【关键词】 肿瘤; 肿瘤浸润免疫细胞(TIC); 基因集富集分析(GSEA);
【中文期刊】 王涛 周足力 等 《中国医药导刊》 2024年26卷4期 328-337页 ISTIC
【摘要】 目的:采用呼吸信号法和定量聚合酶链反应(QPCR)技术对肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)产品的无菌检测进行评估,旨在研究高效、可靠的实验方法,以快速完成免疫细胞产品微生物检测.方法:提取患者外周血或者肿瘤组织中免疫细胞,按照直接接种法、呼吸信号法...