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【中文期刊】 李坤泽 宋宇轩  等 《昆虫学报》 2024年67卷3期 346-357页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]将已获得的中华蜜蜂Apis cerana cerana转录组纳米孔长读段数据比对到东方蜜蜂A.cerana参考基因组,进行注释基因的结构优化,鉴定未注释的新基因和新转录本并进行功能注释以及预测其SSR位点、完整ORF和转录因子(tr...

【关键词】 东方蜜蜂； 中华蜜蜂； 第三代测序技术；

【中文期刊】 路新利 刘勇  等 《检验医学》 2023年38卷11期 1015-1019页 ISTICCA

【摘要】 目的 对3条人类免疫缺陷病毒(HIV)-1亚型不确定的近似全长基因组序列(NFLG)进行基因镶嵌结构分析.方法 用近末端稀释法、系统发育树和基因重组断点分析等方法对3例男男同性恋(MSM)HIV-1感染病例进行HIV-1 NFLG扩增、基因...

【关键词】 人类免疫缺陷病毒； 二代重组基因； 系统发育树；

【中文期刊】 秦双双 韦桂丽  等 《中国现代中药》 2023年25卷7期 1441-1450页 ISTICCA

【摘要】 目的:获得广金钱草Desmodium styracifolium(Osb.)Merr.全长转录组数据,深入挖掘其功能基因.方法:采用PacBio Sequel测序平台,对广金钱草的根、茎、叶 3 个部位混合样品进行全长转录组测序及分析.结果...

【关键词】 广金钱草； 全长转录组； 基因注释；

【中文期刊】 李莹 雷煜宇  等 《昆虫学报》 2021年64卷11期 1244-1251页 ISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 [目的]优化柞蚕Antheraea pernyi基因组注释,更好地扩展其在比较基因组学及品种改良研究中的应用.[方法]对柞蚕进行全长转录组测序分析;经全长转录本与参考基因组比对,鉴定新基因及新转录本,并对这些新基因和新转录本进行功能注释及长...

【关键词】 柞蚕； 基因组注释； 全长转录组；

【中文期刊】 王敏 韦庆娟  等 《中华预防医学杂志》 2018年52卷2期 185-187页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 肠道病毒属于小RNA病毒科(picornaviridae)、肠道病毒属(enterovirus,EV).基于肠道病毒衣壳蛋白VP1序列,将人EV分为4个组:HEV-A、HEV-B、HEV-C和HEV-D,其中HEV-B包括所有的ECHO病毒...

【关键词】 手足口病； 序列分析； 柯萨奇B组5型病毒；

【中文期刊】 胡挺松 张海林  等 《中国人兽共患病学报》 2017年33卷6期 473-480页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 阐明云南省中缅边境地区2013-2015年14株登革1型病毒(DENV-1)全基因组序列特征.方法 采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-1的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生物...

【关键词】 登革1型病毒； 全基因组； 系统进化分析；

【中文期刊】 胡挺松 张海林  等 《中国人兽共患病学报》 2017年33卷10期 859-867,881页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 阐明云南省2015年5株登革4型病毒(DENV-4)流行株的全基因组序列特征及分子流行病学特点.方法 采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-4的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生...

【关键词】 登革4型病毒； 全基因组； 系统进化分析；

【中文期刊】 常洪涛 刘慧敏  等 《中国人兽共患病学报》 2014年8期 793-796页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的：分离家养野猪脑心肌炎病毒（Encephalomyocarditis virus ，EMCV），作全基因组序列测定及与相关物种同源性比较。方法用改进的“细胞接种与RT-PCR方法相结合”技术，成功分离到国内首株家养野猪EMCV JZ12...

【关键词】 脑心肌炎病毒； 家养野猪； RT-PCR；

【中文期刊】 冯云 李灿委  等 《中国人兽共患病学报》 2013年29卷9期 829-835页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 分析中国首次分离的基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒(JEV)全基因组的基因组特征.方法 设计JEV全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片断,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因组序列.采用生物学软件进行同源性和系统进化分析.结果 1977和1...

【关键词】 流行性乙型脑炎病毒； 基因Ⅰ型； 全基因组；

【中文期刊】 雷永良 王晓光  等 《中华流行病学杂志》 2009年30卷8期 824-828页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的 测定浙江省分离的2株野生动物鼬獾狂犬病毒株全基因组序列,从分子水平进行遗传变异特征分析,了解狂犬病毒在浙江省的流行和变异情况.方法 RT-PCR测定鼬獾狂犬病毒株全基因组核苷酸序列,并进行基因序列和编码蛋白相似性比较及种系发生分析.结...

【关键词】 狂犬病毒； 鼬獾； 全基因组；