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【中文期刊】 龚道雄 阮晓钢 《中国生物医学工程学报》 2004年23卷1期 73-78页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 提出了一种基于遗传算法和模拟退火算法的DNA多序列比对算法.针对多序列比对的具体特点,指出交叉操作是导致比对计算复杂度提高的原因之一,因而在本研究所提出的多序列比对算法中,取消了遗传算法中通常采用的交叉操作算子,设计了适合多序列比对特点的插...
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【中文期刊】 景军 何瑶 等 《北京生物医学工程》 2007年26卷4期 377-380页ISTIC
【摘要】 免疫算法(IA)是一种新的基于生物免疫系统的寻优算法.虽然以往的免疫算法有许多优良的计算特性,但在DNA多序列比对(MSA)中已知的免疫算法模型仍有许多不足.本文对已有的免疫算法通过加入免疫算子等进行改进,在保证群体的多样性性能的同时,加入...
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【中文期刊】 李光 王亚东 等 《生物信息学》 2007年5卷2期 78-81页ISTIC
【摘要】 DNALA是一种个人DNA数据隐私保护的方法.该方法能有效的实现对个人DNA数据的隐私保护,但前期数据预处理复杂,而且后期处理精度不高.本文针对DNALA的这些缺点进行改进,形成了Savior算法.Savior算法在数据预处理阶段用双序列比...
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【中文期刊】 杜世平 李海 《四川教育学院学报》 2004年20卷9期 90-92页
【摘要】 目前已获得了大量的生物序列和结构数据,传统研究生物序列的方法已面临挑战,生物学家已经转向能够处理大量数据的统计方法来研究.隐马尔可夫模型(HMM)是一个能够通过可观察的数据很好地捕捉真实空间统计性质的随机模型,该模型用于生物序列分析是生物信...
- 概要：
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【中文期刊】 林俊杰 郑琳琳 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷4期 719-728页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 多重PCR甲基化靶向测序数据尚缺乏针对性的比对软件.本研究评估了9种比对方案在处理多重PCR甲基化靶向测序数据时的性能,包括平均CPU运行时间、平均最大内存、平均比对率、F1分数、平均比对速率、比对未通过率和差异甲基化位点,以及比对率受亚硫...
【关键词】 DNA甲基化；多重PCR甲基化靶向测序；比对方案；
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【中文期刊】 张文娟 魏锋 等 《药物分析杂志》 2020年40卷4期 659-663页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:比较松贝与新出现伪品的不同特征,为鉴别检验提供依据.方法:综合性状、聚合酶链式反应一限制性内切酶多样性(PCR-RFLP)法、DNA序列比对、系统进化树以及遗传距离等方法,寻找松贝与新伪品的鉴别要点.结果:该贝母在性状上与松贝正品还是...
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【中文期刊】 刘世才 柴晓杰 等 《实验室检测》 2025年3卷13期 100-102页
【摘要】 目的 探讨中间段向 5'端延长的方法在cDNA末端快速扩增技术(RACE)中的应用.方法 通过多序列比对找到目的基因保守区,利用保守区设计兼并引物,通过实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出中间段;根据得到的中间序列设计巢式引物,...
【关键词】 淀粉磷酸化酶基因；中间段延长；cDNA末端快速扩增技术；
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【学位论文】 作者：郭振亚 导师：吉国力 厦门大学 系统科学 系统工程（硕士） 2009年
【摘要】 本文针对生物DNA多序列比对问题，提出了基于LZ算法的渐进式多序列比对方法-LZ_MSA，其空间向量是采用10种复制方式进行构造，使得多序列比对方法LZ_MSA中的两两比对时间复杂度为D(N log N)。该方法特点是：序列比对转为向量比对...
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【中文期刊】 王彩云 侯俊 等 《微生物学杂志》 2024年44卷3期 49-59页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为研究贵州天麻主产区蜜环菌的生物种及其遗传多样性,在贵州天麻主产区采集蜜环菌样本,利用双抗培养基分离菌索或子实体、菌材,定期观察并统计蜜环菌母种及原种的生物学特性;挑取菌索提取总DNA,利用真菌通用引物 ITS和延伸因子 EF1-α基因扩增...
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【中文期刊】 刘心雨 姜丹 等 《中国现代中药》 2024年26卷1期 10-17页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的:基于内转录间隔区(ITS)序列,运用DNA条形码技术对滇鸡血藤药材及其混伪品进行序列比对分析,根据单核苷酸多态性位点构建滇鸡血藤单倍型数据库,建立快速、准确鉴定滇鸡血藤的分子鉴定方法.方法:以滇鸡血藤及其混伪品为材料,利用DNA提取试...
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