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【中文期刊】 陈千姿 王晨  等 《蛇志》 2023年35卷2期 137-143页

【摘要】 目的 基于分子对接方法筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶的有效组分.方法 使用AutoDock Vina软件对徐长卿[Cynanchum paniculatum(Bunge)Kitag]中化合物与尖吻蝮蛇(Deinagkistrodon a...

【关键词】 尖吻蝮蛇； 蛇毒； 徐长卿；

【中文期刊】 李爱杰 姚祖福  等 《广东化工》 2023年50卷16期 237-240页

【摘要】 目前药物化学实验偏有机合成技能的培养,忽视了药物化学课程的主要内容.因此我们尝试在药物化学实验课程中构建Oseltamivir carboxylate与神经氨酸酶的分子对接虚拟仿真实验,帮助学生理解药物与靶蛋白的作用方式,提高学习兴趣.本研...

【关键词】 药物化学； AutoDock vina； 分子对接；

【中文期刊】 谭相端 吕良  《广东化工》 2022年49卷11期 222-224页

【摘要】 在药学本科生的药物设计学课程中,以细菌RNA聚合酶抑制剂的虚拟筛选为例,利用AutoDock vina软件对小分子化合物库进行分子对接虚拟筛选,用PyMOL和LigPlot软件进行结果分析.该教学案例的设计可以帮助学生理解基于分子对接的药物...

【关键词】 教学改革； 分子对接； AutoDock vina软件；

【中文期刊】 张媛 刘雨桐  等 《生物信息学》 2015年4期 251-256页 ISTIC

【摘要】 靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法AutoDock Vina和内部构建的疾病靶标数据库，采用分布式架构，构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证，最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶，验证了平台的实用...

【关键词】 老药新用； 毒副作用； 反向虚拟筛选；

【中文期刊】 宋新蕊 李达  等 《生物信息学》 2014年4期 300-304页 ISTIC

【摘要】 先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物，本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物，有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想，集成了AutoDock Vina和多个小分...

【关键词】 虚拟筛选； 超算平台； AutoDock Vina；

【中文期刊】 黄勇 陈晨  等 《生物信息学》 2012年10卷4期 248-253页 ISTIC

【摘要】 随着大量与细菌耐药相关的基因的发现和其表达蛋白结构的成功测定,从已有的化合物中通过计算机模拟方法筛选对耐药蛋白靶点有作用的候选化合物,成为了药物发现的一个标准途径.虚拟筛选在耐药基因抑制剂的发现中可以提高效率、降低实验成本.本文介绍了Aut...

【关键词】 虚拟筛选； 分子对接； Autodock Vina；

【外文期刊】 Adrian,Orjuela ; Johant,Lakey-Beitia ; 等 《Journal of Alzheimer's disease : JAD》 2021年82卷s1期 S321-S333页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 Alzheimer’s disease; AutoDock 4; AutoDock Vina;

【外文期刊】 Vicente,Galiano ; Pablo,Garcia-Valtanen ; 等 《Drug design, development and therapy》 2016年10卷 3163-3181页

【关键词】 ADMET; AutoDock/Vina; NS5 RNA-dependent RNA polymerase;

【外文期刊】 Rana M,Qasaymeh ; Dino,Rotondo ; 等 《Plants (Basel, Switzerland)》 2019年8卷11期

【关键词】 AutoDock Vina; Flavonoids; Molecular docking;

【外文期刊】 Robert,Rentzsch ; Bernhard Y,Renard ; 《Briefings in bioinformatics》 2015年16卷6期 1045-56页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 AutoDock Vina; benchmark; docking;