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【中文期刊】 万晓耕 《生物信息学》 2021年19卷1期 35-46页ISTIC
【摘要】 蛋白质的序列、结构和功能多种多样.大量研究表明蛋白质的结构与其氨基酸序列的排序有关,并且局部的氨基酸序列环境对蛋白质的结构具有一定的影响.本文提出一种新的基于5-mer氨基酸扭转角统计偏好的蛋白质结构类型预测方法,在该方法通过PDB数据库中...
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【中文期刊】 郑斌 厉力华 《中国生物医学工程学报》 2013年32卷5期 580-587页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 蛋白质序列特征表示和机器学习算法是影响蛋白质结构类预测效果好坏的两个重要方面.本研究基于k-字统计频率和k-片段位置分布两种特征提取方法,将分别提取到的氨基酸序列信息和物理化学性质信息同蛋白质二级结构信息进行融合,建立17维和57维的特征信...
【关键词】 蛋白质结构类预测；特征信息集；Ma-Ada多分类器融合；
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【中文期刊】 林建春 《生物学通报》 2019年54卷12期 27-29页ISTICCA
【摘要】 NCBI数据库为生物学科研及教学工作人员提供了多种生物学数据库检索服务.介绍 NCBI数据库在高中生物学教学中的应用,可通过种属数据库查询生物分类地位、通过核酸数据库查询生物间亲缘关系,以及通过蛋白质信息数据库查询了解蛋白质结构等,列举了 ...
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【中文期刊】 李楠 李春 《生物信息学》 2012年10卷4期 238-240页ISTIC
【摘要】 基于氨基酸的16种分类模型,给出蛋白质序列的派生序列,进而结合加权拟熵和LZ复杂度构造出34维特征向量来表示蛋白质序列.借助于贝叶斯分类器对同源性不超过25％的640数据集进行蛋白质结构类预测,准确度达到71.28％.
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【中文期刊】 张天驰 张菁 《生物信息学》 2011年09卷2期 142-145页ISTIC
【摘要】 蛋白质折叠过程模拟是当前蛋白质研究领域的一个难点问题.针对这一问题,提出了一个描述蛋白质折叠过程的算法一拟蛇算法,并且从分子振荡和分子动力学理论两个方面来证明该算法的核心函数是可行和正确的.经过实验总结出所有蛋白质空间结构都可以通过两种类型...
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【中文期刊】 梅娟 何胜 等 《食品与生物技术学报》 2010年29卷1期 123-127页
【摘要】 蛋白质的远同源性探测是结构基因组学和功能基因组学的主要研究任务之一.一些具有一定相似结构和功能、但序列相似性却较低的蛋白质组成蛋白质超家族,则远同源性探测问题等价于对蛋白质超家族的识别问题.作者提出了一种基于模块性的聚类算法ModuleFi...
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【中文期刊】 秦永芳 李登弟 等 《细胞生物学杂志》 2009年31卷4期 514-520页MEDLINEISTICCSCDCA
【摘要】 同源异型-亮氨酸拉链(HD-Zip)蛋白是属于同源异型盒蛋白家族中为植物所特有的一类转录因子,它包含一个高度保守的同源异型结构域(HD),HD羧基末端紧密连接着一个亮氨酸拉链(LZ)结构域.通过LZ结构域的相互作用,HD-Zip蛋白以二聚体...
【关键词】 HD-Zip转录因子；蛋白质结构；分类；
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【学位论文】 作者：于晓丽 导师：韩榕生 华北电力大学(北京) 华北电力大学 物理学 理学;理论物理（硕士） 2011年
【摘要】
生物信息学是一门新兴的采用计算机技术和信息技术研究生命科学中各种生物信息的表达，采集，存储，检索和分析的交叉学科，它是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科的相互渗透而又高度交叉形成的一门新兴学科。
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- 概要：
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【中文期刊】 施建宇 潘泉 等 《生物化学与生物物理进展》 2006年33卷2期 155-162页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 在不依赖于序列相似性的条件下,蛋白质折叠子识别是一种分析蛋白质结构的重要方法.提出了一种三层支持向量机融合网络,从蛋白质的氨基酸序列出发,对27类折叠子进行识别.融合网络使用支持向量机作为成员分类器,采用"多对多"的多类分类策略,将折叠子的...
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【中文期刊】 李晓琴 罗辽复 《生物化学与生物物理进展》 2002年29卷6期 938-941页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 给出了α型、β型、α/β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律.提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别(分类)的方法.以蛋白质二级结构主序列三联体为参数,利用Mahalanobis距离方法对上述4种结构型的蛋白质进行识...
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