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【中文期刊】 李春华 马晓慧 等 《生物化学与生物物理学报》 2003年35卷1期 35-40页SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 提出了一种有效的软对接算法, 用于在已知受体和配体三维结构的条件下预测蛋白质-蛋白质复合物的结构. 该算法的分子模型基于Janin提出的简化蛋白质模型, 并在此基础上有所改进. 对蛋白质分子表面的柔性氨基酸残基Arg、Lys、Asp、Glu...
【关键词】 蛋白质-蛋白质相互作用；分子识别；分子柔性；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 朱志远 张燕 等 《中国临床药理学与治疗学》 2009年14卷11期 1308-1313页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 计算机技术的发展极大地促进了生命科学研究进程.利用分子对接技术研究受体蛋白和药物相互作用是当前的热点课题.通过分别建立蛋白质和药物分子模型,并对它们的相互作用进行研究,进而为发现并设计出更加理想、安全、有效的药物打下深厚的基础.分子模型建立...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李瑞芳 于志芬 等 《生物物理学报》 2014年30卷7期 497-508页MEDLINEISTICCA
【摘要】 建立了一个包含核酸序列信息的蛋白质折叠数据库.以此为基础,对于每一个蛋白质,计算了其相应编码mRNA序列的茎结构含量、环结构含量、折叠自由能及mRNA的柔性等描述mRNA二级结构特征的基本参量.进一步分析了这些mRNA二级结构参量与相应蛋白...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 王宏瑞 陈阳 等 《生物物理学报》 2014年30卷5期 325-335页MEDLINEISTICCA
【摘要】 蛋白质与配体的相互作用在药物发现与筛选、功能食品开发等方面,都具有重要的科学意义.研究蛋白质-配体对接的目的在于通过已知配体和目标蛋白质的三维结构,运用计算手段来预测和评估蛋白质-配体复合物的三维构象,从而更好地理解蛋白质-配体之间的相互作...
【关键词】 蛋白质-配体柔性对接；蛋白质的柔性；配体的准备；
- 概要：
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【中文期刊】 刘董敏 常珊 等 《现代生物医学进展》 2012年12卷5期 979-983,987页ISTICCA
【摘要】 分子对接技术作为预测蛋白质-核酸复合物结构的有效方法,为研究在生物学过程中蛋白质-核酸的相互作用提供了重要的工具.本文首先分析了当前蛋白质-核酸对接研究中的主要困难,例如构象变化和核糖磷酸骨架的带电性问题.然后从构象搜索、打分函数、柔性策略...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【会议论文】侯旭奔 第一届《药学学报》药学前沿论坛暨2015年中国药学会中药与天然药物专业委员会会议 2015年
【摘要】 在计算机辅助药物设计研究中,大分子蛋白质结构的柔性是高通量虚拟筛选所面临的重要问题.近年来,随着结构生物学的飞速发展,越来越多的蛋白晶体结构被解析报道,因此,基于多个蛋白结构的整体对接(ensemble docking)技术可有效的处理蛋白...
- 概要：
- 方法：
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