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【中文期刊】 张荣 赵观胜 等 《化学物理学报》 2009年22卷5期 511-516页
【摘要】 采用分子动力学模拟方法结合核磁共振化学位移和粘度对尿素水溶液在稀浓度范围内的结构和弱相互作用进行研究.从径向分布函数(RDF)分析看出,尿素水溶液中存存着几种不同类型、不同氢键形成能力的传统氢键.氢键网络分析发现尿素水溶液体系在水富集区域,...
【外文期刊】 Xu, WX ; Yang, Y ; 等 《Molecular simulation》 2008年34卷6/7期 575-590页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 global optimisation; all-atom simulation; replica-exchange with scaled hybrid Hamiltonian;
【外文期刊】 Munoz V ; Ghirlando R ; 等 《Biochemistry》 2006年45卷23期 7023-7035页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS; FREE-ENERGY LANDSCAPE; INTRAMOLECULAR CONTACT FORMATION;
【外文期刊】 Capriotti, Emidio ; Norambuena, Tomas ; 等 《Bioinformatics》 2011年27卷8期 1086-1093页 SCISCIEMEDLINE
【外文期刊】 Chen, W.W. ; Yoon, Y.-J. ; 等 《Molecular simulation》 2013年39卷10/13期 849-859页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 all atom and coarse-grained molecular dynamics; antimicrobial peptides; dimer of human b-defensin;
【外文期刊】 Miao, YL ; Ortoleva, PJ ; 《Biopolymers: Original Research on Biomolecules and Biomolecular Assemblies》 2010年93卷1期 61-73页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 structural transition mechanisms; all-atom multiscale; molecular dynamics/order parameter extrapolation (MD/OPX);
【外文期刊】 Du Pont, Kelly E. ; Davidson, Russell B. ; 等 2020年295卷6期 1551-1564页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 flavivirus; RNA helicase; molecular dynamics;
【外文期刊】 Viswanath, Shruthi ; Dominguez, Laura ; 等 《Proteins: Structure, Function, and Genetics》 2015年83卷12期 2170-2185页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 protein-protein docking; transmembrane complexes; membrane potential;
【外文期刊】 Lu, M. ; Ma, J. ; 《Archives of Biochemistry and Biophysics》 2011年508卷1期 64-71页 SCISCIE
【关键词】 All-atom normal modes; Coarse-graining; Energy minimization;
【外文期刊】 Grasnick, D. ; Sternberg, U. ; 等 《European Biophysics Journal》 2011年40卷4期 529-543页 SCISCIEMEDLINE
【关键词】 β-Stranded secondary structure; All-atom MD simulations; Fusogenic peptides;
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