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【中文期刊】 罗静初 《生物信息学》 2025年23卷3期 165-174页ISTIC
【摘要】 基于局部序列相似性比对的数据库搜索系统BLAST是生物信息学领域常用工具之一.本文首先介绍数据库相似性搜索的基本概念,包括计分矩阵、空位罚分,以及灵敏度和特异度等;以血红蛋白alpha和beta亚基为例,说明BLAST搜索基本策略,包括分割...
- 概要：
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【中文期刊】 孙焕东 张成岗 等 《生物化学与生物物理进展》 2001年28卷3期 419-422页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容.NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具.虽然它提供了初步的将多条序列进行综合对齐的分析方案,但是实际效果却很不理想.在对Blast程序的输出结果进行仔细分析的基础...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 王晶 张丽伟 等 《基因组学与应用生物学》 2011年30卷6期 649-656页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 病程相关蛋白(pathogenesis related proteins,PRs)是病理或病理相关环境下诱导产生的一类蛋白,它的产生与积累是植物体应答生物或非生物胁迫的主要特征之一.近年来大量PR蛋白被鉴定,根据它们的结构特征,生物功能以及...
【关键词】 大豆；病程相关蛋白(PRs)；BLAST；
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【中文期刊】 刘德团 李婉莎 等 《生物技术通讯》 2011年22卷5期 617-622页ISTICCA
【摘要】 目的:分离与分析白马雪山流石滩地区植物狭果葶苈高温响应基因,研究高山植物高温耐受机制.方法:应用磁珠介导的抑制消减杂交分离差异表达序列标签(EST),通过测序与Blastx比对,用Blast2go程序进行功能注释和代谢路径分析.结果:大部分...
- 概要：
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【中文期刊】 翟俊斌 曹小利 等 《临床检验杂志》 2024年42卷7期 548-552页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨多黏菌素耐药基因(mobile colistin resistance,mcr)在肺炎克雷伯菌中的流行分布特点.方法 使用Aspera软件从NCBI基因组数据库下载肺炎克雷伯菌的基因组序列,采用CheckM v1.1.3和Ques...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 崔鹏飞 颜成 等 《中国预防兽医学报》 2024年46卷12期 1215-1221页
【摘要】 为了解2023年分离自我国广东省家鸭H1N4亚型禽流感病毒(AIV)GD/S1385株的生物学特性,本研究利用一步法RT-PCR扩增GD/S1385株全基因组,并利用二代测序平台对其全基因组测序.在GISAID数据库中经BLAST比对,并下...
【关键词】 H1N4亚型禽流感病毒；遗传进化；感染性；
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【中文期刊】 陈作舟 薛成海 等 《生物化学与生物物理进展》 2005年32卷2期 187-191页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 随着后基因组时代的到来,批量的测序,特别是EST的测序,逐渐成为普通实验室的日常工作.这些新的序列往往需要进行批量的Gene Ontology(GO)的注释及随后的统计分析.但是目前除了Goblet以外,并没有软件适合对未知序列进行批量的G...
【关键词】 Gene Ontology,功能基因组学,EST,BLAST,InterProScan,GOA；Gene Ontology；functional genomics；
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【中文期刊】 范能全 张玲 等 《中国医药生物技术》 2022年17卷5期 385-392页ISTIC
【摘要】 目的 制备新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的刺突蛋白(S)和核衣壳蛋白(N)重组抗原.方法 利用Blast程序检索目标序列SARS-CoV-2的S蛋白和N蛋白的同源序列,用SWISS-MODEL软件对目标序列进行结构建模,运用DISCO...
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【中文期刊】 梁春鸿 李丹蕾 等 《西南民族大学学报（自然科学版）》 2022年48卷3期 260-266页
【摘要】 为了明确鸟类Toll样受体(Toll-like Receptor,TLR)基因物种间拷贝数量差异和基因进化选择,本试验利用BLAST程序对73种鸟类基因组数据进行TLR基因的鉴定,将预测到的序列进行系统发育分析,分析其进化选择方向,探究鸟类...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 李志 孟茹 等 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 2025年43卷3期 335-339,344页MEDLINEISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 了解青海部分地区马属动物蜱媒梨形虫感染情况及其遗传进化特征,为该地区马梨形虫病的防控提供科学依据.方法 2023年3月-2024年7月在青海省海东、西宁、海西和海北4市(州)采集散养马属动物血液样品,提取基因组DNA,巢式PCR扩增1...
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