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【中文期刊】 张宇航 薛振勇 等 《物理学报》 2023年72卷15期 293-300页
【摘要】 不同结构类型的蛋白质的力学稳定性和去折叠动力学有显著的差异,其中全部由a螺旋构成的蛋白质通常在较小的拉力作用下就会发生快速去折叠,需要能够精准控制皮牛量级拉力的实验手段来进行定量研究.酰基辅酶A结合蛋白(ACBP)是一种研究全a螺旋结构蛋白...
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【中文期刊】 史小红 《生物信息学》 2016年2期 112-116页ISTIC
【摘要】 基于蛋白质二维HP模型提出改进的遗传算法对真实蛋白质进行计算机折叠模拟.结果显示疏水能量函数最小值的蛋白质构象对应含疏水核心的稳定结构,疏水作用在蛋白质折叠中起主要作用.研究表明二维HP模型在蛋白质折叠研究中是可行的和有效的并为进一步揭示蛋...
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【中文期刊】 张天驰 张菁 《生物信息学》 2011年09卷2期 142-145页ISTIC
【摘要】 蛋白质折叠过程模拟是当前蛋白质研究领域的一个难点问题.针对这一问题,提出了一个描述蛋白质折叠过程的算法一拟蛇算法,并且从分子振荡和分子动力学理论两个方面来证明该算法的核心函数是可行和正确的.经过实验总结出所有蛋白质空间结构都可以通过两种类型...
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【中文期刊】 欧阳芳平 徐慧 等 《生物信息学》 2007年5卷4期 179-181页ISTIC
【摘要】 简要综述了近年来蛋白质折叠机理的理论研究.首先回顾了蛋白质折叠理论的发展历程,然后对折叠中间体的研究现状作了较详细的介绍.同时,对折叠机理理论研究中的几种理论模型和模拟算法作了细致评述,分析了其现状和存在的问题.最后,总结和讨论了折叠机理理...
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【中文期刊】 张麟 卢滇楠 等 《生物加工过程》 2006年4卷3期 38-43页ISTICCABP
【摘要】 采用分子动力学方法和全原子模型研究尿素和水分子对模型蛋白S-肽链结构转化的影响.模拟结果显示S-肽链的变性速率常数k值随着尿素浓度的增加而先降低后升高,在尿素浓度为2.9 mol/L时达到最低值.模拟了不同尿素浓度下尿素-肽链、水-肽链以及...
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【中文期刊】 苏计国 王韦卜 等 《北京工业大学学报》 2017年43卷12期 1818-1827页
【摘要】 蛋白质折叠是结构生物学领域有待解决的重要科学问题,计算机模拟方法是研究蛋白质折叠的主要手段之一.对蛋白质折叠的计算机模拟研究进展进行了简要介绍,主要内容包括:全原子分子动力学模拟、Go模型以及弹性网络模型的主要思路及其在蛋白质折叠研究中的应...
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【中文期刊】 赵立岭 窦相华 等 《德州学院学报(自然科学版)》 2005年21卷2期 36-39页
【摘要】 蛋白质的去折叠有多条路径,而不是沿着一条特定的路径进行.利用分子动力学模拟技术,模拟蛋白质在高温下的去折叠过程,分析讨论了蛋白质折叠的多路径性.
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【外文期刊】 Siew N ; Elofsson A ; 等 《Bioinformatics》 2000年16卷9期 776-785页SCISCIEMEDLINE
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【外文期刊】 Brylinski M ; Konieczny L ; 等 《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 2006年23卷5期 519-528页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Computer Simulation;Models;Molecular;
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【外文期刊】 Baxa MC ; Freed KF ; 等 《Journal of Molecular Biology》 2009年386卷4期 920-928页SCISCIEMEDLINE
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