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【中文期刊】 李春华 马晓慧 等 《生物化学与生物物理进展》 2006年33卷7期 616-621页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 蛋白质分子间相互作用与识别是21世纪生命科学研究的前沿和热点.分子对接方法是研究这一课题有效的计算机模拟手段.通常,蛋白质-蛋白质分子对接包括四个阶段:搜索受体与配体分子间的结合模式,过滤对接结构以排除不合理的结合模式,优化结构,用精细的打...
【关键词】 蛋白质-蛋白质分子对接;过滤;打分函数;
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【中文期刊】 陆旭峰 陆振宇 等 《数据采集与处理》 2018年33卷4期 603-610页
【摘要】 分子对接是预测蛋白质复合物的有效手段.对于分子对接算法的优化旨在加速分子对接效率,降低计算成本,以及充分发挥计算资源的利用率.本文主要采用3个方案对半柔性对接算法进行优化:(1)方案一在CPU端进行优化;(2)方案二在方案一的基础上,利用C...
- 概要:
- 方法:
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【中文期刊】 江连洲 《中国食品学报》 2015年15卷8期 1-9页
【摘要】 对现有食用蛋白质加工技术进行总结,首次提出蛋白质柔性化加工技术概念,即通过物理、化学及生物加工方式改变蛋白质天然的刚性结构,使其柔性化,从而极大地提高蛋白质的工程特性、营养特性和生物功能等综合应用价值.
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【中文期刊】 康玲 李洪林 等 《应用基础与工程科学学报》 2008年16卷6期 802-810页
【摘要】 首先阐述了分子对接设计的基本原理,然后在蛋白质受体中引入关键残基的概念,建立了一个新的柔性分子对接模型.以配体的中心坐标以及它和受体关键残基的旋转键角为设计变量,以设计变量的尺寸为约束,通过最小化分子间相互作用能得到分子的最优取向和构象.一...
- 概要:
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【中文期刊】 康玲 李洪林 等 《大连理工大学学报》 2008年48卷2期 282-286页
【摘要】 分子对接是计算机辅助药物分子优化设计中的一种重要方法,为此建立了基于诱导契合的分子对接优化模型.模型中引入残基基团的概念,将蛋白质划分成若干个残基基团,通过这些残基基团的运动近似表征整个蛋白质的运动情况,并将配体小分子的运动处理为平移、转动...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 张晓慧 谷昊晟 等 《生物化学与生物物理进展》 2022年49卷3期 607-616页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 蛋白质的柔性运动对生物体各种反应有着重要意义,基于蛋白质的空间结构预测其柔性运动是蛋白质结构-功能关系领域的重要问题.卷积神经网络(convolutional neural network,CNN)在蛋白质结构-功能关系研究中已有成功...
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 刘继龙 苗智超 等 《生物化学与生物物理进展》 2016年43卷8期 810-816页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 蛋白质残基替换是基因突变的产物之一,它可能改变蛋白质三维结构,对其生物学功能产生重大影响,因此研究蛋白质残基替换与结构改变的关系具有重要意义.随着实验解析蛋白质结构的数量迅猛增长,越来越多的野生型-突变体被应用于结构生物学的比较研究中.本研...
- 概要:
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【中文期刊】 陈权 吕成 等 《生物工程学报》 2021年37卷12期 4415-4429页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 来源于粉红螺旋聚孢霉Clonostachys rosea的玉米赤霉烯酮水解酶(ZHD101)可以有效降解谷物农副产品和饲料中的霉菌毒素玉米赤霉烯酮(Zearalenone,ZEN),但是,该酶的热稳定性较低,限制了其在工业中的应用.由于水解...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李春华 马晓慧 等 《生物化学与生物物理学报》 2003年35卷1期 35-40页SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 提出了一种有效的软对接算法, 用于在已知受体和配体三维结构的条件下预测蛋白质-蛋白质复合物的结构. 该算法的分子模型基于Janin提出的简化蛋白质模型, 并在此基础上有所改进. 对蛋白质分子表面的柔性氨基酸残基Arg、Lys、Asp、Glu...
【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用;分子识别;分子柔性;
- 概要:
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- 结论:
【中文期刊】 朱志远 张燕 等 《中国临床药理学与治疗学》 2009年14卷11期 1308-1313页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 计算机技术的发展极大地促进了生命科学研究进程.利用分子对接技术研究受体蛋白和药物相互作用是当前的热点课题.通过分别建立蛋白质和药物分子模型,并对它们的相互作用进行研究,进而为发现并设计出更加理想、安全、有效的药物打下深厚的基础.分子模型建立...
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