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【中文期刊】 郭峰 王晨宇  等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷3期 215-222页 ISTICCA

【摘要】 目的 采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期 mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因...

【关键词】 分子生物学； 生物信息学； 表观遗传学；

【中文期刊】 张舟 黄碧  等 《岭南现代临床外科》 2025年25卷1期 12-18页

【摘要】 目的 本研究旨在通过比较不完全射频消融(IRFA)处理肝细胞癌(HCC)患者与HCC的基因表达谱,识别与IRFA处理HCC相关的差异表达基因,并提供潜在治疗靶点.方法 从GEO数据库中下载GSE212604数据集,根据是否接受IRFA治疗分...

【关键词】 肝细胞癌； 不完全射频消融； 差异表达基因；

【中文期刊】 张桢淳 李永唯  等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页 ISTICCA

【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...

【关键词】 心肌梗死； 心功能衰竭； 生物信息学；

【中文期刊】 修占杰 刘佳玙  等 《天津医科大学学报》 2024年30卷6期 535-542页 ISTIC

【摘要】 目的:基于强直性脊柱炎(AS)基因芯片数据,应用生物信息学分析方法识别免疫细胞亚型相关的关键基因及药物靶点预测.方法:GEO数据库下载AS基因表达数据,筛选差异表达基因(DEGs);运用R软件包进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全...

【关键词】 强直性脊柱炎； 差异表达基因； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 李威材 秦刚  等 《实用肿瘤杂志》 2024年39卷4期 344-355页 ISTICCA

【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选出与骨肉瘤(osteosarcoma,OS)相关的关键基因,以作为OS的潜在诊断标志物和新治疗靶点.方法 从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中检索下载 2 个符合本研究...

【关键词】 骨肉瘤； 生物信息学； 差异表达基因；

【中文期刊】 舒佳玉 王欢  等 《现代肿瘤医学》 2024年32卷19期 3636-3642页 ISTICCA

【摘要】 目的:筛选口腔鳞状细胞癌(OSCC)中铁死亡相关新型生物标志物,并分析免疫细胞浸润情况.方法:从GEO数据库中下载OSCC数据集.利用R软件筛选差异表达基因(DEGs)并进行功能和通路富集分析,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)探究基...

【关键词】 口腔鳞状细胞癌； 铁死亡； 差异表达基因；

【中文期刊】 申杨 段子博  等 《天津医科大学学报》 2024年30卷5期 391-398页 ISTIC

【摘要】 目的:利用生物信息学方法筛选外阴鳞状细胞癌(VSCC)的关键基因及分析免疫浸润特征.方法:从GEO数据库中下载VSCC相关基因表达数据,应用差异表达基因(DEGs)分析和加权基因共表达网络分析筛选出共同的DEGs,对DEGs进行富集分析.采...

【关键词】 外阴鳞状细胞癌； 加权基因共表达网络分析； 差异表达基因；

【中文期刊】 杨新瑞 刘艳华  等 《包头医学院学报》 2024年40卷1期 30-35页 CA

【摘要】 目的:通过生物信息学的方法挖掘帕金森病(Parkinson's disease,PD)的关键基因,为PD提供新的诊断标志物及免疫细胞浸润特征.方法:从高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库下载合并GS...

【关键词】 帕金森病； 加权共表达网络分析； 差异表达基因；

【中文期刊】 朱虹颖 王建波  《介入放射学杂志》 2023年32卷9期 875-880页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 从分子水平探索支架内再狭窄(ISR)的关键基因,以及ISR的发病机制.方法 通过基因表达综合(GEO)公共数据库获取GSE46560数据集,利用R语言的limma包分析获得ISR组与对照之间的差异表达基因(DEG),并对外周血的微阵列...

【关键词】 支架内再狭窄； 经皮腔内血管成形术； 差异表达基因；

【中文期刊】 黄子葵 李斐  等 《中国医学科学院学报》 2023年45卷4期 597-607页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 基于系统生物信息学分析鼻咽癌样本基因芯片数据,筛选鼻咽癌的潜在预测基因,并对其进行实验验证.方法 通过基因表达综合数据库筛选鼻咽癌数据集,通过limma包进行差异分析,加权基因共表达网络包进行加权基因共表达网络分析,绘制韦恩图寻找共同...

【关键词】 鼻咽癌； 生物信息学分析； 基因表达综合数据库；