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                【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2019年17卷2期 211-218页SCIMEDLINEISTICCSCDBP

                【摘要】 As next-generation sequencing (NGS) technology has become widely used to identify genetic causal variants for various di...

                【关键词】 Next-generation sequencingQuality assessment1000 Genomes Project

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                【中文期刊】 孙显赫   郭云波   等 《南方医科大学学报》 2011年31卷4期 610-614页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

                【摘要】 目的 研制一个基于高性能计算机和Linux下运行的采用B/S模式的微阵列数据处理平台.方法 构建以Apache服务器为平台的WEB服务器,采用Perl语言编程,整合R语言与Bioconductor中的微阵列数据分析软件包,满足寡核苷酸微阵列...

                【关键词】 微阵列生物信息学寡核苷酸微阵列

                浏览:284 被引:2 下载:26
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                【中文期刊】 甄一松   张伟丽   等 《生物信息学》 2011年09卷2期 138-141,145页ISTIC

                【摘要】 R是用于统计计算和数据作图的编程语言和程序设计环境,能在多种平台下编译和运行.Bioconductor也是免费开源的程序设计环境,它主要基于统计编程语言R,用于基因组数据的分析.我们通过已发表的数据,包含斑马鱼心肌再生的生物芯片数据,分析源...

                【关键词】 RBioConductor生物芯片

                浏览:379 被引:8 下载:4
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                【中文期刊】 卢娟   郑剑锋   《实验与检验医学》 2015年6期 711-713,744页CA

                【摘要】 目的:利用公共数据库挖掘肝癌发生过程的关键基因,为后续的功能验证奠定基础。方法以肝癌表达谱芯片数据GSE33006为例,采用免费开源的R/BioConductor分析工具,介绍基本分析步骤,对肝癌表达谱数据进行分析。结果芯片数据GSE330...

                【关键词】 肿瘤数据库基因表达R/BioConductor

                浏览:162 被引:2 下载:63
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                【中文期刊】 魏巧连   刘禹欣   等 《新中医》 2026年58卷5期 197-204页ISTICCA

                【摘要】 目的:基于网络药理学及动物实验验证分析四神煎治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取四神煎药物有效成分及对应靶点,并通过Uniprot数据库获取靶点的标准化基因名.通过Genecards...

                【关键词】 膝骨关节炎四神煎网络药理学

                浏览:1 被引:0 下载:1
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                【中文期刊】 吴淑艳   李利清   等 《航天医学与医学工程》 2026年37卷1期 17-23页MEDLINEISTICCA

                【摘要】 目的 以网络药理学和分子对接技术为基础,探讨加味辛夷散对变应性鼻炎(AR)的潜在治疗机制.方法 利用TCMSP数据库筛选加味辛夷散的活性成分和作用靶点.从GeneCards、OMIM数据库获得AR相关靶点,使用Venny2.1在线作图工具平...

                【关键词】 加味辛夷散变应性鼻炎网络药理学

                浏览:1 被引:0 下载:1
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                【中文期刊】 白聪聪   周先雷   等 《吉林大学学报(医学版)》 2025年51卷2期 392-402页ISTICPKUCSCDCA

                【摘要】 目的:探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4假基因12(CSPG4P12)在小细胞肺癌(SCLC)组织中的表达、与免疫浸润的关系及其对细胞生物学功能的影响,阐明其在SCLC发生发展中的作用.方法:通过ArrayExpress数据库检索获得的SCLC的E-...

                【关键词】 硫酸软骨素蛋白多糖4假基因12免疫浸润遗传变异

                浏览:14 被引:0 下载:7
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                【中文期刊】 张赫怡   张泽涵   等 《世界中医药》 2025年20卷21期 3816-3825页ISTICPKUCA

                【摘要】 目的:基于网络药理学和细胞实验探讨桑白皮-葶苈子配伍治疗慢性心力衰竭(CHF)可能的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获取桑白皮-葶苈子的化学成分,口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18...

                【关键词】 桑白皮葶苈子心衰合剂

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                【中文期刊】 陈方飞   刘雅玲   等 《西部中医药》 2025年38卷4期 47-52页ISTIC

                【摘要】 目的:运用网络药理学方法探讨丹参-红花药对治疗糖尿病周围神经病变(diabetic pe-ripheral neuropathy,DPN)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medi...

                【关键词】 糖尿病周围神经病变丹参红花

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                【中文期刊】 魏鹏程   王荣洁   等 《中国医药导刊》 2025年27卷8期 840-846页ISTIC

                【摘要】 目的:基于网络药理学的理论框架,深入探讨三七治疗骨质疏松性骨折发挥作用的机制.方法:利用TCMSP数据库对三七主要活性成分和作用靶点进行筛选,应用GeneCards和OMIM数据库对骨质疏松性骨折相关靶点进行预测,使用微生信在线平台制作维恩...

                【关键词】 中医中药骨质疏松性骨折三七

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