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【中文期刊】 王立山 祝鹏飞  等 《生物信息学》 2014年4期 257-262页 ISTIC

【摘要】 采用生物信息学方法分析野生型p53乳腺癌MCF7细胞的ChIP-seq(染色质免疫共沉淀-测序)数据,以揭示p53的抑癌分子机制。从NCBI下载的编号为GSE47041的ChIP-seq数据来源于三组试验,分别为：未经处理的乳腺癌MCF7细...

【关键词】 野生型p53乳腺癌MCF7细胞； p53； ChIP-seq数据；

【中文期刊】 梁芳 徐柯  等 《生物化学与生物物理进展》 2013年40卷3期 216-227页 SCIISTICPKUCSCDCABP

【关键词】 ChIP-seq； 新一代测序技术； 基因调控；

【学位论文】 作者： 赵鹏飞 导师：刘芝华  北京协和医学院 中国医学科学院;清华大学医学部  生物学 细胞生物学（博士） 2023年

【摘要】 卵巢癌是一种常见的妇科恶性肿瘤，致死率一直高居不下。由于缺乏有效的筛查手段，超过70％的患者在确诊时已经进展到了晚期，5年生存率不足20％,易于复发转移和早期发病的隐匿性是导致卵巢癌预后不良的主要因素之一。近年来越来越多的研究揭示了lncR...

【关键词】 卵巢癌； 长链非编码RNA；

【学位论文】 作者： 赵茜玺 导师：高琳 豆增发  西安电子科技大学  计算机科学与技术 计算机技术（硕士） 2020年

【摘要】 研究染色质三维结构，对于理解基因表达调控机制具有重要意义，并且有助于细胞功能、生物发育、疾病发生等领域的研究。随着高通量染色质构象捕获技术(High-through chromosome conformation capture，Hi-C)...

【关键词】 三维基因组； 染色质拓扑关联域；

【学位论文】 作者： 李阳 导师：李国君 苏正昌  山东大学  数学 运筹学与控制论（博士） 2019年

【摘要】 生物技术尤其是高通量测序技术的发展使得人们能够更加方便地获取海量的生物数据。然而生物数据的爆炸式增长给人们带来无限发展机遇的同时，也使人们深切地体会到大数据信息挖掘带来的巨大挑战。在这种形势下，生物信息学等交叉学科应运而生，并在生命科学领域...

【关键词】 ChIP-seq数据； 顺式调控模体；

【学位论文】 作者： 贾瑶丽 导师：刘一  北京交通大学  计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2016年

【摘要】 随着生物信息学的大力发展，研究者们不断地在探究基因调控规律，而不能深入的理解转录调控规律已经成为研究调控网络的瓶颈。目前，转录因子结合位点识别问题已成为生物信息学的热点研究领域之一。转录因子作为一种重要的转录调控因子，在基因表达的过程中，通...

【关键词】 转录因子； 结合位点识别；

【学位论文】 作者： 王晶 导师：沈百荣  苏州大学  生物学 系统生物学（硕士） 2015年

【摘要】 下一代测序技术，尤其是ChIP-Seq技术的普及，产生了一系列大数据量、高复杂度的数据。而DNA模体的挖掘，是ChIP-Seq数据功能分析的一个很重要的模块。目前，已有大量的软件能够从Peak-Calling的数据中寻找出模体。但是我们对于...

【关键词】 下一代测序； ChIP-Seq技术；

【学位论文】 作者： 刘源 导师：霍红卫  西安电子科技大学  计算机科学与技术 计算机软件与理论（硕士） 2014年

【摘要】 模体发现是生物信息学领域中的重要问题,模体中蕴含着重要的遗传信息,在研究基因转录和调控机制方面有着重要的意义。通过计算类方法来寻找联合调控基因片段中包含的模体已经成为了一种普遍的模体发现方式,计算类的模体发现算法和工具目前已经超过了100种...

【关键词】 模体发现； 质心估计；

【学位论文】 作者： 秀花 导师：张利绒  内蒙古大学  物理学 物理学（硕士） 2013年

【摘要】 基因组表达调控是一个非常复杂的过程，除了DNA自身序列的调控作用外，还受到很多表观遗传修饰的调控作用。近年来，人们逐渐发现表观遗传学的重要性及其在医学领域上的应用。组蛋白修饰是表观遗传学研究的一个重要方面，具有重要的理论意义和应用前景，而关...

【关键词】 组蛋白修饰； 分布特性；

【学位论文】 作者： 孙娜 导师：韩敬东  中国科学院大学  生物学 发育生物学（硕士） 2013年

【摘要】 衰老，是所有生物体中最复杂保守的生物学过程之一。多年的研究证明，衰老是由遗传因子调控的，然而，近些年的研究也证明了表观遗传调控机制在衰老过程中发挥重要作用。我们利用染色质免疫沉淀测序技术，对人脑前额叶皮层样本进行了H3K27me3、H3K4...

【关键词】 衰老过程； 组蛋白修饰；