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【中文期刊】 杨振华 《河北北方学院学报（自然科学版）》 2025年41卷1期 30-36页
【摘要】 随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据.为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要.综述了 4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2015年5期 321-331页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 A faithful phylogeny and an objective taxonomy for prokaryotes should agree with each other and ultimately follow the ge...
- 概要：
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【中文期刊】 曹跃 夏云 等 《四川动物》 2018年37卷3期 261-267页ISTICPKU
【摘要】 动物线粒体基因组发生局部串联复制后,涉及区域具有多基因拷贝、假基因化、大量插入缺失的特点,难以排序和构建基因树.而不依赖排序的聚类方法理论上可用来归纳和展示这类序列的差异,但未见相关评估和运用.本研究选取棘腹蛙Quasipaa boulen...
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【中文期刊】 邵晨 高友鹤 《色谱》 2010年28卷2期 128-134页
【摘要】 液相色谱与串联质谱联用(LC-MS/MS)技术是蛋白质组学研究中的常见方法.保留时间作为独立于质谱信息的参数已经被用于蛋白质的鉴定和定量工作中.在多肽鉴定领域,多肽的色谱保留时间预测与常规的二级串联质谱数据库搜索算法结合可以提高鉴定的可信度...
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【中文期刊】 吴蔚 张梦洁 等 《兽类学报》 2018年38卷2期 174-182页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 非序列联配的序列分析方法,将序列中特定寡聚核苷酸的kmer统计频率作为特征,在序列间按特征进行比较和分析.这种方法综合考虑了所有变异类型对序列整体特征的影响,因而在组学数据分析上有独特的优势.但是,这类方法在复杂多细胞生物基因组系统发育中的...
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- 方法：
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【外文期刊】 Dey, Sudeshna ; Das, Subhram ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2023年91卷1期 93-131页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Evolutionary relationship;Alignment-free method;Alignment-based method;
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【外文期刊】 AkitoTaneda ; 《Computational biology and chemistry》 2005年29卷2期 111-119页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Secondary structure prediction;Free-energy minimization;Sequence alignment;
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【外文期刊】 Sankarasubramanian, Jagadesan ; Vishnu, Udayakumar S. ; 等 《Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases》 2016年41卷 213-217页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Cruz-Barbosa, Raul ; Vellido, Alfredo ; 等 《Medical and Biological Engineering and Computing: Journal of the International Federation for Medical and Biological Engineering》 2015年53卷2期 137-149页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Class C G protein-coupled receptors;Semi-supervised learning;Alignment-free sequence representations;
- 概要：
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【外文期刊】 Yang, Lianping ; Zhang, Xiangde ; 等 《Journal of Theoretical Biology》 2016年395卷 23-30页SCISCIEMEDLINE
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