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【中文期刊】 刘洋 池晴佳 等 《西安交通大学学报(医学版)》 2025年46卷1期 169-177页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8+T细胞相关的生物标志物并建立预后模型.方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组...
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【中文期刊】 孙熠伟 徐淑坦 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷6期 561-577页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)在揭示细胞异质性方面具有重要意义,但现有细胞类型注释方法存在着跨物种适应性、泛化性、类别不平衡等问题.本文提出了一种基于图注意力网络(graph a...
【关键词】 图注意力网络(GAT);单细胞转录组测序(scRNA-seq);细胞类型注释;
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【中文期刊】 沈阳阳 安振江 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷2期 522-533页
【摘要】 [目的]探究徐州牛不同嫩度背最长肌间的基因表达差异,挖掘相关调控基因和信号通路,为进一步研究徐州牛肌肉生长调控的作用机制提供理论依据.[方法]本研究以江苏地方特色牛种——徐州牛为研究对象,屠宰后对背最长肌进行剪切力测定,依据剪切力值大小分为...
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【中文期刊】 李志毅 李洁 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷4期 1681-1693页
【摘要】 [目的]探索藏鸡胚胎期与骨骼肌生长发育相关的微小RNA(miRNA),对其进行差异表达分析并构建miRNA-mRNA调控网络,为进一步了解miRNA在鸡肌肉生长发育过程中的调控机制提供理论基础.[方法]采集藏鸡胚胎期第10(E10)、14(...
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【中文期刊】 任灏 朱怡轩 等 《中国畜牧兽医》 2025年52卷6期 2494-2505页
【摘要】 [目的]筛选快、慢生长速度撒坝猪背最长肌组织中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),并探讨其在猪生长发育过程中的重要作用.[方法]选择322日龄体重最大和最小的撒坝猪各6头(公、母各3头),分为快长组(...
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【中文期刊】 宋敏 钟晓 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷9期 1548-1564页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 合理密植是提高甘蓝型油菜(Brassica napus)产量的重要途径.为探讨油菜对密植的分子响应,本研究以耐密植和不耐密植甘蓝型油菜品种为研究对象,在常规密度和高密度种植条件下对其上位叶和下位叶进行转录组测序.经比较分析,在两品种的上位叶...
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【中文期刊】 韩馨怡 张倩倩 等 《临床口腔医学杂志》 2024年40卷4期 195-199页ISTIC
【摘要】 目的:探索口腔白斑形成及进展过程中的转录组学特征和信号通路改变以及白介素17A(interleukin-17A,IL-17A)单抗对小鼠舌白斑的治疗作用.方法:分析舌白斑患者同时期正常黏膜组织(NM)、白斑伴上皮异常增生组织(OL)和小鼠正...
【关键词】 转录组测序;IL-17信号通路;4NQO小鼠口腔白斑模型;
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【中文期刊】 夏铭隆 肖银涛 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷9期 3703-3714页
【摘要】 [目的]分析不同日龄宁乡猪背最长肌组织mRNA表达谱,筛选发育过程中与脂肪沉积相关的差异表达基因及其所参与的信号通路,并确定部分关键基因在肌内脂肪发育过程中的表达特征.[方法]选取30(D30)和250(D250)日龄宁乡猪各3头,采集背最...
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【中文期刊】 睢建亮 王珍 等 《医学信息》 2024年37卷19期 19-26页
【摘要】 目的 研究富氢水对小鼠急性肝损伤的保护作用.方法 60 只雄性KM小鼠随机分为空白组、模型组、阳性对照组、富氢水低剂量组、富氢水中剂量组和富氢水高剂量组.除空白组外,各组小鼠腹腔注射 0.3%的CCl4 制备急性肝损伤模型.观察肝脏的形态变...
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【中文期刊】 周蜓蜓 李立 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷10期 4290-4301页
【摘要】 单细胞转录组代表了某一时刻单个细胞内所有mRNA总表达量,其表达量反映该细胞的总体特征.通过单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序,测序结...
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