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          【中文期刊】 朱泽轩 张永朋  等 《深圳大学学报(理工版)》 2013年30卷4期 409-415页

          【摘要】 针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序...

          【关键词】 计算机应用DNA测序下一代测序

          浏览:0 被引:6 下载:0

          【中文期刊】 纪震 周家锐  等 《电子学报》 2011年39卷5期 991-995页

          【摘要】 本文通过将生物学特征和生物学含义引入DNA序列数据的压缩处理中,提出了基于生物信息学特征的BioLZMA压缩算法.在BioLZMA算法中,DNA序列根据组成部分生物学含义的不同切分重组为四个集合:编码序列CDS集合、内含子序列集合、RNA序...

          【关键词】 DNA数据压缩生物信息学序列重组

          浏览:1 被引:24 下载:0

          【学位论文】 作者: 彭棋 导师:申铁  贵州师范大学  计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2021年

          【摘要】 茶作为世界上三大类饮料(咖啡、茶、可可)之一,其具有多种对人体健康的有益成分,因而有防癌、降血脂、抗衰老等功效,具有优越的经济和社会价值。同时茶产业是贵州省十二大特色农业产业之一。因此,从科学角度,特别是从基因科学角度对贵州茶树资源进行深入...

          【关键词】 茶组植物基因数据压缩

          浏览:0 被引:0 下载:0

          【学位论文】 作者: 张义军 导师:陈国良 罗秋明  深圳大学  计算机科学与技术 计算机科学与技术(硕士) 2017年

          【摘要】 随着基因测序费用的降低以及精准医疗和基因深度学习等新兴技术对基因大数据的需要,目前已进入一个基因数据爆发的时代.面对如此海量的基因数据,如何存储和传输这些数据成为当前研究的一个热点,基于参考基因组的压缩算法以其压缩率高的特点被广泛应用于各大...

          【关键词】 基于参考基因组压缩DNA数据压缩

          LinkOut
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          【学位论文】 作者: 郑华杰 导师:张佩珩  中国科学院大学  计算机科学与技术 计算机技术(硕士) 2015年

          【摘要】 随着高通量测序技术的发展,DNA序列数据量呈现爆炸式增长。这会带来两方面的严重问题,即数据存储和管理的成本越来越高,数据传输和数据分析消耗的时间越来越长。数据压缩技术在一定程度上能够有效地缓解数据的高速增长,然而面对日益增长的海量DNA序列...

          【关键词】 DNA序列数据压缩

          原文传递
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          【学位论文】 作者: 陈祥祥 导师:王长缨  福建农林大学  生物工程 生物信息科学与技术(硕士) 2012年

          【摘要】 随着生物测序技术的发展,生物序列数据迅速增长,数据占用的存储空间加速增加.如何利用有限的存储空间存储更多的生物序列数据成为必须面临的问题.对于DNA序列数据,可使用数据压缩方法解决大量DNA序列数据的存储问题.本文在研究传统压缩算法和现有的...

          【关键词】 数据压缩DNA序列数据

          LinkOut
          浏览:0 被引:0 下载:0

          【学位论文】 作者: 胡苗苗 导师:蔡骅  南京理工大学  控制科学与工程 控制理论与控制工程(硕士) 2012年

          【摘要】 自20世纪末以来,生物测序技术不断的发展,随之产生的各类生物数据,迅速形成了庞大的生物信息数据库。如何有效的分析,管理这些海量的数据,是生物学家和计算机专家们必须着力解决的棘手问题。数据压缩技术是解决这一问题的有效方法。DNA序列数据是一类...

          【关键词】 DNA序列数据数据压缩算法

          浏览:0 被引:2 下载:0

          【学位论文】 作者: 林毅申 导师:林丕源  华南农业大学  管理科学与工程 管理科学与工程(硕士) 2005年

          【摘要】 在研究现有的DNA序列数据压缩算法的基础上,本文以DNA序列数据的存储效率与直接检索速度综合考虑,设计并实现了称为DNACS(DNACompressionandSearch)的算法。它包括了DNA数据压缩(含解压缩)算法和非解压直接检索.....

          【关键词】 数据压缩模式匹配

          原文传递
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          【学位论文】 作者: 陈新 导师:石青云  北京大学  数学 应用数学(博士) 2001年

          【摘要】 DNA序列的数据压缩是一项非常艰苦且极具挑战性的任务.它对基因序列的数据储存、DNA的序列分析以及研究基因组的进化关系等方面都有着非常重要的意义.基于颜色信息的渐进编码是一种新的高效率的伪彩色图像压缩方式.它可以适合于那些需要快速浏览和渐进...

          【关键词】 生物信息学DNA序列

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