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【中文期刊】 周家锐 纪震 等 《电子学报》 2013年41卷3期 513-518页
【摘要】 提出近似重复矢量(Approximate Repeat Vector,ARV)模型用于DNA序列冗余片段的描述.通过将数据生物信息学特征引入压缩预处理,并使用ARV矢量构造编码码本,提出了非对称DNA序列压缩算法BioLZMA-2.算法引入...
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【学位论文】 作者:胡苗苗导师:蔡骅 南京理工大学 控制科学与工程 控制理论与控制工程(硕士) 2012年
【摘要】 自20世纪末以来,生物测序技术不断的发展,随之产生的各类生物数据,迅速形成了庞大的生物信息数据库。如何有效的分析,管理这些海量的数据,是生物学家和计算机专家们必须着力解决的棘手问题。数据压缩技术是解决这一问题的有效方法。DNA序列数据是一类...
- 概要:
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【学位论文】 作者:陈祥祥导师:王长缨 福建农林大学 生物工程 生物信息科学与技术(硕士) 2012年
【摘要】 随着生物测序技术的发展,生物序列数据迅速增长,数据占用的存储空间加速增加.如何利用有限的存储空间存储更多的生物序列数据成为必须面临的问题.对于DNA序列数据,可使用数据压缩方法解决大量DNA序列数据的存储问题.本文在研究传统压缩算法和现有的...
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【学位论文】 作者:林毅申导师:林丕源 华南农业大学 管理科学与工程 管理科学与工程(硕士) 2005年
【摘要】 在研究现有的DNA序列数据压缩算法的基础上,本文以DNA序列数据的存储效率与直接检索速度综合考虑,设计并实现了称为DNACS(DNACompressionandSearch)的算法。它包括了DNA数据压缩(含解压缩)算法和非解压直接检索.....
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【中文期刊】 纪震 周家锐 等 《电子学报》 2011年39卷5期 991-995页
【摘要】 本文通过将生物学特征和生物学含义引入DNA序列数据的压缩处理中,提出了基于生物信息学特征的BioLZMA压缩算法.在BioLZMA算法中,DNA序列根据组成部分生物学含义的不同切分重组为四个集合:编码序列CDS集合、内含子序列集合、RNA序...
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