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【中文期刊】 李高原 王妍然  等 《基础医学与临床》 2023年43卷5期 739-744页 ISTICCA

【摘要】 目的 对N-乙酰基转移酶10(NAT10)在人慢性髓原白血病细胞系K562中的RNA结合图谱进行描绘.方法 利用紫外交联免疫沉淀技术(eCLIP)捕获NAT10在K562细胞中结合的转录本集合,对其进行高通量测序,并对数据进行生物信息学分析...

【关键词】 N-乙酰基转移酶10； K562细胞； 紫外交联免疫沉淀测序技术(eCLIP-seq)；

【中文期刊】 李星桥  《科学与信息化》 2021年19期 177-178页

【摘要】 RNA作为遗传信息的传递者,具有调控基因表达,翻译蛋白质等功能.然而,越来越多的研究表明,RNA相互作用对RNA行使生物学功能起到重要作用.目前有许多基于高通量测序的方法应用于RNA相互作用研究,然而不同的实验方法之间可能存在偏好性,同时R...

【关键词】 高通量测序； RNA相互作用； RIC-seq；

【中文期刊】 刘飞燕  《科学与信息化》 2021年20期 191-192页

【摘要】 在真核生物的信使RNA(mRNA)上存在多种转录后修饰,N6-甲基腺苷(m6A)是其中最常见的一种,在细胞生命进程中都起着至关重要的作用.因此,多种方法被开发用于检测复杂生物样品中RNA上的m6A修饰.本文阐述了几种常见的m6A定性或定量检...

【关键词】 N6-甲基腺苷(m6A)； MeRIP-seq； MiCLIP；

【中文期刊】 Jianan Lin Zhengqing Ouyang  《定量生物学（英文版）》 2020年8卷2期 119-129页

【摘要】 Background: RNA binding proteins (RBPs) play essential roles in the regulation of RNA metabolism.Recent studies have dis...

【关键词】 RNA binding protein； CLIP-seq； RNA-seq；

【中文期刊】 《分子植物（英文版）》 2020年13卷2期 278-294页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Precursor mRNA (pre-mRNA) splicing is essential for gene expression in most eukaryotic organisms.Previous studies from m...

【关键词】 co-transcriptional splicing； CB-RNA-seq； eClip-seq；

【中文期刊】 《细胞研究（英文版）》 2015年25卷7期 864-876页 SCIMEDLINEISTICCSCDBP

【关键词】 HITS-CLIP/CLIP-seq； RNA-binding protein； alternative polyadenylation；

【外文期刊】 Ranjan,Batra ; Mini,Manchanda ; 等 《RNA biology》 2015年12卷6期 597-602页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 3′ UTR, 3′-untranslated region; APA, Alternative polyadenylation; AS, Alternative splicing;

【外文期刊】 Eric L,Van Nostrand ; Chelsea,Gelboin-Burkhart ; 等 《Methods (San Diego, Calif.)》 2017年118-119卷 50-59页 SCIMEDLINECABP

【关键词】 CLIP-seq; CRISPR/Cas9; Protein tagging;

【外文期刊】 Kaoru,Sato ; Ken-Ichi,Takayama ; 等 《Aging》 2023年15卷10期 3984-4011页 SCIMEDLINEBP

【关键词】 Alzheimer’s disease; G3BP; RNP granule;

【外文期刊】 Sanyue,Mai ; Xiuhua,Qu ; 等 《Biochimica et biophysica acta》 2016年1859卷8期 1014-24页 MEDLINE

【关键词】 Alternative splicing; CLIP-Seq; RBM39;