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【中文期刊】 徐琪 禹雷 等 《海南医学》 2024年35卷11期 1533-1544页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点.方法 首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验...
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【中文期刊】 蔡蔷薇 孙锋 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷1期 29-41页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·通过单细胞核转录组分析,探讨多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)中小胶质细胞在灰质与白质的基因差异性表达及其在疾病进展中的作用,鉴定疾病相关的关键转录调控网络.方法·从基因表达数据库(Gene Expressio...
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【中文期刊】 赵霈 杨二鹏 等 《世界中西医结合杂志》 2025年20卷1期 126-135页ISTIC
【摘要】 目的 基于转录组学,构建原发性血小板增多症(Essential thrombocythemia,ET)相关lncRNA-miR-NA-mRNA调控网络,并寻找龙柴降血方发挥治疗作用的靶点.方法 纳入28例ET患者和14例健康人.其中10例患...
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【中文期刊】 杨晓曦 何松 等 《生物工程学报》 2022年38卷10期 3844-3858页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究旨在利用生物信息学方法构建经铜诱导的ATP7B基因敲除HepG2细胞系的转录调控网络.探讨关键转录因子在肝豆状核变性发生、发展中的潜在作用机制.收集公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中包含野生...
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【中文期刊】 令狐熙涛 桂佳琦 等 《中国组织工程研究》 2024年28卷36期 5811-5816页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:m6A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚.目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m6A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制.方法:在GEO数据库中检索并下载与...
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【中文期刊】 赵悦含 杨悦 等 《北华大学学报（自然科学版）》 2024年25卷3期 346-353页ISTICCA
【摘要】 目的 基于GEO数据库和转录因子调控网络筛选抗结核病药物及药物作用靶点.方法 通过NCBI的GEO数据库,筛选结核病患者和健康者之间差异表达的基因;通过AnimalTFDB 3.0数据库预测差异表达基因中的转录因子,并构建转录因子调控网络;...
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【中文期刊】 谢云霄 丁娜 《国际老年医学杂志》 2024年45卷2期 193-198页ISTIC
【摘要】 目的 分析识别癌症中甲基化改变对增强子活性的影响.方法 分别从人类增强子数据库FANTOM5、甲基化DNA结合转录因子数据库MeDReaders及分子特征数据库MSigDB中获取增强子、转录因子结合位点及分子通路数据等信息,识别受甲基化影响...
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【中文期刊】 饶志坚 张建红 等 《中国运动医学杂志》 2023年42卷12期 987-1000页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 运动因子是指运动诱导骨骼肌和其它器官释放的生物活性分子,包括蛋白质或多肽类物质、RNAs(mRNA、非编码RNA和线粒体DNA等)和代谢产物.运动因子参与调控了组织/器官对运动的反应和适应,它是运动产生健康效益的重要介质之一.本文通过CNK...
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【中文期刊】 李昱剑 阚璇 《天津医科大学学报》 2023年29卷3期 235-242页ISTIC
【摘要】 目的:筛选支气管哮喘的差异表达基因(DEGs)并构建相应的ceRNA调控网络.方法:从GEO数据库中筛选出两个数据集:GSE43696 和GSE64913.用R软件的Limma包筛选DEGs并用ClusterProfiler包完成富集分析....
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【中文期刊】 谢丽君 《癌症进展》 2023年21卷6期 609-614,666页ISTIC
【摘要】 目的 对甲状腺乳头状癌(PTC)、滤泡状甲状腺癌(FTC)、甲状腺未分化癌(ATC)、甲状腺髓样癌(MTC)的共同调控网络进行转录组学整合研究,分析它们之间重要的特异调节因子和调节信号通路.方法 在基因表达综合数据库(GEO)中的高通量基因...
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