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【中文期刊】 吴蔚 张梦洁 等 《兽类学报》 2018年38卷2期 174-182页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 非序列联配的序列分析方法,将序列中特定寡聚核苷酸的kmer统计频率作为特征,在序列间按特征进行比较和分析.这种方法综合考虑了所有变异类型对序列整体特征的影响,因而在组学数据分析上有独特的优势.但是,这类方法在复杂多细胞生物基因组系统发育中的...
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【中文期刊】 曹跃 夏云 等 《四川动物》 2018年37卷3期 261-267页ISTICPKU
【摘要】 动物线粒体基因组发生局部串联复制后,涉及区域具有多基因拷贝、假基因化、大量插入缺失的特点,难以排序和构建基因树.而不依赖排序的聚类方法理论上可用来归纳和展示这类序列的差异,但未见相关评估和运用.本研究选取棘腹蛙Quasipaa boulen...
- 概要：
- 方法：
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【外文期刊】 Dey, Sudeshna ; Das, Subhram ; 等 《Journal of Molecular Evolution》 2023年91卷1期 93-131页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Evolutionary relationship;Alignment-free method;Alignment-based method;
- 概要：
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【外文期刊】 Pandit, A. ; Dasanna, A.K. ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2012年62卷2期 756-763页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Alignment-free method;HIV-1 subtypes;Multifractal analysis;
- 概要：
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【外文期刊】 Amado Cattaneo, Raul Martin ; Diannbra, Luis ; 等 《Mitochondrial DNA, Part A》 2018年29卷7/8期 1128-1138页
【关键词】 Assembly and alignment-free method;phylogenomics;k-mers;
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【外文期刊】 Tang, Runbin ; Yu, Zuguo ; 等 《Molecular phylogenetics and evolution》 2023年179卷 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Alignment -free method;K -mer pair;Inner distance distribution;
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【外文期刊】 Czerniecka, Agata ; Bielinska-Waz, Dorota ; 等 《Genomics》 2016年107卷1期 16-23页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 Similarity/dissimilarity analysis of protein sequences;Descriptors;Alignment-free methods;
- 概要：
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【外文期刊】 Allman, Elizabeth S. ; Rhodes, John A. ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2017年24卷2期 153-171页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Ragan, Mark A. ; Chan, Cheong Xin ; 《Journal of Molecular Evolution》 2013年77卷1/2期 1-2页SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Thornton, Micah ; Mcgee, Monnie ; 2022年29卷5期 453-464页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 alignment-free methods;Fourier transform;genomic sequences;
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- 方法：
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