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          【中文期刊】 黄方亮  《生物信息学》 2015年2期 116-119页 ISTIC

          【摘要】 为了探索加快细菌基因组研究的方法,利用ABI PGM测序平台测定了1株单细胞硫还原地杆菌的基因组序列。测序共获得1.4 Gbp 数据,平均读长为177 bp。通过多个拼接软件并采用合适的组装策略,得到一个完整细菌基因组3.55 Mbp和一条...

          【关键词】 PGM测序平台细菌基因组测序ABI PGM Sequencing Platform

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          【中文期刊】 陈晨 张媛媛  等 《中国医药指南》 2013年14期 1-2页

          【摘要】 目的评价454 GS Junior 测序平台在细菌基因组测序中的应用价值。方法利用454 GS Junior 测序平台测定1株霍乱弧菌的基因组序列,组装注释后,与参考序列霍乱弧菌 O1埃尔托生物型菌株 N16961基因组序列进行比对。结果共...

          【关键词】 454 GS Junior 测序平台细菌基因组测序454 GS Junior Sequencing Platform

          浏览:187 被引:1 下载:4

          【中文期刊】 曹欣 刘婉婷  等 《基因组学与应用生物学》 2017年36卷7期 2897-2904页 ISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 高通量测序技术的发展以及成本的降低使得细菌基因组测序成为研究细菌的标准流程.但细菌基因组变异度大,近缘基因组修正以及基因组从头拼接各有利弊,如何准确获得更多的有效功能基因尚无系统性的研究.本研究对真实环境中分离的一株短小芽孢杆菌(Bacil...

          【关键词】 环境细菌修正拼接

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          【外文期刊】 Soon Keong,Wee ; Eric Peng Huat,Yap ; 《Current protocols》 2021年1卷9期 e242页

          【关键词】 De novo assembly; GALAXY; bacterial genomics;

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