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【中文期刊】 王友娟 赵东波  等 《物理化学学报》 2013年29卷10期 2173-2179页

【摘要】 寻找确定分子体系构象稳定性的关键因素是至关重要的,但即使对最简单的分子,其稳定性的起源和本质仍存在很大的争议.本文以水团簇为例,采用量子分子动力学产生185个八聚水分子团簇模型,并运用基于密度泛函理论的两个能量分解方法寻找其稳定性的决定因素...

【关键词】 水分子团簇； 量子分子动力学； 密度泛函理论；

【中文期刊】 郑明娜 董维亮  等 《生物加工过程》 2022年20卷4期 385-394页 ISTICCABP

【摘要】 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)废弃物在环境中的大量积累对全球生态系统造成了巨大威胁.基于低碳高效、绿色环保的目标,生物酶解聚技术已经成为应对PET塑料污染最具潜力的方法之一.近年来,随着计算机水平的发展,理论计算在探索解聚酶与PET寡聚体的...

【关键词】 聚对苯二甲酸乙二醇酯； 生物酶； 分子对接；

【中文期刊】 刘洪超 陈苏航  等 《化工学报》 2022年73卷7期 2835-2843页

【摘要】 作为纳米载体,石墨烯量子点已广泛应用于生物医药领域,然而对于异质结构的石墨烯量子点细胞膜内化路径研究不足.从空间异质性结构设计出发,构建了一系列不同氧化程度与空间异质分布的Janus石墨烯量子点.基于分子动力学模拟研究了不同结构的Janus...

【关键词】 跨膜输运； Janus石墨烯量子点； 分子动力学；

【中文期刊】 王哲 王普  等 《化工进展》 2013年10期 2475-2479,2485页

【摘要】 脂肪酶是一种重要的生物催化剂，其来源广泛，可在水相甚至非水介质中催化多种反应，并表现出很高的立体选择性和催化活性。有关脂肪酶的应用和基础研究备受重视，特别是脂肪酶催化机理和结构功能关系成为近年来研究热点，基于现代计算机技术的分子模拟计算在相...

【关键词】 分子模拟； 分子动力学； 分子对接；

【中文期刊】 高宇飞 孟庆元  等 《物理化学学报》 2012年28卷5期 1077-1084页

【摘要】 采用基于声子散射理论的Boltzmann-Peierls声子传输方程(BTE)和非平衡态分子动力学模拟(NEMD)方法研究了氮化硼纳米管(BNNT)的热输运性能.分析了BNNT的热力耦合效应,通过BTE与NEMD两种方法相结合,分析了温度和...

【关键词】 氮化硼纳米管； 热输运性能； Boltzmann-Peierls声子传输方程；

【中文期刊】 马咏梅 杨珊  《广州化工》 2012年40卷21期 14-15,56页

【摘要】 综述了四种常用的分子模拟方法：即量子力学方法、分子力学方法、蒙特卡洛方法和分子动力学方法在聚合物性质研究中的应用。四种方法各有优势,共同与计算机模拟成为密不可分的组成部分。

【关键词】 量子力学； 分子力学； 蒙特卡洛；

【中文期刊】 周卫红 苗志伟  等 《天津师范大学学报(自然科学版)》 2003年23卷3期 1-3页

【摘要】 利用X-射线晶体结构数据及多种计算方法,研究了多齿配体二(2-苯并咪唑亚甲基)胺的最低能量构象和配位构象. 分析表明两种构象截然不同,最低能量构象中两个苯并咪唑平面互相平行,有芳环堆积效应,而配位构象则整个分子张开,有利于金属离子的进攻.

【关键词】 二(2-苯并咪唑亚甲基)胺； 分子力学； 分子动力学；

【中文期刊】 刘海燕  《生物工程学报》 2019年35卷10期 1819-1828页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 文中介绍用于工业酶研究特别是用于指导酶工程的主要计算化学方法,包括分子力学力场和分子动力学模拟、量子力学以及量子力学/分子力学结合模型、连续介质静电模型以及分子对接等.文中从以下两个角度分别概要地介绍这些方法:一是方法本身的基本概念、原始计...

【关键词】 分子力学； 分子动力学； 量子力学/分子力学；

【中文期刊】 王汇滨 王颖  等 《中国药物化学杂志》 2021年31卷10期 797-804页 ISTICCA

【关键词】 PI2K α/β； 选择性抑制剂； 分子动力学；

【中文期刊】 李博 郭立玮  等 《中国实验方剂学杂志》 2014年20卷5期 1-6页 ISTICPKUCSCDCA

【关键词】 黄连解毒汤； 分子动力学仿真； 相互作用；