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【中文期刊】 李高原 王妍然 等 《基础医学与临床》 2023年43卷5期 739-744页ISTICCA
【摘要】 目的 对N-乙酰基转移酶10(NAT10)在人慢性髓原白血病细胞系K562中的RNA结合图谱进行描绘.方法 利用紫外交联免疫沉淀技术(eCLIP)捕获NAT10在K562细胞中结合的转录本集合,对其进行高通量测序,并对数据进行生物信息学分析...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 刘飞燕 《科学与信息化》 2021年20期 191-192页
【摘要】 在真核生物的信使RNA(mRNA)上存在多种转录后修饰,N6-甲基腺苷(m6A)是其中最常见的一种,在细胞生命进程中都起着至关重要的作用.因此,多种方法被开发用于检测复杂生物样品中RNA上的m6A修饰.本文阐述了几种常见的m6A定性或定量检...
【关键词】 N6-甲基腺苷(m6A);MeRIP-seq;MiCLIP;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 李星桥 《科学与信息化》 2021年19期 177-178页
【摘要】 RNA作为遗传信息的传递者,具有调控基因表达,翻译蛋白质等功能.然而,越来越多的研究表明,RNA相互作用对RNA行使生物学功能起到重要作用.目前有许多基于高通量测序的方法应用于RNA相互作用研究,然而不同的实验方法之间可能存在偏好性,同时R...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 Jianan Lin Zhengqing Ouyang 《定量生物学(英文版)》 2020年8卷2期 119-129页
【摘要】 Background: RNA binding proteins (RBPs) play essential roles in the regulation of RNA metabolism.Recent studies have dis...
【关键词】 RNA binding protein;CLIP-seq;RNA-seq;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 魏川川 任志军 等 《中国生物工程杂志》 2025年45卷4期 1-14页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:m6A修饰是细胞内最普遍存在的RNA修饰,然而目前线粒体是否存在m6A修饰并不清楚,基于miCLIP-seq和Nanopore sequencing多组学数据探究线粒体RNA m6A修饰及其调控特征.方法:通过建立新的计算方法,对现有...
【关键词】 线粒体;m6A修饰;miCLIP-seq;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 《分子植物(英文版)》 2020年13卷2期 278-294页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Precursor mRNA (pre-mRNA) splicing is essential for gene expression in most eukaryotic organisms.Previous studies from m...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 《细胞研究(英文版)》 2015年25卷7期 864-876页SCIMEDLINEISTICCSCDBP
【关键词】 HITS-CLIP/CLIP-seq;RNA-binding protein;alternative polyadenylation;
- 概要:
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【外文期刊】 Eric L. Van Nostrand ; Alexander A. Shishkin ; 等 《Methods: A Companion to Methods in Enzymology》 2017年126卷 29-37页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 CLIP-seq;eCLIP-seq;RNA binding protein;
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【外文期刊】 Maragkakis, Manolis ; Alexiou, Panagiotis ; 等 《RNA》 2016年22卷1期 1-9页SCISCIEMEDLINE
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【外文期刊】 Oliver Rossbach ; Albrecht Bindereif ; 《Biological chemistry》 2014年395卷1期 51-60页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 alternative splicing;cross-linking and immunoprecipitation (CLIP);RNA sequencing (RNA-Seq);
- 概要:
- 方法:
- 结论:

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