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【中文期刊】 柯自立 张小玄  等 《中国人兽共患病学报》 2024年40卷8期 708-715页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 了解福建省O1群霍乱弧菌人源株基因组特征,为深入开展霍乱分子流行病学研究提供依据.方法 收集2008-2022年福建省霍乱病例和带菌者来源O1群霍乱弧菌16株,肉汤稀释法检测抗生素最小抑菌浓度(MIC).运用二代测序技术得到全基因组序...

【关键词】 霍乱弧菌； 全基因组测序； 生物信息学分析；

【中文期刊】 李珂 王宇龙  等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷9期 3595-3604页

【摘要】 泛基因组是近些年来基因组研究领域出现的一个新名词,相较于单个线性参考基因组具有明显优势,能够有效解决参考基因组涵盖遗传信息有限的问题.随着测序技术的发展和对基因组的深入研究,泛基因组学相关研究也得到快速发展.本文综述了泛基因组学的发展历程、...

【关键词】 畜禽； 泛基因组； 核心基因；

【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文版）》 2015年1期 73-76页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

【摘要】 Since the proposal for pangenomic study, there have been a dozen software tools actively in use for pangenomic analysis....

【关键词】 Pangenomics； Pangenome； Comparative analysis；

【中文期刊】 邱仁宗  《医学与哲学》 2018年39卷1期 1-6页 ISTICPKU

【摘要】 首先澄清我国网站上发表的两篇有关精准医学博文中事实上的错误和概念上的混淆.接着讨论了对精准医学提出的批评及对这些批评的分析.指出精准医学术语本身容易引起误解和引起人们过高的期望;对精准医学的论述和实施中存在基因决定论倾向,即过分夸大基因在健...

【关键词】 精准医学； 个体化医学； 基因组；

【中文期刊】 汪皓秋 俞骅  等 《中华微生物学和免疫学杂志》 2018年38卷2期 116-123页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 目的 了解近年来杭州地区甲型副伤寒沙门菌的基因组流行病学特征.方法 采用二代测序技术(NGS)对2002—2013年杭州地区分离的60株甲型副伤寒沙门菌代表株进行测序并下载公共数据库中的391株甲型副伤寒沙门菌基因组数据.以ATCC9150...

【关键词】 甲型副伤寒沙门菌； 二代测序； 单核苷酸多态性；

【中文期刊】 陈重 郑金鑫  等 《中国感染控制杂志》 2016年1期 1-9页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的：分析肠致病性大肠埃希菌（EPEC）致病岛（PAIs）基因进化特点。方法 EPEC Deng 分离自我国婴幼儿腹泻患者粪便标本，鉴定该菌株血清型并进行药敏试验；采用 Illumina 2000仪器对菌株进行全基因序列测序，PHAST 软...

【关键词】 肠致病性大肠埃希菌； 高通量测序； 全基因组序列；

【中文期刊】 刘东立 陈雅丽  等 《疾病监测》 2024年39卷7期 945-950页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 对2022年陕西省城固县1起霍乱疫情调查溯源.方法 对病例进行个案调查,对现场环境进行卫生学调查,收集当地气温及降水资料.采集病例、同餐人员及同期腹泻患者粪便或肛拭子样本,采集剩余食品、环境水体、水产品样本,进行霍乱弧菌核酸检测及分离...

【关键词】 霍乱弧菌； O139血清群； 核心基因组多位点序列分析；

【中文期刊】 王利 任红宇  等 《疾病监测》 2024年39卷4期 505-510页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 探讨安徽省马鞍山市公共洗浴场所淋浴水中嗜肺军团菌的污染状况及分布,分析分离菌株全基因组信息及毒力基因和耐药基因预测情况,为军团菌病防控提供数据支撑.方法 2020-2021年,从马鞍山市区3个行政区内49家公共洗浴场所采集216份淋浴...

【关键词】 嗜肺军团菌； 全基因组测序； 毒力基因；

【中文期刊】 冯莉 宗华  等 《中国国境卫生检疫杂志》 2024年47卷2期 205-210页 ISTICCA

【摘要】 目的 了解重庆市南岸区临床和食品来源空肠弯曲菌的耐药特征及其分子流行特征并进行溯源分析,为该地区空肠弯曲菌感染的精准防控提供科学依据.方法 对2021-2022年在重庆市南岸区6家哨点医院就诊的336例腹泻患者粪便样本和国家食品安全风险监测...

【关键词】 空肠弯曲菌； 多重耐药； PFGE；

【中文期刊】 李振鑫 杨苑轲  等 《热带医学杂志》 2024年24卷10期 1379-1383,后插1页 ISTICCA

【摘要】 目的 分析包头市布鲁菌的分子流行病学特征,为控制人间布鲁菌病提供科学依据.方法 11株布鲁菌来源于包头市2012-2022年布鲁菌病患者血液培养物.采用多位点序列分型(MLST)技术分析菌株序列型,采用核心基因组单核苷酸多态性(cgSNP)...

【关键词】 布鲁菌； 多位点序列分型； 核心基因组单核苷酸多态性；