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【中文期刊】 郭昭兴 万修华 《眼科新进展》 2024年44卷1期 76-79页 ISTICPKUCA
【摘要】 蛋白质聚集在白内障发病过程中扮演着重要角色.近年来,基因测序技术和其他分子生物学技术广泛应用于蛋白质聚集现象的研究,其内在机制被逐渐阐明.基因突变、异构化与共价修饰、化合物和离子作用、蛋白质相互作用均是蛋白质聚集发生的原因.本文围绕上述四点...
【中文期刊】 史宁 乃菲沙·买买提 等 《东南大学学报(医学版)》 2024年43卷3期 346-355页 ISTICCA
【摘要】 目的:探讨特发性肺纤维化(IPF)治疗的新途径.方法:通过生物信息学算法来探索与IPF进展相关的共同表达基因和生物途径.应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别两组数据集重叠的共表达基因模块.随后,利用GEO公共数据集公布的基因表达数据...
【中文期刊】 曾春艳 李俊 等 《南昌大学学报(医学版)》 2024年64卷5期 81-87页 ISTIC
【摘要】 目的 了解急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)的生物学和分子发病机制,为预防和治疗AP提供依据.方法 从基因表达总库数据库获取基因表达数据集GSE109227、GSE3644和GSE65146,其中包括AP小鼠和对照小鼠...
【中文期刊】 章广能 张育芳 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 287-295页 ISTIC
【摘要】 化合物-蛋白质互作的鉴定对药物发现、靶标鉴定,网络药理学和蛋白质功能的阐明等至关重要.本文开发了一种基于表示学习的图神经网络预测化合物-蛋白质互作模型.首先利用Word2vec表示学习方法自动提取化合物和蛋白质的特征;然后将特征输入构建图神...
【关键词】 化合物-蛋白质相互作用; 表示学习; 图神经网络;
【中文期刊】 汪居安 王居义 等 《安徽医药》 2023年27卷6期 1083-1087,后插1-后插2页 ISTICCA
【摘要】 目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨郁金-丁香药对抗肝纤维化的作用机制.方法 于2022年1月8日检索中药系统药理学数据平台(TCMSP)获取郁金和丁香的有效活性成分及相关靶点并进行筛选和预测;肝纤维化相关靶点的数据通过NCBI基因数据、...
【中文期刊】 吴娓娓 王建军 等 《神经疾病与精神卫生》 2023年23卷8期 550-556页 ISTIC
【摘要】 目的 使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别强迫症的共表达模块和枢纽基因.方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE60190数据集,对15例强迫症患者和14名健康对照者的尸脑背外侧前额叶皮质(DLPFC)基因表达数据进行分析.通过W...
【关键词】 强迫性障碍; 加权基因共表达网络分析; 功能富集分析;
【中文期刊】 宓庆坤 商立民 等 《军事医学》 2023年47卷3期 210-216,222页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 在酵母细胞中建立基于酵母增强型红色荧光蛋白(yEmRFP)的双分子荧光互补技术,用于直观地检测蛋白质相互作用.方法 利用分子克隆技术将yEmRFP的N端片段(1~159 aa,RN159)和C端片段(160~236 aa,RC160)...
【关键词】 双分子荧光互补; 蛋白质相互作用; 酵母增强型红色荧光蛋白;
【中文期刊】 李钰鑫 阎美卉 等 《世界中医药》 2022年17卷16期 2251-2257页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:采用网络药理学及分子对接研究"黄芪-附子"药对治疗慢性心力衰竭的作用靶点及其相关信号通路,并进一步分析其治疗慢性心力衰竭的潜在机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot数据库等获取黄芪-附子药对的活性...
【中文期刊】 马馨蕊 吕晓东 等 《世界中医药》 2022年17卷11期 1560-1564页 ISTICPKUCA
【摘要】 目的:运用网络药理学的研究方法探讨三子养亲汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对三子养亲汤中药物的化学成分、作用靶标进行检索与筛选;利用GeneCards数据库对COPD的相关...
【中文期刊】 吴怡 邵思梦 等 《分析化学》 2023年51卷1期 112-119页
【摘要】 利用超高效液相色谱-轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Orbitrap-MS)结合链霉亲和素包被的96孔板的方法筛选人参复杂体系中蓖麻凝集素120(RCA 120)的寡糖结合剂.将RCA 120修饰的96孔板与溶菌酶修饰的96孔板分别与寡糖标准...
【关键词】 超高效液相色谱-质谱技术; 人参; 寡糖;