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【中文期刊】 Hui Wan Liang Chen 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2022年20卷5期 939-958页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Current cell-type annotation tools for single-cell RNA sequencing(scRNA-seq)data mainly utilize well-annotated source da...
【关键词】 Cell-type annotation；Transfer learning；Privacy preservation；
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【中文期刊】 孙熠伟 徐淑坦 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷6期 561-577页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)在揭示细胞异质性方面具有重要意义,但现有细胞类型注释方法存在着跨物种适应性、泛化性、类别不平衡等问题.本文提出了一种基于图注意力网络(graph a...
【关键词】 图注意力网络(GAT)；单细胞转录组测序(scRNA-seq)；细胞类型注释；
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【中文期刊】 袁佳欣 刘宏德 《生物信息学》 2025年23卷2期 96-110页ISTIC
【摘要】 细胞类型注释是单细胞RNA测序(scRNA-Seq)分析的基本任务.为了解决处理稀疏数据时出现的性能下降以及计算复杂度较高的问题,本文提出了一种基于深度学习模型Transformer的scRNA-seq数据的细胞类型识别和注释工具,scTr...
- 概要：
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【中文期刊】 Qianhui Huang Yu Liu 等 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2021年19卷2期 267-281页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Annotating cell types is a critical step in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data analysis.Some supervised or semi...
【关键词】 scRNA-seq；Cell type；Annotation；
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 李昶啸 黄璨 等 《中国医学科学杂志（英文版）》 2025年40卷1期 68-87,后插1页MEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 单细胞测序的最新进展彻底改变了细胞异质性的研究,特别是在血液系统中尤为明显.由于免疫细胞的复杂性,准确注释细胞类型仍然具有极大挑战.为了应对这一挑战,我们开发了泛血液单细胞数据注释工具(PAN-blood single-cell Da...
- 概要：
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【中文期刊】 Siyu Li Songming Tang 等 《Quantitative Biology》 2024年12卷1期 85-99页
【摘要】 Recent advances in single-cell chromatin accessibility sequencing (scCAS) technologies have resulted in new insights int...
【关键词】 cell type annotation；chromatin accessibility；novel type；
- 概要：
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【外文期刊】 Xu Jing ; Zhang Aidi ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷4期 SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Blampey Quentin ; Bercovici Nadège ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷5期 SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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【外文期刊】 Aaron J. Molstad ; Keshav Motwani ; 《Biometrics: Journal of the Biometric Society : An International Society Devoted to the Mathematical and Statistical Aspects of Biology》 2023年79卷4期 3485-3496页SCISCIEMEDLINE
【关键词】 categorical response regression;cell-type annotation;convex optimization multinomial logistic regression;
- 概要：
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【外文期刊】 Tian Lejin ; Xie Yunxiao ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2023年24卷5期 SCISCIEMEDLINE
- 概要：
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