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【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2019年17卷2期 211-218页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 As next-generation sequencing (NGS) technology has become widely used to identify genetic causal variants for various di...
【关键词】 Next-generation sequencing；Quality assessment；1000 Genomes Project；
- 概要：
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【中文期刊】 孙显赫 郭云波 等 《南方医科大学学报》 2011年31卷4期 610-614页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台.方法 构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列...
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【中文期刊】 甄一松 张伟丽 等 《生物信息学》 2011年09卷2期 138-141,145页ISTIC
【摘要】 R是用于统计计算和数据作图的编程语言和程序设计环境,能在多种平台下编译和运行.Bioconductor也是免费开源的程序设计环境,它主要基于统计编程语言R,用于基因组数据的分析.我们通过已发表的数据,包含斑马鱼心肌再生的生物芯片数据,分析源...
【关键词】 R；BioConductor；生物芯片；
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【中文期刊】 卢娟 郑剑锋 《实验与检验医学》 2015年6期 711-713,744页CA
【摘要】 目的：利用公共数据库挖掘肝癌发生过程的关键基因，为后续的功能验证奠定基础。方法以肝癌表达谱芯片数据GSE33006为例，采用免费开源的R/BioConductor分析工具，介绍基本分析步骤，对肝癌表达谱数据进行分析。结果芯片数据GSE330...
【关键词】 肿瘤数据库；基因表达；R/BioConductor；
- 概要：
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【中文期刊】 白聪聪 周先雷 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷2期 392-402页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4假基因12(CSPG4P12)在小细胞肺癌(SCLC)组织中的表达、与免疫浸润的关系及其对细胞生物学功能的影响,阐明其在SCLC发生发展中的作用.方法:通过ArrayExpress数据库检索获得的SCLC的E-...
【关键词】 硫酸软骨素蛋白多糖4假基因12；免疫浸润；遗传变异；
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【中文期刊】 陈方飞 刘雅玲 等 《西部中医药》 2025年38卷4期 47-52页ISTIC
【摘要】 目的:运用网络药理学方法探讨丹参-红花药对治疗糖尿病周围神经病变(diabetic pe-ripheral neuropathy,DPN)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medi...
- 概要：
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【中文期刊】 刘金响 张艳婷 等 《现代中西医结合杂志》 2025年34卷2期 197-203页ISTICCA
【摘要】 目的 基于网络药理学探讨麝香治疗脑出血(ICH)的分子机制,为进一步实验研究提供依据.方法 首先检索BATMAN-TCM数据库得到麝香的有效成分及靶基因;再检索Gene-Cards、数据库OMIM数据库以及DisGeNET数据库等疾病数据库...
- 概要：
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【中文期刊】 武国浩 付波 等 《中国口腔颌面外科杂志》 2025年23卷4期 340-346页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨Nemo样激酶(Nemo-like kinase,NLK)以及磷酸酶和张力蛋白同源物(phosphatase and tensin ho-molog deleted on chromosome ten,PTEN)在头颈部鳞癌(he...
- 概要：
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【中文期刊】 朱芳丽 马晓莹 等 《安徽医药》 2025年29卷8期 1618-1622,后插8页ISTICCA
【摘要】 目的 基于基因表达综合数据库(GEO)分析急性胰腺炎(AP)病人基因表达差异,并进行验证.方法 2023年9-12月从GEO数据库下载基因表达综合系列(GSE)24279基因数据,使用Bioconductor中的Limma包筛选差异表达基因...
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【中文期刊】 魏鹏程 王荣洁 等 《中国医药导刊》 2025年27卷8期 840-846页ISTIC
【摘要】 目的:基于网络药理学的理论框架,深入探讨三七治疗骨质疏松性骨折发挥作用的机制.方法:利用TCMSP数据库对三七主要活性成分和作用靶点进行筛选,应用GeneCards和OMIM数据库对骨质疏松性骨折相关靶点进行预测,使用微生信在线平台制作维恩...
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