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【中文期刊】 陈丽娜 王倩 等 《生物化学与生物物理进展》 2010年37卷5期 517-526页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 高通量的蛋白质互作数据与结构域互作数据的出现,使得在蛋白质组学领域内研究人类蛋白质结构互作网络,进一步揭示蛋白质结构与功能间的潜在关系成为可能.蛋白质上广泛分布的结构域被认为是蛋白质结构、功能以及进化的基本功能单元.然而,结合蛋白质的结构信...
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【学位论文】 作者:焦沛舜导师:李君一 哈尔滨工业大学 其他 电子信息(硕士) 2023年
【摘要】 高通量测序技术的发展使得基因组学进入到了信息时代,大规模的基因组测序项目产生了大量的DNA序列数据,为研究生物体的基因组提供了详细的信息。后基因组时代强调对基因组数据的功能性解释,蛋白质功能预测是在这一背景下应运而生,它致力于解释基因产物的...
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【学位论文】 作者:马雨导师:薛志东 华中科技大学 软件工程 软件工程(硕士) 2021年
【摘要】 蛋白质是生物体中的重要组成部分,与生命过程紧密关联,而结构域是蛋白质维持其结构特征的基本单元。一个蛋白质中通常有多个结构域,并且相同的结构域在不同的蛋白质中处在不同的位置。蛋白质之间发生相互作用涉及相应的结构域的结合,准确识别结构域对于蛋白...
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【学位论文】 作者:林明志导师:陈新 浙江大学 生物学 生物信息学(硕士) 2011年
【摘要】 分子相互作用网络是研究生物分子功能及调控的基础之一。目前,许多大规模实验已经运用于多种模式生物,如酵母、果蝇、线虫和人类,得到了大量的相互作用数据。同时,多个研究机构也相应地建立数据库,收集整理实验得到的相互作用数据。然而,在植物中,即使是...
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【中文期刊】 张梦棣 梁鸿艺 等 《西部中医药》 2024年37卷6期 61-68页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学和分子对接预测黄芪补肾活血汤治疗乳腺癌的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicines systems pharmacology platform,TCMS...
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【中文期刊】 那合雅 赵福全 《中国民族医药杂志》 2024年30卷11期 34-39页
【摘要】 目的:基于网络药理学研究蒙药豆蔻治疗失眠症的作用机制.方法:通过TCMSP数据库检索蒙药豆蔻的有效成分及相关靶点;通过Gene Cards、OMIM、TTD三个数据库搜索失眠症相关基因靶点;利用Venny 2.1.0获得疾病与药物交集靶点,...
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【中文期刊】 陈丹媛 罗敏 等 《现代消化及介入诊疗》 2023年28卷9期 1117-1124页ISTIC
【摘要】 目的 本研究目的是通过网络药理学及分子对接方法探寻龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制.方法 通过TCMSP数据库收集龙葵-肿节风药对活性成分;在TTD、DrugBank、Pharmgkb等疾病靶点数据库搜索汇总出胃癌基因靶点.利用Cytos...
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【中文期刊】 关宇航 王凤荣 《中医临床研究》 2023年15卷5期 106-111页
【摘要】 目的:探讨丹参-桃仁治疗稳定型心绞痛的作用机制.方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索丹参-桃仁的有效成分和相关靶点,利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-关键靶点"网络,从STRING平台生成蛋白质-蛋白质相互...
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【中文期刊】 唐婕 严建 《中医药临床杂志》 2023年35卷5期 953-960页
【摘要】 目的:基于网络药理学方法探讨白芷治疗溃疡性结肠炎(UC)作用机制.方法:通过TCMSP筛选白芷的活性成分;采用uniprot数据库筛选矫正白芷的活性成分对应靶点,采用Cytoscape3.8.2 软件构建"白芷-白芷活性成分-活性成分作用靶...
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【中文期刊】 欧阳玉梅 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷3期 280-287页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 结构域是进化上的保守序列单元,是蛋白质的结构和功能的标准组件.典型的两个蛋白质间的相互作用涉及特殊结构域间的结合,而且识别相互作用结构域对于在结构域水平上彻底理解蛋白质的功能与进化、构建蛋白质相互作用网络、分析生物学通路等十分重要.目前,依...
【关键词】 蛋白质相互作用(PPI);蛋白质结构域;结构域相互作用(DDI);
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