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【中文期刊】 张斌 尹京苑 等 《生物信息学》 2011年09卷3期 224-228,234页 ISTIC
【摘要】 蛋白质二级结构对于研究其功能具有重要作用.采用主成分分析方法对氨基酸的墓本物化属性及其二级结构倾向性进行降维降噪处理,使用径向基神经网络对蛋白质二级结构进行预测.主成分分析使得之前20x12矩阵变为20x4矩阵,极大地减少了神经网络输入端的...
【中文期刊】 吴琳琳 徐硕 《生物信息学》 2010年08卷3期 187-190页 ISTIC
【摘要】 蛋白质结构预测是现代计算生物领域最重要的问题之一,而蛋白质二级结构预测是蛋白质高级结构预测的基础.目前蛋白质二级结构的预测方法较多,其中SVM方法取得了较高的预测精度.重在阐述使用SVM用于蛋白质二级结构预测的步骤,以及与其他方法进行比较时...
【中文期刊】 孟翔燕 孟军 等 《生物信息学》 2010年08卷3期 206-209页 ISTIC
【摘要】 目前评价蛋白质二级结构预测方法主要考虑预测准确率,并没有充分考虑方法自身参数对方法的影响.本文提出一种新型评价方法,将内在评价与外在评价相结合评价预测方法的优劣.以基于混合并行遗传算法的蛋白质二级结构预测方法为例,通过内在评价,合理选取内在...
【关键词】 蛋白质二级结构预测方法; 内在评价; 外在评价;
【中文期刊】 李晓琴 罗辽复 《生物化学与生物物理进展》 2002年29卷1期 124-127页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 提出紧结构域的概念,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域.利用3种紧结构域(α域,β域和α/β域)定义球蛋白的5种结构型:α型蛋白,β型蛋白,α/β型蛋白,多域蛋白和ζ型蛋白.将1 261...
【中文期刊】 张彦 刘次全 《生物化学与生物物理进展》 1999年26卷3期 265-269页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用p53 C端118个氨基酸的mRNA二级结构和Chou-Fasman蛋白质二级结构预测原则,预测p53蛋白质C端289~325为卷曲肽段,368~393段包括两段螺旋结构: α1 368~373, α2 381~388.其中三段已知的蛋...
【中文期刊】 高光芹 宛新生 等 《贵州大学学报(自然科学版)》 2022年39卷2期 45-49,65页
【摘要】 针对水稻蛋白质二级结构预测研究,查阅了国家水稻数据中心文献资源,基于国际蛋白质数据库(pro-tein data bank,PDB),选择具有代表性的蛋白质(5 XQI)作为样本,应用BP神经网络建模技术,对水稻蛋白质二级结构进行预测研究....
【中文期刊】 韩心怡 刘毅慧 《生物信息学》 2020年18卷2期 116-126页 ISTIC
【摘要】 蛋白质二级结构预测是蛋白质结构研究的一个重要环节,大量的新预测方法被提出的同时,也不断有新的蛋白质二级结构预测服务器出现.试验选取7种目前常用的蛋白质二级结构预测服务器:PSRSM、SPOT-1D、MUFOLD、Spider3、Raptor...
【中文期刊】 张同亮 丁永生 《生物医学工程学杂志》 2008年25卷2期 259-263页 MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 蛋白质二级结构预测是蛋白质功能预测中一个很重要的环节.我们综合考虑了蛋白质序列中对氨基酸二级结构具有影响的因素,采用最大熵模型实现了对蛋白质二级结构的预测.将氨基酸之间的相互作用和氨基酸对于二级结构的倾向性作为特征函数,充分体现了蛋白质序列...
【中文期刊】 徐建平 方慧生 等 《中国药科大学学报》 2006年37卷5期 470-473页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本文用常用的得分矩阵代替传统的Qian编码作为神经网络的输入层预测了200个蛋白质二级结构.结果表明:以常用得分矩阵作为输入层的预测结果要优于Qian编码的预测性能.在200个蛋白质中,共有9个蛋白质的预测精度达到目前国际先进水平,即80%...
【中文期刊】 朱树平 刘毅慧 《生物信息学》 2019年17卷1期 53-60页 ISTIC
【摘要】 蛋白质二级结构的预测,对于研究蛋白质的功能和人类生命科学意义非凡.1951年开始提出预测蛋白质二级结构,1983年对于二级结构的预测只有50%的准确率.经过多年的发展,预测方式不断的改进和完善,到如今准确率已经超过80%.但目前预测在线服务...