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【中文期刊】 Junpeng Shi Zhixi Tian  等 《分子植物（英文版）》 2023年1期 168-186页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Plant genomes are so highly diverse that a substantial proportion of genomic sequences are not shared among individuals....

【关键词】 plant pan-genome； genome assembly； structural variations；

【中文期刊】 王艳钗 张会  等 《电子学报》 2016年44卷7期 1561-1566页

【摘要】 本文提出了一种利用DNA纳米金颗粒共聚体的自组装过程解决图论中一个NP完全问题—连通度问题的DNA计算方法，构建了解决图的连通度问题的三维DNA自组装计算模型。根据设计的算法，首先需要根据具体的图的连通度问题设计用于自组装的DNA纳米金颗粒...

【关键词】 DNA计算； DNA纳米金颗粒； 图的连通度；

【会议论文】Pawika Manoch 2011 International Conference on Future Information Technology (ICFIT 2011) 2011年

【摘要】 This paper proposes the use of graph mining technique to improve genome assembly which based on de Bruijn graph approach...

【关键词】 Graph mining； Short read genome assembly； De Bruijn graph；

【外文期刊】 Pan, Tony ; Nihalani, Rahul ; 等 《IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics》 2020年17卷1期 136-148页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 De Bruijn graph; genome assembly; graph compaction;

【外文期刊】 Medvedev, P ; Brudno, M ; 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2009年16卷8期 1101-1116页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 bidirected flow; bidirected graph; Chinese postman;

【外文期刊】 Shien Huang ; Xinyu He ; 等 2021年22卷5期 bbab022-1-bbab022-11页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 genome assembly; similar genome; de Brujin graph;

【外文期刊】 Salmela, Leena ; Sahlin, Kristoffer ; 等 《Journal of computational biology: A journal of computational molecular cell biology》 2016年23卷5期 347-361页 SCISCIEMEDLINE

【关键词】 de novo assembly; dynamic programming; gap filling;

【外文期刊】 Hormozdiari, Farhad ; Eskin, Eleazar ; 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2015年13卷2期 MEDLINE

【关键词】 Genome assembly; De Bruijn graph; high-throughput sequencing;

【外文期刊】 Bilal Wajid ; Erchin Serpedin ; 等 《International journal of computational biology and drug design》 2015年8卷3期 226-250页

【关键词】 next generation sequencing; genome assembly; reference assisted assembly;

【外文期刊】 Hosseini, Zeinab Zare ; Rahimi, Shekoufeh Kolahdouz ; 等 《Journal of Bioinformatics and Computational Biology》 2021年19卷2期 MEDLINE

【关键词】 Short read genome assembly; Next Generation sequencing; de Bruijn graph;