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【中文期刊】 万晓耕 《生物信息学》 2021年19卷1期 35-46页ISTIC
【摘要】 蛋白质的序列、结构和功能多种多样.大量研究表明蛋白质的结构与其氨基酸序列的排序有关,并且局部的氨基酸序列环境对蛋白质的结构具有一定的影响.本文提出一种新的基于5-mer氨基酸扭转角统计偏好的蛋白质结构类型预测方法,在该方法通过PDB数据库中...
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【中文期刊】 郑斌 厉力华 《中国生物医学工程学报》 2013年32卷5期 580-587页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 蛋白质序列特征表示和机器学习算法是影响蛋白质结构类预测效果好坏的两个重要方面.本研究基于k-字统计频率和k-片段位置分布两种特征提取方法,将分别提取到的氨基酸序列信息和物理化学性质信息同蛋白质二级结构信息进行融合,建立17维和57维的特征信...
【关键词】 蛋白质结构类预测；特征信息集；Ma-Ada多分类器融合；
- 概要：
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【中文期刊】 张同亮 丁永生 《生物医学工程学杂志》 2008年25卷4期 921-924页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 提出了一种基于二叉树支持向量机(BT-SVM)的蛋白质结构类多类预测新方法.采用26维的向量来表示蛋白质序列的特征.BT-SVM多类分类方法能消除SVM在多分类问题中存在的不可分数据问题.采用两个经典数据集作为测试数据,通过自身一致性和n折...
- 概要：
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【中文期刊】 方慧生 王旻 等 《中国药科大学学报》 2006年37卷1期 77-82页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 在蛋白质天然构象预测中,折叠识别法中一致性预测Pcons2和从头预测法中的Rosetta在CASP5中获得了很大的成功.在Rosetta法中,先用Monte Carlo搜索法产生大量低能量的预测模型,然后依据模型之间相似性分数,用聚类分析法...
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【中文期刊】 李楠 李春 《生物信息学》 2012年10卷4期 238-240页ISTIC
【摘要】 基于氨基酸的16种分类模型,给出蛋白质序列的派生序列,进而结合加权拟熵和LZ复杂度构造出34维特征向量来表示蛋白质序列.借助于贝叶斯分类器对同源性不超过25％的640数据集进行蛋白质结构类预测,准确度达到71.28％.
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【中文期刊】 姜小莹 朱俊东 等 《生物物理学报》 2008年24卷1期 43-48页MEDLINEISTICCA
【摘要】 蛋白质结构类预测是生物信息和蛋白质科学中重要的研究领域.基于Chou提出的伪氨基酸离散模型框架,从蛋白质序列出发,设计一种新的伪氨基酸组成方法表示蛋白质序列样本.抽取氨基酸组合(10-D)在序列中出现的频率和疏水氨基酸模式(6-D)表示蛋白...
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【中文期刊】 闫化军 章毅 《生物信息学》 2004年2卷4期 19-24,41页ISTIC
【摘要】 运用加入竞争层的BP网络,研究了基于蛋白质二级结构内容的域结构类预测问题.在BP网络中嵌入一竞争,层显著提高了网络预测性能.仅使用了一个小的训练集和简单的网络结构,获得了很高的预测精度:自支持精度97.62%,jack-knife测试精度9...
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【中文期刊】 陶海波 马圣 等 《黑龙江科技信息》 2015年17期 43页
【摘要】 蛋白质结构类型是蛋白质高级结构中基本原件的空间分布,是蛋白质高级结构与功能研究的基础,该研究对蛋白质组学具有重要意义.通过传统实验方法研究蛋白质结构类需要耗费大量的人力、财力、物力,也无法满足数据库中蛋白质序列爆炸性增长的现实需要.目前,基...
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【学位论文】 作者：郑斌 导师：厉力华 杭州电子科技大学 控制科学与工程 控制工程（硕士） 2013年
【摘要】 随着人类基因组计划的完成以及生物测序技术的发展,大量的蛋白质序列信息数据不断涌现出来。然而人们对蛋白质高级结构和功能的认识还不够,远远落后于对蛋白质序列的认识。同时通过传统的生物实验方法已经无法满足海量数据的处理需求,因此非常有必要探讨借助...
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【学位论文】 作者：向其林 导师：廖波 湖南大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2012年
【摘要】 蛋白质在生命活动中拥有着不可替代的功能，对蛋白质的研究也越来越重要。其中蛋白质结构类的预测在蛋白质的很多相关属性的预测中起到了重要的作用，如：蛋白质亚细胞定位、膜蛋白类型、G蛋白耦联体类型、酶家族类，蛋白质四级结构类型、与酶的活性等等。因此...
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