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【中文期刊】 徐琪 禹雷  等 《海南医学》 2024年35卷11期 1533-1544页 ISTICCA

【摘要】 目的 探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点.方法 首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验...

【关键词】 结直肠癌； 单细胞多组学数据； 转录调控网络；

【中文期刊】 杨晓曦 何松  等 《生物工程学报》 2022年38卷10期 3844-3858页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 本研究旨在利用生物信息学方法构建经铜诱导的ATP7B基因敲除HepG2细胞系的转录调控网络.探讨关键转录因子在肝豆状核变性发生、发展中的潜在作用机制.收集公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中包含野生...

【关键词】 肝豆状核变性； ATP7B基因敲除； 差异表达基因；

【中文期刊】 令狐熙涛 桂佳琦  等 《中国组织工程研究》 2024年28卷36期 5811-5816页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:m6A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚.目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m6A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制.方法:在GEO数据库中检索并下载与...

【关键词】 激素性股骨头坏死； m6A甲基化； 微小RNA；

【中文期刊】 赵悦含 杨悦  等 《北华大学学报（自然科学版）》 2024年25卷3期 346-353页 ISTICCA

【摘要】 目的 基于GEO数据库和转录因子调控网络筛选抗结核病药物及药物作用靶点.方法 通过NCBI的GEO数据库,筛选结核病患者和健康者之间差异表达的基因;通过AnimalTFDB 3.0数据库预测差异表达基因中的转录因子,并构建转录因子调控网络;...

【关键词】 结核病； 药物靶点； GEO数据库；

【中文期刊】 谢云霄 丁娜  《国际老年医学杂志》 2024年45卷2期 193-198页 ISTIC

【摘要】 目的 分析识别癌症中甲基化改变对增强子活性的影响.方法 分别从人类增强子数据库FANTOM5、甲基化DNA结合转录因子数据库MeDReaders及分子特征数据库MSigDB中获取增强子、转录因子结合位点及分子通路数据等信息,识别受甲基化影响...

【关键词】 增强子； 甲基化； 转录调控网络；

【中文期刊】 饶志坚 张建红  等 《中国运动医学杂志》 2023年42卷12期 987-1000页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 运动因子是指运动诱导骨骼肌和其它器官释放的生物活性分子,包括蛋白质或多肽类物质、RNAs(mRNA、非编码RNA和线粒体DNA等)和代谢产物.运动因子参与调控了组织/器官对运动的反应和适应,它是运动产生健康效益的重要介质之一.本文通过CNK...

【关键词】 运动； 运动因子； 转录因子；

【中文期刊】 李昱剑 阚璇  《天津医科大学学报》 2023年29卷3期 235-242页 ISTIC

【摘要】 目的:筛选支气管哮喘的差异表达基因(DEGs)并构建相应的ceRNA调控网络.方法:从GEO数据库中筛选出两个数据集:GSE43696 和GSE64913.用R软件的Limma包筛选DEGs并用ClusterProfiler包完成富集分析....

【关键词】 哮喘； ceRNA调控网络； lncRNA；

【中文期刊】 谢丽君  《癌症进展》 2023年21卷6期 609-614,666页 ISTIC

【摘要】 目的 对甲状腺乳头状癌(PTC)、滤泡状甲状腺癌(FTC)、甲状腺未分化癌(ATC)、甲状腺髓样癌(MTC)的共同调控网络进行转录组学整合研究,分析它们之间重要的特异调节因子和调节信号通路.方法 在基因表达综合数据库(GEO)中的高通量基因...

【关键词】 甲状腺癌； 差异表达基因； 关键节点；

【中文期刊】 王晓童 向丽  等 《世界中医药》 2022年17卷13期 1802-1812页 ISTICPKUCA

【摘要】 目的:黄芩中主要活性成分黄酮类化合物的生物合成途径已解析,但相关调控机制研究薄弱.本研究基于黄芩全基因组对SbMYB转录因子进行系统鉴定和分析,筛选可能参与黄酮类化合物生物合成的候选SbMYB家族成员.方法:通过HMMER和BLAST筛选S...

【关键词】 黄芩； MYB转录因子； 黄酮类化合物；

【中文期刊】 陈兰 蔡伦  等 《生物化学与生物物理进展》 2008年35卷1期 35-42页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 协作网通常被用于描述各种社会关系,相似的概念也可以应用到转录调控网络的研究中.针对被调控基因共享转录因子的相似性,可以建立一个被调控基因协作网,同样,根据转录因子调控基因的相似性可以建立一个相对较小的转录因子协作网.对被调控基因协作网的聚类...

【关键词】 转录调控网络； 协作网； 异常点；