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【中文期刊】 李伟 朱明玉  等 《世界科学技术-中医药现代化》 2025年27卷1期 36-55页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 使用混合组装技术对采集的5种黄精属植物叶绿体基因组进行组装,利用比较基因组方法分析其种内及种间差异,探究其密码子使用模式及影响因素,并解析黄精属的系统发育关系.方法 本研究使用Unicycler软件混合组装5种黄精属植物的叶绿体基因组...

【关键词】 黄精属； 叶绿体基因组； 混合组装；

【中文期刊】 JIANG Jie Ying LIANG Dan  等 《生物医学与环境科学（英文版）》 2024年37卷3期 278-293页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Objective This study aimed to understand the epidemic status and phylogenetic relationships of rotavirus group A(RVA)in ...

【关键词】 Infectious diarrheal disease； Rotavirus； Phylogenetic analysis；

【中文期刊】 李志芳 陈丽玲  等 《广西植物》 2024年44卷9期 1732-1745页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为探究西南牡蒿(Artemisia parviflora)的叶绿体基因组结构特征及其系统位置,该研究利用高通量测序技术对其进行测序,并借助生物信息学工具进行分析.结果表明:(1)西南牡蒿叶绿体基因组长151 047 bp,呈现为由 4 部分...

【关键词】 西南牡蒿； 叶绿体基因组； 密码子使用偏性；

【中文期刊】 凌立贞 王琴  等 《六盘水师范学院学报》 2024年36卷6期 58-68页

【摘要】 为了揭示罂粟全基因组密码子使用的偏好性特征及其影响因素,以罂粟的全基因组蛋白质编码序列为研究对象,采用CodonW软件以及在线工具CUSP系统分析获得的68 828条蛋白质编码序列.研究结果显示:罂粟编码基因中的密码子平均GC含量为41.5...

【关键词】 罂粟； 基因组； 密码子偏好性；

【中文期刊】 戴开宇 杨治风  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 11-22页

【摘要】 [目的]探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素.[方法]综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使...

【关键词】 TLR5基因； 密码子使用偏好性； 碱基突变；

【中文期刊】 李鑫 李伟  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷4期 1349-1361页

【摘要】 [目的]明确乌苏里貉黑素皮质素受体3(melanocortin 3 receptor,MC3R)基因密码子使用偏好特征和影响因素,了解不同物种间遗传进化和密码子偏好性的关系,为开展MC3R基因异源高效表达研究提供理论依据.[方法]以乌苏里貉...

【关键词】 乌苏里貉； MC3R基因； 密码子偏好性；

【中文期刊】 赵渊祥 梁大曲  等 《广西植物》 2023年43卷10期 1921-1931页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 猴樟(Cinmamomum bodinieri)枝叶含有丰富的精油,是重要的园林绿化树种和经济树种,但目前有关猴樟基因组学的研究报道不多.为揭示猴樟叶绿体基因组特征及系统发育关系,该文基于高通量测序平台进行测序,从头组装了完整的猴樟叶绿体基...

【关键词】 猴樟； 叶绿体基因组； SSR；

【中文期刊】 李子菲 苏应娟  等 《热带亚热带植物学报》 2023年31卷4期 541-548页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 ycf94基因是近年来在叶绿体基因组中新发现的一个基因,在蕨类植物中表现高度保守.该研究共选取94种蕨类植物,在系统发育背景下,对ycf94基因的结构特征、密码子偏好性、进化速率和适应性进化进行分析.结果表明,ycf94基因的密码子偏好性较...

【关键词】 蕨类植物； ycf94； 密码子偏好性；

【中文期刊】 石乃星 谢平选  等 《热带亚热带植物学报》 2022年30卷3期 336-348页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 为探究滇黄精(Polygonatum kingianum)叶绿体全基因组特征和密码子使用偏性,利用第二代测序技术对滇黄精嫩叶进行测序,再经组装与注释后得到其叶绿体基因组全序列,通过MISA、EMBOSS和CodonW等软件对滇黄精叶绿体全基...

【关键词】 滇黄精； 叶绿体基因组； 密码子使用偏性；

【中文期刊】 雷佳欣 张丽娟  等 《西北林学院学报》 2023年38卷4期 104-110页

【摘要】 为解析文冠果基因组密码子的偏好性使用模式,提高基因异源表达效率,利用CodonW 1.4.4和Python程序对文冠果基因组21,294条编码序列的密码子进行中性绘图、ENC-plot、PR2-plot和对应性分析.结果表明,文冠果基因组密...

【关键词】 文冠果； 基因组； 密码子偏好性；